More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0994 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_0994  histone deacetylase superfamily  100 
 
 
271 aa  562  1.0000000000000001e-159  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.815956  normal  0.564868 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2171  deacetylase family protein  46.44 
 
 
252 aa  234  1.0000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00147256  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2577  histone deacetylase superfamily protein  38.29 
 
 
247 aa  180  2e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000513605  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0405  histone deacetylase superfamily protein  37.97 
 
 
248 aa  177  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1000  histone deacetylase superfamily protein  37.08 
 
 
252 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  32.21 
 
 
344 aa  118  7.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2516  histone deacetylase superfamily protein  32.02 
 
 
321 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0900829  normal  0.296848 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0541  histone deacetylase superfamily protein  35.81 
 
 
316 aa  112  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0510  histone deacetylase superfamily protein  30.65 
 
 
306 aa  112  6e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  33.07 
 
 
364 aa  112  7.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0640  histone deacetylase superfamily protein  35.16 
 
 
307 aa  112  7.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0425739 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0919  hypothetical protein  31.1 
 
 
307 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.457278  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0860  histone deacetylase superfamily  34.39 
 
 
307 aa  112  9e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.684405  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4458  histone deacetylase superfamily protein  32.69 
 
 
309 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0695577  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0091  histone deacetylase superfamily protein  30.12 
 
 
307 aa  112  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.827237 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4303  histone deacetylase superfamily protein  31.2 
 
 
309 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  0.261711 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0789  histone deacetylase superfamily  34.39 
 
 
307 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.384272 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0057  histone deacetylase superfamily protein  31.34 
 
 
308 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.620754  normal  0.137866 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0733  histone deacetylase superfamily protein  35.87 
 
 
307 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.780439  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0154  histone deacetylase superfamily protein  33.45 
 
 
345 aa  109  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000391208  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0430  histone deacetylase family protein  35.59 
 
 
337 aa  109  5e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2991  histone deacetylase superfamily  29.46 
 
 
307 aa  109  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69876  hitchhiker  0.00123553 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0778  histone deacetylase superfamily protein  31.68 
 
 
309 aa  109  5e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.132224  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0437  histone deacetylase family protein  35.59 
 
 
316 aa  109  6e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1863  Histone deacetylase  30.6 
 
 
310 aa  109  6e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2247  histone deacetylase superfamily protein  37.3 
 
 
307 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0992  putative histone deacetylase-family protein  30.2 
 
 
334 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3319  histone deacetylase superfamily protein  34.69 
 
 
306 aa  108  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0936  histone deacetylase family protein  32.68 
 
 
307 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0416  histone deacetylase family protein  32.68 
 
 
307 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2934  histone deacetylase family protein  32.68 
 
 
307 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.664786  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2982  histone deacetylase family protein  32.68 
 
 
307 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2872  histone deacetylase family protein  32.68 
 
 
307 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.190592  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1648  histone deacetylase family protein  32.68 
 
 
307 aa  107  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.406778  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0213  histone deacetylase family protein  32.68 
 
 
307 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2560  histone deacetylase family protein  32.68 
 
 
307 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71431  predicted protein  33.09 
 
 
807 aa  107  3e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.71958  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1220  histone deacetylase superfamily protein  33.93 
 
 
317 aa  106  5e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.354736  normal  0.0941624 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1024  histone deacetylase superfamily  30.74 
 
 
309 aa  105  7e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.448612  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0578  histone deacetylase superfamily protein  37.3 
 
 
307 aa  105  8e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.522993  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1057  histone deacetylase superfamily protein  37.3 
 
 
307 aa  105  8e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4170  histone deacetylase superfamily protein  36.76 
 
 
307 aa  104  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0756  histone deacetylase superfamily protein  34.39 
 
 
307 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1016  histone deacetylase superfamily protein  37.3 
 
 
307 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0936  histone deacetylase superfamily protein  31.62 
 
 
316 aa  104  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0937  histone deacetylase superfamily protein  37.3 
 
 
307 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2503  histone deacetylase superfamily protein  33.96 
 
 
308 aa  103  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1558  histone deacetylase superfamily protein  34.88 
 
 
314 aa  103  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.643913  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1476  histone deacetylase superfamily protein  33.82 
 
 
307 aa  104  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.436214  normal  0.364448 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0933  histone deacetylase superfamily protein  37.3 
 
 
307 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2923  histone deacetylase superfamily protein  31.48 
 
 
308 aa  103  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.498273 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00186  Histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  30.04 
 
 
326 aa  103  4e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1151  histone deacetylase superfamily protein  30.62 
 
 
309 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1749  histone deacetylase superfamily protein  34.43 
 
 
305 aa  102  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4605  histone deacetylase superfamily protein  29.53 
 
 
314 aa  102  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0732  histone deacetylase superfamily protein  30.68 
 
 
308 aa  102  7e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_272  acetoin utilization protein/histone deacetylase  29.37 
 
 
341 aa  102  9e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.616312  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0789  histone deacetylase superfamily protein  31.85 
 
 
325 aa  102  9e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0262  histone deacetylase superfamily protein  27.4 
 
 
331 aa  101  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2918  histone deacetylase superfamily protein  35.53 
 
 
345 aa  100  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1655  histone deacetylase family protein  34.71 
 
 
317 aa  100  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0496  histone deacetylase superfamily protein  34.13 
 
 
309 aa  100  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2164  histone deacetylase superfamily protein  35.98 
 
 
318 aa  100  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0780  histone deacetylase superfamily protein  30.91 
 
 
309 aa  100  4e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3589  histone deacetylase superfamily  35 
 
 
352 aa  99.8  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000112978 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0635  histone deacetylase superfamily protein  29.89 
 
 
309 aa  99.4  6e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.745651  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2789  histone deacetylase superfamily protein  28.1 
 
 
307 aa  98.6  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.403843  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3008  Histone deacetylase  33.82 
 
 
308 aa  97.8  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0354167  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0952  histone deacetylase superfamily protein  28.79 
 
 
307 aa  97.4  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0823921  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1974  histone deacetylase superfamily protein  30.48 
 
 
345 aa  97.4  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2095  histone deacetylase superfamily protein  34.04 
 
 
317 aa  97.4  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00780  histone deacetylase clr3, putative  30.43 
 
 
737 aa  97.8  2e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.568291  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0609  histone deacetylase superfamily  33.2 
 
 
328 aa  97.4  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2481  putative deacetylase  31.89 
 
 
309 aa  97.4  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0611  histone deacetylase superfamily  31.82 
 
 
311 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0570  histone deacetylase superfamily  30.99 
 
 
311 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.22937  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1813  histone deacetylase superfamily protein  32.14 
 
 
577 aa  97.4  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1905  histone deacetylase superfamily protein  30.88 
 
 
312 aa  97.4  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1155  histone deacetylase superfamily protein  33.03 
 
 
323 aa  97.4  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.60064  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3064  histone deacetylase superfamily  32.57 
 
 
308 aa  97.4  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0335  histone deacetylase superfamily protein  31.9 
 
 
307 aa  96.7  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0999  deacetylase  31.3 
 
 
311 aa  96.7  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2697  histone deacetylase superfamily protein  33.64 
 
 
307 aa  96.3  5e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.458585  normal  0.350304 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0844  histone deacetylase superfamily protein  34.8 
 
 
310 aa  96.3  5e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.729183  normal  0.248645 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0463  histone deacetylase superfamily protein  30.47 
 
 
284 aa  96.3  5e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.157576  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5804  histone deacetylase superfamily protein  29.84 
 
 
315 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.365459  normal  0.341823 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1246  putative histone deacetylase-family protein  33.87 
 
 
313 aa  94.7  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0489566  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3145  histone deacetylase superfamily protein  35.79 
 
 
317 aa  95.1  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.110669 
 
 
-
 
NC_002936  DET0330  histone deacetylase family protein  32.6 
 
 
341 aa  94  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2048  histone deacetylase superfamily protein  33.66 
 
 
365 aa  94.4  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.309662  normal  0.408539 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0989  histone deacetylase superfamily protein  33.5 
 
 
326 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2555  histone deacetylase superfamily protein  35.33 
 
 
307 aa  93.6  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0855  histone deacetylase superfamily protein  31.65 
 
 
306 aa  93.6  3e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3376  Histone deacetylase  32.8 
 
 
317 aa  94  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0844  histone deacetylase superfamily  30.91 
 
 
309 aa  93.6  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3297  histone deacetylase family protein  31.14 
 
 
313 aa  92.8  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0378  histone deacetylase superfamily protein  28.02 
 
 
365 aa  92  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316614  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2528  histone deacetylase superfamily protein  32.62 
 
 
315 aa  92  9e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  28.03 
 
 
344 aa  92  9e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2616  histone deacetylase superfamily protein  27.78 
 
 
309 aa  91.7  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>