More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4892 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4892  histone deacetylase superfamily protein  100 
 
 		 305 aa  603  1.0000000000000001e-171  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3551  histone deacetylase superfamily  51.17 
 
 		 305 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2562  Histone deacetylase  51.17 
 
 		 305 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.432751 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3192  histone deacetylase superfamily protein  53.02 
 
 		 305 aa  319  3.9999999999999996e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00911775  hitchhiker  0.000717233 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2706  histone deacetylase superfamily  52.54 
 
 		 305 aa  314  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000210159  unclonable  0.000000000120446 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1827  histone deacetylase superfamily protein  51.18 
 
 		 303 aa  313  1.9999999999999998e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6387  histone deacetylase superfamily protein  56.27 
 
 		 298 aa  312  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.006244  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1532  histone deacetylase superfamily  51.01 
 
 		 304 aa  312  3.9999999999999997e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1393  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein-like  51.51 
 
 		 304 aa  311  6.999999999999999e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.194758  normal  0.700999 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0686  histone deacetylase superfamily  55.56 
 
 		 294 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.611894 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0050  histone deacetylase superfamily protein  55.67 
 
 		 306 aa  298  9e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0204903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0713  histone deacetylase superfamily protein  55.22 
 
 		 308 aa  296  3e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal  0.260718 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10030  histone deacetylase superfamily  51.96 
 
 		 316 aa  293  2e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0971633  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0726  histone deacetylase superfamily  55.48 
 
 		 297 aa  293  3e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6780  histone deacetylase superfamily  55.82 
 
 		 298 aa  287  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4295  histone deacetylase superfamily protein  48.66 
 
 		 305 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.331272  normal  0.7959 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4918  histone deacetylase superfamily protein  48.16 
 
 		 306 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000273279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4639  histone deacetylase superfamily protein  49.17 
 
 		 317 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000315852  hitchhiker  0.00689363 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1459  putative histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  50.84 
 
 		 305 aa  282  4.0000000000000003e-75  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4777  histone deacetylase superfamily protein  49.49 
 
 		 304 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000599986  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4764  histone deacetylase superfamily  49.15 
 
 		 304 aa  281  7.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.0000188722  decreased coverage  0.000868257 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0656  histone deacetylase superfamily protein  48.49 
 
 		 304 aa  280  1e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.000000000855576  normal  0.416487 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4662  histone deacetylase family protein  48.32 
 
 		 305 aa  276  3e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1764  putative histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  50 
 
 		 316 aa  273  3e-72  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0823367 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3722  histone deacetylase superfamily protein  49.16 
 
 		 306 aa  273  3e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04120  Histone deacetylase superfamily protein  45.61 
 
 		 299 aa  273  3e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0413564  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3915  histone deacetylase superfamily protein  51.23 
 
 		 315 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2905  histone deacetylase superfamily protein  40.79 
 
 		 308 aa  264  1e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.681424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2483  Histone deacetylase  44.18 
 
 		 300 aa  261  1e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.557385  normal  0.140117 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0323  deacetylase  44.56 
 
 		 300 aa  255  6e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3373  histone deacetylase family protein  42.18 
 
 		 300 aa  254  1.0000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0543734  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40681  predicted protein  47.49 
 
 		 323 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000252385  normal  0.188986 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1507  hypothetical protein  51.8 
 
 		 324 aa  253  3e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.0000688301  normal  0.246857 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1601  histone deacetylase superfamily  48.25 
 
 		 299 aa  251  1e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6866  histone deacetylase superfamily  43.19 
 
 		 299 aa  251  1e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.859971  normal  0.144342 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2043  Histone deacetylase  45.45 
 
 		 299 aa  248  1e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0169314  hitchhiker  0.0046378 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1245  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  41.14 
 
 		 305 aa  247  2e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118499 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2162  histone deacetylase superfamily protein  41.61 
 
 		 302 aa  243  3e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2116  histone deacetylase superfamily protein  42.52 
 
 		 305 aa  243  3e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1152  histone deacetylase superfamily protein  47.48 
 
 		 301 aa  243  3e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0905584  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1162  histone deacetylase superfamily protein  43.39 
 
 		 306 aa  242  7e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2066  deacetylase  46.49 
 
 		 299 aa  240  2e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.288592  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1815  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  40.74 
 
 		 304 aa  239  4e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2377  histone deacetylase superfamily protein  44.76 
 
 		 300 aa  238  8e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.018  normal  0.544894 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2542  histone deacetylase superfamily protein  40.74 
 
 		 300 aa  238  9e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205391 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002921  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  40.4 
 
 		 307 aa  238  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2474  histone deacetylase superfamily protein  41.08 
 
 		 300 aa  238  1e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188397 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2634  histone deacetylase superfamily protein  41.41 
 
 		 300 aa  237  2e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00803062 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03035  hypothetical protein  40.26 
 
 		 307 aa  236  4e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1201  histone deacetylase superfamily protein  47.06 
 
 		 323 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000329608  normal  0.582651 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3030  Histone deacetylase  47.4 
 
 		 299 aa  233  4.0000000000000004e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.894119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2487  histone deacetylase superfamily protein  40.14 
 
 		 300 aa  232  6e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.60651  normal  0.017573 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1529  histone deacetylase superfamily protein  43.31 
 
 		 299 aa  231  9e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.188503  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1991  histone deacetylase superfamily protein  46.64 
 
 		 318 aa  230  3e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000158404 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3087  histone deacetylase superfamily protein  47.02 
 
 		 337 aa  230  3e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000151146  normal  0.0282587 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40492  predicted protein  44.71 
 
 		 350 aa  229  4e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0423597 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1768  Histone deacetylase  47.25 
 
 		 311 aa  229  5e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.70732  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1941  histone deacetylase superfamily  45.12 
 
 		 334 aa  227  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00172119  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1613  histone deacetylase superfamily  45.31 
 
 		 335 aa  226  4e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000964161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1613  histone deacetylase superfamily protein  48.32 
 
 		 333 aa  226  4e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000152208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1614  histone deacetylase superfamily protein  38.51 
 
 		 302 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1648  histone deacetylase superfamily protein  38.51 
 
 		 302 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.265493 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2634  histone deacetylase superfamily protein  39.53 
 
 		 307 aa  225  8e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2729  histone deacetylase superfamily  38.51 
 
 		 302 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00182123 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1606  hypothetical protein  46.85 
 
 		 323 aa  224  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000378797  normal  0.732235 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1393  histone deacetylase superfamily  42.5 
 
 		 299 aa  224  2e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1625  histone deacetylase superfamily protein  38.51 
 
 		 302 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2469  Histone deacetylase  49.45 
 
 		 305 aa  222  6e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0998  hypothetical protein  36.58 
 
 		 300 aa  221  9.999999999999999e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3900  histone deacetylase superfamily protein  37.46 
 
 		 305 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0191811 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1629  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  39.74 
 
 		 306 aa  219  3.9999999999999997e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111374  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3500  Histone deacetylase  43.06 
 
 		 311 aa  218  1e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3448  histone deacetylase superfamily protein  42.03 
 
 		 297 aa  216  4e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.509704 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1584  histone deacetylase superfamily protein  39.8 
 
 		 298 aa  216  5e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2660  histone deacetylase superfamily protein  36.33 
 
 		 304 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02968  histone deacetylase family protein  47.51 
 
 		 224 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.510136  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2789  histone deacetylase superfamily protein  41.55 
 
 		 298 aa  209  4e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_4821  predicted protein  37.96 
 
 		 324 aa  198  7.999999999999999e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2506  histone deacetylase superfamily  43.06 
 
 		 296 aa  198  9e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3902  histone deacetylase superfamily protein  36.36 
 
 		 357 aa  193  3e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000251706  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9278  predicted protein  39.53 
 
 		 294 aa  190  2e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1420  histone deacetylase superfamily protein  40.21 
 
 		 306 aa  176  5e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0496164 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0535  Histone deacetylase  36.65 
 
 		 387 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5005  Histone deacetylase  35.86 
 
 		 396 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.983537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  34.88 
 
 		 306 aa  115  7.999999999999999e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1831  hypothetical protein  50 
 
 		 133 aa  114  3e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.330593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  32.84 
 
 		 344 aa  113  5e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3565  Histone deacetylase  34.8 
 
 		 393 aa  112  6e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0963  Histone deacetylase  32.34 
 
 		 378 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.469516  normal  0.273215 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0936  histone deacetylase superfamily protein  36.06 
 
 		 316 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3345  histone deacetylase superfamily protein  34.36 
 
 		 407 aa  108  9.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1425  histone deacetylase superfamily protein  33.21 
 
 		 370 aa  108  1e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3143  histone deacetylase superfamily  32.48 
 
 		 403 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.170732 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0507  histone deacetylase superfamily  35.6 
 
 		 395 aa  107  3e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0375455 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0533  histone deacetylase superfamily protein  33.07 
 
 		 348 aa  107  3e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.072372 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0611  histone deacetylase superfamily  34.06 
 
 		 394 aa  106  5e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.571257  normal  0.0511061 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1461  histone deacetylase superfamily protein  36.29 
 
 		 393 aa  105  7e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111852  normal  0.224977 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1012  Histone deacetylase  29.3 
 
 		 351 aa  105  1e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0856  histone deacetylase superfamily  27.8 
 
 		 309 aa  105  1e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0895485  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2707  putative acetoin utilization protein  33.08 
 
 		 392 aa  103  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>