More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0463 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0463  histone deacetylase superfamily protein  100 
 
 		 284 aa  590  1e-168  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.157576  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  25.93 
 
 		 364 aa  104  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1558  histone deacetylase superfamily protein  30 
 
 		 314 aa  101  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.643913  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1405  histone deacetylase superfamily protein  30.74 
 
 		 478 aa  100  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.859929  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1000  histone deacetylase superfamily protein  32.89 
 
 		 252 aa  99.8  4e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0643  histone deacetylase superfamily  33.64 
 
 		 379 aa  99.4  6e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000282204  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  27.46 
 
 		 344 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  25.89 
 
 		 344 aa  96.7  4e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0994  histone deacetylase superfamily  30.47 
 
 		 271 aa  96.3  6e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.815956  normal  0.564868 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2048  histone deacetylase superfamily protein  31.53 
 
 		 365 aa  95.9  7e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.309662  normal  0.408539 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0936  histone deacetylase superfamily protein  28.09 
 
 		 316 aa  94  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3030  Histone deacetylase  31.43 
 
 		 299 aa  93.6  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.894119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1220  histone deacetylase superfamily protein  31.7 
 
 		 317 aa  93.2  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.354736  normal  0.0941624 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0262  histone deacetylase superfamily protein  28.04 
 
 		 331 aa  92.8  6e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0057  histone deacetylase superfamily protein  28.43 
 
 		 308 aa  92.4  8e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.620754  normal  0.137866 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2932  histone deacetylase  29.46 
 
 		 528 aa  92.4  8e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00716511 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  30.35 
 
 		 306 aa  92.4  8e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0405  histone deacetylase superfamily protein  29.34 
 
 		 248 aa  91.7  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2506  histone deacetylase superfamily  30.07 
 
 		 296 aa  91.7  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0686  histone deacetylase superfamily  30.42 
 
 		 294 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.611894 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0856  histone deacetylase superfamily  25.57 
 
 		 309 aa  90.5  3e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0895485  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0726  histone deacetylase superfamily  29.72 
 
 		 297 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3527  acetylpolyamine aminohydrolase  27.86 
 
 		 344 aa  89.4  6e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0713  histone deacetylase superfamily protein  29.72 
 
 		 308 aa  89  8e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal  0.260718 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1885  histone deacetylase superfamily protein  29.07 
 
 		 451 aa  88.6  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3338  histone deacetylase superfamily protein  29.1 
 
 		 388 aa  88.2  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0263491  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0640  histone deacetylase superfamily protein  30.04 
 
 		 307 aa  88.6  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425739 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1009  Histone deacetylase  28.79 
 
 		 450 aa  87.8  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.287637  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1476  histone deacetylase superfamily protein  29.92 
 
 		 307 aa  87.8  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.436214  normal  0.364448 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0133  histone deacetylase superfamily protein  30.85 
 
 		 347 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.758877 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10030  histone deacetylase superfamily  28.51 
 
 		 316 aa  87.4  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0971633  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2841  histone deacetylase superfamily protein  28.36 
 
 		 344 aa  87.4  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.540777 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4778  acetoin utilization protein AcuC  28.4 
 
 		 388 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2577  histone deacetylase superfamily protein  31.28 
 
 		 247 aa  87.4  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000513605  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5340  histone deacetylase superfamily  31.34 
 
 		 347 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.863251  hitchhiker  0.000438214 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00780  histone deacetylase clr3, putative  32.05 
 
 		 737 aa  87  3e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.568291  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1181  histone deacetylase superfamily protein  30.27 
 
 		 315 aa  87  3e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.298276  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4496  histone deacetylase superfamily protein  29.01 
 
 		 388 aa  87  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3143  histone deacetylase superfamily  30.73 
 
 		 403 aa  86.7  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.170732 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0416  histone deacetylase superfamily protein  33.01 
 
 		 342 aa  86.7  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5389  histone deacetylase superfamily protein  30.35 
 
 		 347 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.382979  normal  0.0522002 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0778  histone deacetylase superfamily  28.85 
 
 		 435 aa  86.7  5e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2199  histone deacetylase superfamily protein  30.35 
 
 		 343 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0656  histone deacetylase superfamily protein  27.8 
 
 		 304 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.000000000855576  normal  0.416487 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3565  Histone deacetylase  27.24 
 
 		 393 aa  85.9  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6387  histone deacetylase superfamily protein  28.45 
 
 		 298 aa  85.9  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.006244  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5249  histone deacetylase superfamily protein  30.85 
 
 		 347 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.122072  normal  0.307512 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0461  acetoin utilization protein AcuC  28.09 
 
 		 388 aa  85.9  7e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000567246 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0721  histone deacetylase superfamily protein  25.36 
 
 		 322 aa  85.9  7e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459937  normal  0.0813837 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1905  histone deacetylase superfamily protein  27.2 
 
 		 312 aa  85.9  7e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2066  histone deacetylase superfamily protein  30.35 
 
 		 342 aa  85.9  7e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.229511  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18020  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  28.4 
 
 		 417 aa  85.9  8e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.738077  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3171  histone deacetylase superfamily protein  27.36 
 
 		 344 aa  85.9  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.583419 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1031  histone deacetylase superfamily  27.07 
 
 		 438 aa  85.5  8e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0475  histone deacetylase superfamily  27.36 
 
 		 343 aa  85.5  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0976  hypothetical protein  28.41 
 
 		 448 aa  85.5  9e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3008  Histone deacetylase  29.13 
 
 		 308 aa  84.7  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0354167  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0154  histone deacetylase superfamily protein  32.56 
 
 		 345 aa  85.1  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000391208  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6484  acetylpolyamine aminohydrolase  31.22 
 
 		 341 aa  85.1  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71431  predicted protein  25.96 
 
 		 807 aa  85.5  0.000000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.71958  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0330  histone deacetylase family protein  31 
 
 		 341 aa  84.7  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2732  histone deacetylase superfamily  33.18 
 
 		 396 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_272  acetoin utilization protein/histone deacetylase  31.34 
 
 		 341 aa  84.7  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.616312  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1827  histone deacetylase superfamily protein  26.92 
 
 		 303 aa  84.3  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0570  histone deacetylase superfamily protein  31.96 
 
 		 360 aa  84.3  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4804  acetoin utilization protein AcuC  28.09 
 
 		 388 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4563  acetoin utilization protein AcuC  28.09 
 
 		 388 aa  84  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4414  acetoin utilization protein  28.09 
 
 		 388 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1504  histone deacetylase superfamily  29.95 
 
 		 341 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.170648  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4918  acetoin utilization protein AcuC  28.09 
 
 		 388 aa  84  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4783  acetoin utilization protein AcuC  28.09 
 
 		 388 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2390  putative acetoin utilization protein  30.21 
 
 		 369 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.569115  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3589  histone deacetylase superfamily  25.93 
 
 		 352 aa  83.6  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000112978 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6780  histone deacetylase superfamily  30 
 
 		 298 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1201  histone deacetylase superfamily protein  30.48 
 
 		 323 aa  83.6  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000329608  normal  0.582651 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2745  Histone deacetylase  25.99 
 
 		 406 aa  83.2  0.000000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.799904  hitchhiker  0.000342865 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3345  histone deacetylase superfamily protein  27.12 
 
 		 407 aa  82.8  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4918  histone deacetylase superfamily protein  27.8 
 
 		 306 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000273279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3722  histone deacetylase superfamily protein  27.89 
 
 		 306 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40681  predicted protein  27.45 
 
 		 323 aa  82.8  0.000000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000252385  normal  0.188986 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4800  acetoin utilization protein AcuC  27.78 
 
 		 388 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2516  histone deacetylase superfamily protein  29.66 
 
 		 321 aa  82.8  0.000000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0900829  normal  0.296848 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1246  putative histone deacetylase-family protein  28.62 
 
 		 313 aa  82.4  0.000000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0489566  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2164  histone deacetylase superfamily protein  31.66 
 
 		 318 aa  82  0.000000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2206  Histone deacetylase  26.37 
 
 		 344 aa  81.6  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0223  Histone deacetylase  26.07 
 
 		 446 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.195671 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2789  histone deacetylase superfamily protein  31 
 
 		 298 aa  81.6  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0310  histone deacetylase superfamily protein  29.5 
 
 		 341 aa  81.3  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0123  histone deacetylase superfamily protein  29.35 
 
 		 342 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4662  histone deacetylase family protein  26.44 
 
 		 305 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4397  acetoin utilization protein  28.28 
 
 		 388 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1532  histone deacetylase superfamily  25.87 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1556  histone deacetylase superfamily protein  29.64 
 
 		 341 aa  81.3  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3145  histone deacetylase superfamily protein  33.04 
 
 		 317 aa  81.3  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.110669 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1276  histone deacetylase superfamily protein  28.03 
 
 		 370 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.296162 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2171  deacetylase family protein  31.08 
 
 		 252 aa  80.9  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00147256  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1176  histone deacetylase superfamily protein  27.88 
 
 		 342 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2528  histone deacetylase superfamily protein  31.82 
 
 		 315 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0780  histone deacetylase superfamily protein  26.46 
 
 		 309 aa  80.5  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1054  histone deacetylase superfamily protein  29.36 
 
 		 369 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.836355  normal  0.241062 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>