More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2469 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2469  Histone deacetylase  100 
 
 		 305 aa  605  9.999999999999999e-173  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2377  histone deacetylase superfamily protein  62.37 
 
 		 300 aa  370  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.018  normal  0.544894 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1601  histone deacetylase superfamily  62.88 
 
 		 299 aa  355  5.999999999999999e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3448  histone deacetylase superfamily protein  57.28 
 
 		 297 aa  334  1e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.509704 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1584  histone deacetylase superfamily protein  58.31 
 
 		 298 aa  333  3e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1201  histone deacetylase superfamily protein  59.14 
 
 		 323 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000329608  normal  0.582651 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1529  histone deacetylase superfamily protein  56.19 
 
 		 299 aa  326  3e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.188503  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1152  histone deacetylase superfamily protein  57.62 
 
 		 301 aa  324  1e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0905584  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1507  hypothetical protein  59.67 
 
 		 324 aa  318  6e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.0000688301  normal  0.246857 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1941  histone deacetylase superfamily  57.23 
 
 		 334 aa  317  2e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00172119  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1613  histone deacetylase superfamily  57.61 
 
 		 335 aa  316  4e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000964161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1393  histone deacetylase superfamily  53.49 
 
 		 299 aa  310  1e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1768  Histone deacetylase  55.96 
 
 		 311 aa  311  1e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.70732  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1606  hypothetical protein  57.81 
 
 		 323 aa  309  4e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000378797  normal  0.732235 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2066  deacetylase  50.5 
 
 		 299 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.288592  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3087  histone deacetylase superfamily protein  54.43 
 
 		 337 aa  302  5.000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000151146  normal  0.0282587 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3500  Histone deacetylase  51.14 
 
 		 311 aa  301  1e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1613  histone deacetylase superfamily protein  55.34 
 
 		 333 aa  301  1e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000152208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1991  histone deacetylase superfamily protein  54.13 
 
 		 318 aa  298  7e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000158404 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2789  histone deacetylase superfamily protein  48.17 
 
 		 298 aa  272  6e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2116  histone deacetylase superfamily protein  43.85 
 
 		 305 aa  263  2e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2162  histone deacetylase superfamily protein  41.86 
 
 		 302 aa  255  5e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1393  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein-like  46.49 
 
 		 304 aa  252  6e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.194758  normal  0.700999 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2043  Histone deacetylase  44.41 
 
 		 299 aa  248  6e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0169314  hitchhiker  0.0046378 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04120  Histone deacetylase superfamily protein  42.18 
 
 		 299 aa  248  7e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0413564  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6866  histone deacetylase superfamily  41.86 
 
 		 299 aa  246  4e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.859971  normal  0.144342 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4918  histone deacetylase superfamily protein  45.39 
 
 		 306 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000273279  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10030  histone deacetylase superfamily  48.21 
 
 		 316 aa  243  3e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0971633  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3192  histone deacetylase superfamily protein  44.67 
 
 		 305 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00911775  hitchhiker  0.000717233 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2706  histone deacetylase superfamily  44.67 
 
 		 305 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000210159  unclonable  0.000000000120446 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4777  histone deacetylase superfamily protein  45.74 
 
 		 304 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000599986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3902  histone deacetylase superfamily protein  39.7 
 
 		 357 aa  238  8e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000251706  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2562  Histone deacetylase  42.86 
 
 		 305 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.432751 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40492  predicted protein  42.81 
 
 		 350 aa  237  2e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0423597 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3722  histone deacetylase superfamily protein  46.64 
 
 		 306 aa  237  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3551  histone deacetylase superfamily  42.86 
 
 		 305 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2542  histone deacetylase superfamily protein  40.5 
 
 		 300 aa  236  3e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205391 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4295  histone deacetylase superfamily protein  44.68 
 
 		 305 aa  236  4e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.331272  normal  0.7959 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2634  histone deacetylase superfamily protein  41.58 
 
 		 300 aa  236  4e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00803062 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3373  histone deacetylase family protein  39.73 
 
 		 300 aa  235  5.0000000000000005e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0543734  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1815  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  43.57 
 
 		 304 aa  235  6e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0656  histone deacetylase superfamily protein  44.68 
 
 		 304 aa  235  7e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.000000000855576  normal  0.416487 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2905  histone deacetylase superfamily protein  41.07 
 
 		 308 aa  234  9e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.681424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2474  histone deacetylase superfamily protein  40.86 
 
 		 300 aa  234  9e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188397 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2660  histone deacetylase superfamily protein  41.22 
 
 		 304 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1532  histone deacetylase superfamily  43.3 
 
 		 304 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4764  histone deacetylase superfamily  44.68 
 
 		 304 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.0000188722  decreased coverage  0.000868257 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0323  deacetylase  37.93 
 
 		 300 aa  233  3e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1827  histone deacetylase superfamily protein  42.61 
 
 		 303 aa  233  3e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3030  Histone deacetylase  45.55 
 
 		 299 aa  233  4.0000000000000004e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.894119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4639  histone deacetylase superfamily protein  44.68 
 
 		 317 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000315852  hitchhiker  0.00689363 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4662  histone deacetylase family protein  44.68 
 
 		 305 aa  232  5e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1420  histone deacetylase superfamily protein  47.08 
 
 		 306 aa  231  1e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0496164 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1245  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  43.11 
 
 		 305 aa  231  1e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118499 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0686  histone deacetylase superfamily  48.03 
 
 		 294 aa  229  6e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.611894 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2729  histone deacetylase superfamily  39.78 
 
 		 302 aa  228  7e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00182123 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1614  histone deacetylase superfamily protein  39.43 
 
 		 302 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1648  histone deacetylase superfamily protein  39.43 
 
 		 302 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.265493 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1629  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  40.53 
 
 		 306 aa  227  2e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111374  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2483  Histone deacetylase  39.2 
 
 		 300 aa  227  2e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.557385  normal  0.140117 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4892  histone deacetylase superfamily protein  49.45 
 
 		 305 aa  226  3e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1625  histone deacetylase superfamily protein  39.43 
 
 		 302 aa  225  9e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1459  putative histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  43.52 
 
 		 305 aa  224  1e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1162  histone deacetylase superfamily protein  41.78 
 
 		 306 aa  223  2e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03035  hypothetical protein  38.76 
 
 		 307 aa  223  3e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002921  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  38.94 
 
 		 307 aa  223  4e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6387  histone deacetylase superfamily protein  46.95 
 
 		 298 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.006244  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2634  histone deacetylase superfamily protein  38.59 
 
 		 307 aa  219  5e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40681  predicted protein  44.18 
 
 		 323 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000252385  normal  0.188986 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9278  predicted protein  41.3 
 
 		 294 aa  216  5e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1764  putative histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  43.66 
 
 		 316 aa  215  7e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0823367 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0050  histone deacetylase superfamily protein  47.81 
 
 		 306 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0204903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0998  hypothetical protein  40.55 
 
 		 300 aa  212  4.9999999999999996e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2487  histone deacetylase superfamily protein  40.99 
 
 		 300 aa  212  7e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.60651  normal  0.017573 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6780  histone deacetylase superfamily  46.89 
 
 		 298 aa  204  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3900  histone deacetylase superfamily protein  36.54 
 
 		 305 aa  204  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0191811 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0713  histone deacetylase superfamily protein  45.42 
 
 		 308 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal  0.260718 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3915  histone deacetylase superfamily protein  43.93 
 
 		 315 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0726  histone deacetylase superfamily  44.8 
 
 		 297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2506  histone deacetylase superfamily  41.92 
 
 		 296 aa  200  1.9999999999999998e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02968  histone deacetylase family protein  43.61 
 
 		 224 aa  189  4e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.510136  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_4821  predicted protein  37.5 
 
 		 324 aa  178  1e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3143  histone deacetylase superfamily  36.88 
 
 		 403 aa  126  6e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.170732 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5005  Histone deacetylase  38.5 
 
 		 396 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.983537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1831  hypothetical protein  52.34 
 
 		 133 aa  120  3e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.330593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3345  histone deacetylase superfamily protein  36.5 
 
 		 407 aa  119  6e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3389  histone deacetylase superfamily protein  42.71 
 
 		 594 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3788  Histone deacetylase  36.13 
 
 		 393 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0376544  normal  0.295517 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2459  histone deacetylase superfamily protein  32 
 
 		 379 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.08307 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0801  deacetylase / acetylpolyamine aminohydrolase  32.73 
 
 		 379 aa  113  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3565  Histone deacetylase  35.08 
 
 		 393 aa  113  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27490  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  34.47 
 
 		 393 aa  112  6e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3472  histone deacetylase superfamily  43.23 
 
 		 594 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0533  histone deacetylase superfamily protein  32.28 
 
 		 348 aa  111  1.0000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.072372 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0535  Histone deacetylase  35.04 
 
 		 387 aa  109  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3536  histone deacetylase superfamily  42.71 
 
 		 594 aa  109  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.380166  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0430  histone deacetylase superfamily  38.38 
 
 		 390 aa  108  8.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188853  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1468  histone deacetylase superfamily  35.24 
 
 		 397 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0799038  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15260  putative acetylpolyamine aminohydrolase  33.33 
 
 		 380 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0390858  hitchhiker  0.0000000000262427 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3503  histone deacetylase superfamily protein  35.5 
 
 		 426 aa  106  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.678052  normal  0.280253 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>