More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_3472 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3536  histone deacetylase superfamily  99.49 
 
 
594 aa  1154    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.380166  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3472  histone deacetylase superfamily  100 
 
 
594 aa  1160    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3389  histone deacetylase superfamily protein  96.36 
 
 
594 aa  1058    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3454  histone deacetylase superfamily protein  76.66 
 
 
589 aa  863    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.524181  normal  0.0722274 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5329  histone deacetylase superfamily  51.04 
 
 
577 aa  510  1e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3030  Histone deacetylase  46.15 
 
 
299 aa  136  9e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.894119  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2506  histone deacetylase superfamily  41.67 
 
 
296 aa  125  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1152  histone deacetylase superfamily protein  40.98 
 
 
301 aa  121  3e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0905584  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2377  histone deacetylase superfamily protein  36.11 
 
 
300 aa  112  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.018  normal  0.544894 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2066  deacetylase  36.55 
 
 
299 aa  112  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.288592  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0323  deacetylase  29.31 
 
 
300 aa  111  5e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3500  Histone deacetylase  39.2 
 
 
311 aa  109  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1420  histone deacetylase superfamily protein  39.5 
 
 
306 aa  108  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0496164 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2483  Histone deacetylase  33.33 
 
 
300 aa  108  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.557385  normal  0.140117 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1459  putative histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  33.21 
 
 
305 aa  105  3e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1601  histone deacetylase superfamily  34.34 
 
 
299 aa  103  6e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1991  histone deacetylase superfamily protein  37.5 
 
 
318 aa  102  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000158404 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3448  histone deacetylase superfamily protein  39.68 
 
 
297 aa  101  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.509704 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1764  putative histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  33.33 
 
 
316 aa  99.8  1e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0823367 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2469  Histone deacetylase  35.96 
 
 
305 aa  99.8  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1768  Histone deacetylase  39.6 
 
 
311 aa  99.8  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.70732  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2162  histone deacetylase superfamily protein  34.12 
 
 
302 aa  99  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2116  histone deacetylase superfamily protein  34.52 
 
 
305 aa  99.4  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1201  histone deacetylase superfamily protein  37.76 
 
 
323 aa  99.4  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000329608  normal  0.582651 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1529  histone deacetylase superfamily protein  37.89 
 
 
299 aa  98.2  4e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.188503  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6866  histone deacetylase superfamily  34.59 
 
 
299 aa  97.4  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.859971  normal  0.144342 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0686  histone deacetylase superfamily  39.3 
 
 
294 aa  97.8  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.611894 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3902  histone deacetylase superfamily protein  29.3 
 
 
357 aa  97.4  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000251706  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1507  hypothetical protein  40.98 
 
 
324 aa  97.1  8e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.0000688301  normal  0.246857 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3087  histone deacetylase superfamily protein  39.7 
 
 
337 aa  96.3  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000151146  normal  0.0282587 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1584  histone deacetylase superfamily protein  36.84 
 
 
298 aa  95.5  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02968  histone deacetylase family protein  34.36 
 
 
224 aa  95.1  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.510136  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2789  histone deacetylase superfamily protein  33.05 
 
 
298 aa  95.1  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1613  histone deacetylase superfamily protein  40.56 
 
 
333 aa  94  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000152208  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2562  Histone deacetylase  33.16 
 
 
305 aa  93.6  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.432751 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1613  histone deacetylase superfamily  38.05 
 
 
335 aa  93.6  9e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000964161  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1606  hypothetical protein  39.11 
 
 
323 aa  93.2  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000378797  normal  0.732235 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3551  histone deacetylase superfamily  33.16 
 
 
305 aa  93.2  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1393  histone deacetylase superfamily  36.32 
 
 
299 aa  93.2  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0050  histone deacetylase superfamily protein  35.19 
 
 
306 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0204903  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04120  Histone deacetylase superfamily protein  32.43 
 
 
299 aa  92  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0413564  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1393  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein-like  36.7 
 
 
304 aa  92.8  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.194758  normal  0.700999 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3503  histone deacetylase superfamily protein  33.98 
 
 
426 aa  92  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.678052  normal  0.280253 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1239  histone deacetylase superfamily protein  36.82 
 
 
435 aa  92  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.127152  hitchhiker  0.00245204 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1941  histone deacetylase superfamily  32.12 
 
 
334 aa  91.7  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00172119  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6387  histone deacetylase superfamily protein  39.2 
 
 
298 aa  91.3  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.006244  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3192  histone deacetylase superfamily protein  35.64 
 
 
305 aa  91.3  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00911775  hitchhiker  0.000717233 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2043  Histone deacetylase  36.69 
 
 
299 aa  90.1  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0169314  hitchhiker  0.0046378 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3373  histone deacetylase family protein  27.94 
 
 
300 aa  88.6  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0543734  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2732  histone deacetylase superfamily  27.46 
 
 
396 aa  88.2  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1012  Histone deacetylase  25.93 
 
 
351 aa  87.8  5e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0713  histone deacetylase superfamily protein  38.92 
 
 
308 aa  87.8  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal  0.260718 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6780  histone deacetylase superfamily  32.14 
 
 
298 aa  87.8  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2474  histone deacetylase superfamily protein  29.01 
 
 
300 aa  87.4  7e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00188397 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2905  histone deacetylase superfamily protein  28.42 
 
 
308 aa  87.4  7e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.681424  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0726  histone deacetylase superfamily  38.92 
 
 
297 aa  87  9e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3788  Histone deacetylase  32.12 
 
 
393 aa  87  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0376544  normal  0.295517 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40492  predicted protein  32.31 
 
 
350 aa  86.7  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0423597 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1827  histone deacetylase superfamily protein  30 
 
 
303 aa  86.3  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4892  histone deacetylase superfamily protein  37.5 
 
 
305 aa  86.3  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24430  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  31.75 
 
 
406 aa  85.9  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.653116  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1532  histone deacetylase superfamily  32.47 
 
 
304 aa  86.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2729  histone deacetylase superfamily  28.47 
 
 
302 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00182123 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1648  histone deacetylase superfamily protein  28.47 
 
 
302 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.265493 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1614  histone deacetylase superfamily protein  28.47 
 
 
302 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2487  histone deacetylase superfamily protein  31.4 
 
 
300 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.60651  normal  0.017573 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2542  histone deacetylase superfamily protein  28.24 
 
 
300 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00205391 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2236  Histone deacetylase  33.05 
 
 
414 aa  85.1  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0118609  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2660  histone deacetylase superfamily protein  30.27 
 
 
304 aa  84.7  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2634  histone deacetylase superfamily protein  29.77 
 
 
300 aa  83.6  0.000000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00803062 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1832  Histone deacetylase  29.36 
 
 
410 aa  83.6  0.000000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.201599  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0708  Histone deacetylase  28.88 
 
 
389 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0250  histone deacetylase superfamily  35.24 
 
 
387 aa  83.2  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.358933  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1461  histone deacetylase superfamily protein  30.19 
 
 
393 aa  82.8  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111852  normal  0.224977 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2634  histone deacetylase superfamily protein  29.23 
 
 
307 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1625  histone deacetylase superfamily protein  29.02 
 
 
302 aa  81.6  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1245  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  34.57 
 
 
305 aa  81.6  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118499 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3268  histone deacetylase superfamily  32.23 
 
 
411 aa  80.9  0.00000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0684517  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0535  Histone deacetylase  34.84 
 
 
387 aa  80.5  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0570  histone deacetylase superfamily protein  29.49 
 
 
360 aa  80.5  0.00000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57812  predicted protein  25 
 
 
488 aa  80.5  0.00000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0533  histone deacetylase superfamily protein  36.31 
 
 
348 aa  79.7  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.072372 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49800  histone deacetylase 1 isoform  26.37 
 
 
426 aa  79.7  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4662  histone deacetylase family protein  30.71 
 
 
305 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0112  histone deacetylase superfamily  34.07 
 
 
378 aa  79  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.833129  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4496  histone deacetylase superfamily protein  25.61 
 
 
388 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1468  histone deacetylase superfamily  33.33 
 
 
397 aa  79.7  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0799038  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1556  histone deacetylase superfamily protein  31.34 
 
 
341 aa  79.7  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0507  histone deacetylase superfamily  37.76 
 
 
395 aa  79.3  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0375455 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2706  histone deacetylase superfamily  33.16 
 
 
305 aa  78.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000210159  unclonable  0.000000000120446 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0461  acetoin utilization protein AcuC  25.26 
 
 
388 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000567246 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4414  acetoin utilization protein  24.91 
 
 
388 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3338  histone deacetylase superfamily protein  26.26 
 
 
388 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0263491  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4778  acetoin utilization protein AcuC  25.26 
 
 
388 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4804  acetoin utilization protein AcuC  24.91 
 
 
388 aa  78.2  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4563  acetoin utilization protein AcuC  24.91 
 
 
388 aa  78.2  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4918  acetoin utilization protein AcuC  24.91 
 
 
388 aa  78.2  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4783  acetoin utilization protein AcuC  24.91 
 
 
388 aa  78.2  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1815  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  28.57 
 
 
304 aa  77.8  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1648  deacetylase  32.57 
 
 
381 aa  77.8  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0180748  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>