More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0860 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0860  histone deacetylase superfamily protein  100 
 
 		 272 aa  554  1e-157  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4185  histone deacetylase superfamily protein  36.68 
 
 		 308 aa  174  9e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3536  histone deacetylase superfamily  37.27 
 
 		 306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589437 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1151  histone deacetylase superfamily protein  37.59 
 
 		 309 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1024  histone deacetylase superfamily  37.78 
 
 		 309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.448612  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0780  histone deacetylase superfamily protein  36.53 
 
 		 309 aa  163  3e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1308  histone deacetylase superfamily  40.65 
 
 		 347 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0635  histone deacetylase superfamily protein  37.78 
 
 		 309 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.745651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4458  histone deacetylase superfamily protein  37.41 
 
 		 309 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0695577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4303  histone deacetylase superfamily protein  37.78 
 
 		 309 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  0.261711 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1155  histone deacetylase superfamily protein  44.6 
 
 		 323 aa  160  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.60064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0496  histone deacetylase superfamily protein  39.19 
 
 		 309 aa  160  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0388  histone deacetylase superfamily protein  44.19 
 
 		 309 aa  160  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.621071 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0397  histone deacetylase superfamily protein  41.04 
 
 		 319 aa  159  6e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1875  histone deacetylase superfamily  38.46 
 
 		 309 aa  158  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184151  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4443  histone deacetylase superfamily protein  37.76 
 
 		 306 aa  157  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210835  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0732  histone deacetylase superfamily protein  41.37 
 
 		 308 aa  158  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2481  putative deacetylase  41.04 
 
 		 309 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0534  histone deacetylase  36.97 
 
 		 304 aa  157  2e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0989  histone deacetylase superfamily protein  41.7 
 
 		 326 aa  156  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1345  histone deacetylase superfamily  35.29 
 
 		 312 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0772  histone deacetylase superfamily  36.19 
 
 		 306 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1375  Histone deacetylase  35.29 
 
 		 312 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.190886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0844  histone deacetylase superfamily  43.72 
 
 		 309 aa  153  4e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0510  histone deacetylase superfamily protein  37.87 
 
 		 306 aa  150  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0541  histone deacetylase superfamily protein  38.35 
 
 		 316 aa  150  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0570  histone deacetylase superfamily  37 
 
 		 311 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.22937  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0611  histone deacetylase superfamily  37 
 
 		 311 aa  149  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2993  histone deacetylase superfamily protein  37.36 
 
 		 328 aa  149  4e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3179  histone deacetylase superfamily  37.36 
 
 		 325 aa  149  4e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2991  histone deacetylase superfamily  40.29 
 
 		 307 aa  149  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69876  hitchhiker  0.00123553 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2753  histone deacetylase superfamily protein  39.48 
 
 		 309 aa  149  5e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.277237  normal  0.113351 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3218  histone deacetylase superfamily  37.36 
 
 		 309 aa  149  6e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.410643 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2789  histone deacetylase superfamily protein  40.65 
 
 		 307 aa  149  6e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.403843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0640  histone deacetylase superfamily protein  35.29 
 
 		 307 aa  149  7e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425739 
 
 
-
 
NC_004310  BR0430  histone deacetylase family protein  36.92 
 
 		 337 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15260  putative acetylpolyamine aminohydrolase  39.11 
 
 		 380 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0390858  hitchhiker  0.0000000000262427 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2516  histone deacetylase superfamily protein  35.45 
 
 		 321 aa  146  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0900829  normal  0.296848 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1341  putative acetylpolyamine aminohydrolase  39.11 
 
 		 380 aa  146  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1863  Histone deacetylase  38.06 
 
 		 310 aa  145  5e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3319  histone deacetylase superfamily protein  47.13 
 
 		 306 aa  145  5e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0437  histone deacetylase family protein  36.56 
 
 		 316 aa  145  8.000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0999  deacetylase  36.03 
 
 		 311 aa  145  9e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4605  histone deacetylase superfamily protein  38.18 
 
 		 314 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1137  histone deacetylase family protein  40.24 
 
 		 307 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0091  histone deacetylase superfamily protein  36.59 
 
 		 307 aa  144  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.827237 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2798  histone deacetylase superfamily protein  40.24 
 
 		 324 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0778  histone deacetylase superfamily protein  37.92 
 
 		 309 aa  143  4e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.132224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0721  histone deacetylase superfamily protein  33.69 
 
 		 322 aa  142  4e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459937  normal  0.0813837 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  33.83 
 
 		 306 aa  142  6e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0417  Histone deacetylase  35.61 
 
 		 340 aa  142  7e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1947  histone deacetylase superfamily  35.87 
 
 		 343 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0992  putative histone deacetylase-family protein  38.83 
 
 		 334 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2503  histone deacetylase superfamily protein  34.8 
 
 		 308 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1860  Histone deacetylase  36.16 
 
 		 341 aa  140  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0555119  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0475  histone deacetylase superfamily  36.32 
 
 		 343 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2923  histone deacetylase superfamily protein  37.16 
 
 		 308 aa  139  4.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.498273 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2124  acetylpolyamine aminohydolase  36.43 
 
 		 323 aa  137  2e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.607097  normal  0.684663 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2911  histone deacetylase superfamily protein  35.9 
 
 		 311 aa  137  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.363105 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0952  histone deacetylase superfamily protein  36.5 
 
 		 307 aa  136  3.0000000000000003e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0823921  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3297  histone deacetylase family protein  37.63 
 
 		 313 aa  136  4e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2206  Histone deacetylase  34.98 
 
 		 344 aa  136  4e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  35.08 
 
 		 344 aa  135  5e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  35.98 
 
 		 344 aa  135  8e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1360  Histone deacetylase  40.07 
 
 		 307 aa  135  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230539 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3376  Histone deacetylase  43.75 
 
 		 317 aa  135  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2095  histone deacetylase superfamily protein  46.29 
 
 		 317 aa  134  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1246  putative histone deacetylase-family protein  38.32 
 
 		 313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0489566  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2249  histone deacetylase superfamily  44.94 
 
 		 336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2982  histone deacetylase family protein  38.32 
 
 		 307 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2302  histone deacetylase superfamily  44.63 
 
 		 319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1648  histone deacetylase family protein  38.32 
 
 		 307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.406778  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0563  histone deacetylase superfamily  37.5 
 
 		 335 aa  133  1.9999999999999998e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.349825  normal  0.347907 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0756  histone deacetylase superfamily protein  37.23 
 
 		 307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1220  histone deacetylase superfamily protein  37.99 
 
 		 317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.354736  normal  0.0941624 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0416  histone deacetylase family protein  38.32 
 
 		 307 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2560  histone deacetylase family protein  38.32 
 
 		 307 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2872  histone deacetylase family protein  38.32 
 
 		 307 aa  133  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.190592  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0936  histone deacetylase family protein  38.32 
 
 		 307 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1176  histone deacetylase superfamily protein  39.47 
 
 		 342 aa  133  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0213  histone deacetylase family protein  38.32 
 
 		 307 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2934  histone deacetylase family protein  38.32 
 
 		 307 aa  133  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.664786  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00186  Histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  39.15 
 
 		 326 aa  133  3.9999999999999996e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0154  histone deacetylase superfamily protein  35.25 
 
 		 345 aa  133  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000391208  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2813  histone deacetylase superfamily protein  44.63 
 
 		 319 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.573371  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1476  histone deacetylase superfamily protein  34.43 
 
 		 307 aa  132  6e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.436214  normal  0.364448 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0733  histone deacetylase superfamily protein  42.7 
 
 		 307 aa  132  7.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.780439  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0860  histone deacetylase superfamily  35.19 
 
 		 307 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.684405  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2486  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  39.52 
 
 		 310 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0789  histone deacetylase superfamily protein  30.28 
 
 		 325 aa  130  2.0000000000000002e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  36.61 
 
 		 364 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3527  acetylpolyamine aminohydrolase  39.34 
 
 		 344 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2199  histone deacetylase superfamily protein  36.74 
 
 		 343 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0936  histone deacetylase superfamily protein  34.38 
 
 		 316 aa  129  5.0000000000000004e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0133  histone deacetylase superfamily protein  35.38 
 
 		 347 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.758877 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3145  histone deacetylase superfamily protein  41.95 
 
 		 317 aa  129  6e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.110669 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0919  hypothetical protein  35.19 
 
 		 307 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.457278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3064  histone deacetylase superfamily  36.5 
 
 		 308 aa  128  9.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0789  histone deacetylase superfamily  35.19 
 
 		 307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.384272 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2616  histone deacetylase superfamily protein  35.02 
 
 		 309 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>