More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0405 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0405  histone deacetylase superfamily protein  100 
 
 		 248 aa  514  1.0000000000000001e-145  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2577  histone deacetylase superfamily protein  57.72 
 
 		 247 aa  279  2e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000513605  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2171  deacetylase family protein  40.08 
 
 		 252 aa  187  2e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00147256  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0994  histone deacetylase superfamily  37.97 
 
 		 271 aa  177  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.815956  normal  0.564868 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1000  histone deacetylase superfamily protein  41.18 
 
 		 252 aa  170  2e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  30.36 
 
 		 344 aa  104  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0936  histone deacetylase superfamily protein  28.52 
 
 		 316 aa  99  6e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1905  histone deacetylase superfamily protein  30.28 
 
 		 312 aa  94.7  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  29.82 
 
 		 306 aa  94  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0091  histone deacetylase superfamily protein  30.47 
 
 		 307 aa  92  7e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.827237 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0463  histone deacetylase superfamily protein  29.34 
 
 		 284 aa  91.7  9e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.157576  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2249  histone deacetylase superfamily  32.32 
 
 		 336 aa  90.9  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2206  Histone deacetylase  29.68 
 
 		 344 aa  90.5  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0778  histone deacetylase superfamily protein  30.36 
 
 		 309 aa  89.7  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.132224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2095  histone deacetylase superfamily protein  34.01 
 
 		 317 aa  89.4  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2481  putative deacetylase  28.83 
 
 		 309 aa  89  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2697  histone deacetylase superfamily protein  29.54 
 
 		 307 aa  89  7e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.458585  normal  0.350304 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_272  acetoin utilization protein/histone deacetylase  28.98 
 
 		 341 aa  89  7e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.616312  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0860  histone deacetylase superfamily protein  33.9 
 
 		 272 aa  89  7e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0417  Histone deacetylase  27.78 
 
 		 340 aa  87.8  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2302  histone deacetylase superfamily  33.5 
 
 		 319 aa  87.4  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0154  histone deacetylase superfamily protein  32.42 
 
 		 345 aa  87  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000391208  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0780  histone deacetylase superfamily protein  28.87 
 
 		 309 aa  87.4  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2813  histone deacetylase superfamily protein  34.01 
 
 		 319 aa  87  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.573371  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3376  Histone deacetylase  34.01 
 
 		 317 aa  86.7  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0057  histone deacetylase superfamily protein  27.06 
 
 		 308 aa  86.7  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.620754  normal  0.137866 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0109  histone deacetylase superfamily  27.8 
 
 		 334 aa  87  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1360  Histone deacetylase  27.86 
 
 		 307 aa  86.7  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230539 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2387  histone deacetylase superfamily protein  32.49 
 
 		 317 aa  86.3  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1220  histone deacetylase superfamily protein  31.54 
 
 		 317 aa  86.7  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.354736  normal  0.0941624 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0510  histone deacetylase superfamily protein  29.33 
 
 		 306 aa  86.7  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3145  histone deacetylase superfamily protein  32.5 
 
 		 317 aa  86.3  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.110669 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1863  Histone deacetylase  30.66 
 
 		 310 aa  85.9  6e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0635  histone deacetylase superfamily protein  28.52 
 
 		 309 aa  85.5  7e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.745651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4458  histone deacetylase superfamily protein  27.8 
 
 		 309 aa  85.5  7e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0695577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4303  histone deacetylase superfamily protein  27.8 
 
 		 309 aa  85.5  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  0.261711 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2164  histone deacetylase superfamily protein  34.01 
 
 		 318 aa  85.1  9e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1151  histone deacetylase superfamily protein  31.53 
 
 		 309 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0952  histone deacetylase superfamily protein  31.31 
 
 		 307 aa  84.3  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0823921  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1246  putative histone deacetylase-family protein  33.67 
 
 		 313 aa  83.6  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0489566  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1024  histone deacetylase superfamily  28.14 
 
 		 309 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.448612  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2993  histone deacetylase superfamily protein  27.72 
 
 		 328 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  29.47 
 
 		 364 aa  83.2  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2528  histone deacetylase superfamily protein  32.32 
 
 		 315 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  27.62 
 
 		 344 aa  83.6  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0609  histone deacetylase superfamily  40.74 
 
 		 328 aa  83.2  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0640  histone deacetylase superfamily protein  26.67 
 
 		 307 aa  82.8  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425739 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3218  histone deacetylase superfamily  27.72 
 
 		 309 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.410643 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00186  Histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  27.88 
 
 		 326 aa  82.4  0.000000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1648  histone deacetylase family protein  29.23 
 
 		 307 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.406778  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2048  histone deacetylase superfamily protein  27.53 
 
 		 365 aa  82.8  0.000000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.309662  normal  0.408539 
 
 
-
 
NC_002936  DET0330  histone deacetylase family protein  26.79 
 
 		 341 aa  82.4  0.000000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2982  histone deacetylase family protein  28.87 
 
 		 307 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0397  histone deacetylase superfamily protein  28.21 
 
 		 319 aa  82  0.000000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3319  histone deacetylase superfamily protein  28.15 
 
 		 306 aa  81.6  0.000000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0213  histone deacetylase family protein  31.03 
 
 		 307 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0416  histone deacetylase family protein  31.03 
 
 		 307 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2872  histone deacetylase family protein  31.03 
 
 		 307 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.190592  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2934  histone deacetylase family protein  31.03 
 
 		 307 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.664786  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3008  Histone deacetylase  27.39 
 
 		 308 aa  81.3  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0354167  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2560  histone deacetylase family protein  31.03 
 
 		 307 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0936  histone deacetylase family protein  31.03 
 
 		 307 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3297  histone deacetylase family protein  29.96 
 
 		 313 aa  80.5  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0856  histone deacetylase superfamily  24.71 
 
 		 309 aa  80.9  0.00000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0895485  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0310  histone deacetylase superfamily protein  26.79 
 
 		 341 aa  80.5  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0611  histone deacetylase superfamily  30.65 
 
 		 311 aa  80.9  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1860  Histone deacetylase  31.75 
 
 		 341 aa  80.1  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0555119  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0496  histone deacetylase superfamily protein  28.85 
 
 		 309 aa  79.7  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1476  histone deacetylase superfamily protein  26.41 
 
 		 307 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.436214  normal  0.364448 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0999  deacetylase  30.66 
 
 		 311 aa  79.3  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3179  histone deacetylase superfamily  26.67 
 
 		 325 aa  79  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1813  histone deacetylase superfamily protein  28.44 
 
 		 577 aa  79  0.00000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2911  histone deacetylase superfamily protein  31.09 
 
 		 311 aa  79  0.00000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.363105 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3536  histone deacetylase superfamily  26.69 
 
 		 306 aa  78.6  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589437 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0570  histone deacetylase superfamily  29.65 
 
 		 311 aa  78.6  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.22937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2503  histone deacetylase superfamily protein  30.56 
 
 		 308 aa  78.6  0.00000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00780  histone deacetylase clr3, putative  29.28 
 
 		 737 aa  78.2  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.568291  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3178  histone deacetylase superfamily protein  28.38 
 
 		 578 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0860  histone deacetylase superfamily  28.93 
 
 		 307 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.684405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2991  histone deacetylase superfamily  28.07 
 
 		 307 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69876  hitchhiker  0.00123553 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0388  histone deacetylase superfamily protein  27.21 
 
 		 309 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.621071 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3171  histone deacetylase superfamily protein  30.41 
 
 		 344 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.583419 
 
 
-
 
NC_004310  BR0430  histone deacetylase family protein  28.64 
 
 		 337 aa  77.4  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0437  histone deacetylase family protein  28.64 
 
 		 316 aa  77.4  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1514  putative histone deacetylase-family protein  35.9 
 
 		 334 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.14124  normal  0.292905 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1078  histone deacetylase superfamily protein  30.35 
 
 		 346 aa  77  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2616  histone deacetylase superfamily protein  26.28 
 
 		 309 aa  77  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0992  putative histone deacetylase-family protein  28.79 
 
 		 334 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15260  putative acetylpolyamine aminohydrolase  28.52 
 
 		 380 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0390858  hitchhiker  0.0000000000262427 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3589  histone deacetylase superfamily  29.33 
 
 		 352 aa  76.3  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000112978 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0789  histone deacetylase superfamily  30 
 
 		 307 aa  76.3  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.384272 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3064  histone deacetylase superfamily  29.63 
 
 		 308 aa  76.3  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0937  histone deacetylase superfamily protein  32.31 
 
 		 307 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0933  histone deacetylase superfamily protein  32.31 
 
 		 307 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04190  acetylpolyamine aminohydrolase  28.38 
 
 		 344 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2516  histone deacetylase superfamily protein  26.25 
 
 		 321 aa  75.9  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0900829  normal  0.296848 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3527  acetylpolyamine aminohydrolase  30.41 
 
 		 344 aa  75.9  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3805  histone deacetylase superfamily protein  29.65 
 
 		 346 aa  75.9  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0919  hypothetical protein  28.93 
 
 		 307 aa  75.5  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.457278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0416  histone deacetylase superfamily protein  30.61 
 
 		 342 aa  75.5  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>