More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1000 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_1000  histone deacetylase superfamily protein  100 
 
 
252 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0405  histone deacetylase superfamily protein  41.18 
 
 
248 aa  188  8e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2577  histone deacetylase superfamily protein  43.62 
 
 
247 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000513605  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0994  histone deacetylase superfamily  37.08 
 
 
271 aa  157  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.815956  normal  0.564868 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2171  deacetylase family protein  39.02 
 
 
252 aa  152  5.9999999999999996e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00147256  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0463  histone deacetylase superfamily protein  32.89 
 
 
284 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.157576  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  32.2 
 
 
344 aa  109  5e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0640  histone deacetylase superfamily protein  32.52 
 
 
307 aa  106  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0425739 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1341  putative acetylpolyamine aminohydrolase  32.79 
 
 
380 aa  102  8e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15260  putative acetylpolyamine aminohydrolase  32.39 
 
 
380 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0390858  hitchhiker  0.0000000000262427 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0057  histone deacetylase superfamily protein  32.11 
 
 
308 aa  98.6  8e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.620754  normal  0.137866 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0262  histone deacetylase superfamily protein  30.93 
 
 
331 aa  97.8  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0378  histone deacetylase superfamily protein  30.91 
 
 
365 aa  98.2  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316614  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0109  histone deacetylase superfamily  31.21 
 
 
334 aa  97.4  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1558  histone deacetylase superfamily protein  32.59 
 
 
314 aa  95.9  5e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.643913  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1220  histone deacetylase superfamily protein  36.04 
 
 
317 aa  96.3  5e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.354736  normal  0.0941624 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2048  histone deacetylase superfamily protein  30.07 
 
 
365 aa  95.1  8e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.309662  normal  0.408539 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0801  deacetylase / acetylpolyamine aminohydrolase  32.39 
 
 
379 aa  94.7  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0510  histone deacetylase superfamily protein  29.96 
 
 
306 aa  94.4  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1919  histone deacetylase superfamily protein  28.26 
 
 
369 aa  94  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1905  histone deacetylase superfamily protein  31.64 
 
 
312 aa  93.6  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0024  histone deacetylase superfamily  28.98 
 
 
343 aa  92.8  4e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0154  histone deacetylase superfamily protein  27.92 
 
 
345 aa  92.8  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000391208  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2616  histone deacetylase superfamily protein  29.47 
 
 
309 aa  92  7e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3008  Histone deacetylase  33.1 
 
 
308 aa  92  8e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0354167  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0860  histone deacetylase superfamily protein  28.36 
 
 
272 aa  91.7  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2459  histone deacetylase superfamily protein  31.58 
 
 
379 aa  91.3  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.08307 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2095  histone deacetylase superfamily protein  37.57 
 
 
317 aa  91.3  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5232  histone deacetylase superfamily protein  29.54 
 
 
369 aa  91.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.428227 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  31.16 
 
 
344 aa  91.7  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0778  histone deacetylase superfamily protein  28.77 
 
 
309 aa  90.5  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.132224  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2516  histone deacetylase superfamily protein  30.34 
 
 
321 aa  90.5  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0900829  normal  0.296848 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2206  Histone deacetylase  30.85 
 
 
344 aa  90.5  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  30.71 
 
 
364 aa  91.3  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1476  histone deacetylase superfamily protein  29.1 
 
 
307 aa  90.9  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.436214  normal  0.364448 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2302  histone deacetylase superfamily  34.86 
 
 
319 aa  90.5  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0991  Histone deacetylase  28.42 
 
 
327 aa  90.1  3e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.964877  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2503  histone deacetylase superfamily protein  35.53 
 
 
308 aa  90.1  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0860  histone deacetylase superfamily  34.29 
 
 
307 aa  89.7  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.684405  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2164  histone deacetylase superfamily protein  35.39 
 
 
318 aa  89.7  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2387  histone deacetylase superfamily protein  34.64 
 
 
317 aa  89.7  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2813  histone deacetylase superfamily protein  34.86 
 
 
319 aa  89.7  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.573371  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0555  histone deacetylase superfamily protein  31.43 
 
 
379 aa  89.7  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0310  histone deacetylase superfamily protein  28.67 
 
 
341 aa  89.7  4e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_272  acetoin utilization protein/histone deacetylase  27.97 
 
 
341 aa  88.2  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.616312  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0844  histone deacetylase superfamily  30.11 
 
 
309 aa  88.2  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6148  histone deacetylase superfamily protein  28.11 
 
 
369 aa  87.8  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.7122  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1931  histone deacetylase superfamily protein  28.11 
 
 
369 aa  87.8  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0789  histone deacetylase superfamily  33.71 
 
 
307 aa  87.8  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.384272 
 
 
-
 
NC_004310  BR0430  histone deacetylase family protein  29.72 
 
 
337 aa  87.8  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3376  Histone deacetylase  35.8 
 
 
317 aa  87.4  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3589  histone deacetylase superfamily  30.08 
 
 
352 aa  87  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000112978 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2911  histone deacetylase superfamily protein  36.78 
 
 
311 aa  87.4  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.363105 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0541  histone deacetylase superfamily protein  29.72 
 
 
316 aa  87.4  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2528  histone deacetylase superfamily protein  36.57 
 
 
315 aa  87.4  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1341  histone deacetylase superfamily protein  28.63 
 
 
373 aa  87.4  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0145717 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2918  histone deacetylase superfamily protein  34.54 
 
 
345 aa  86.7  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0616  histone deacetylase superfamily protein  27.05 
 
 
370 aa  86.7  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0417  Histone deacetylase  31.1 
 
 
340 aa  86.3  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0330  histone deacetylase family protein  27.43 
 
 
341 aa  85.9  6e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1954  histone deacetylase superfamily protein  27.4 
 
 
369 aa  85.1  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00466177  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1425  histone deacetylase superfamily protein  28.47 
 
 
370 aa  85.1  9e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1246  putative histone deacetylase-family protein  33.71 
 
 
313 aa  85.1  9e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0489566  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0952  histone deacetylase superfamily protein  32.02 
 
 
307 aa  84.7  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0823921  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0437  histone deacetylase family protein  29.37 
 
 
316 aa  84.7  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0721  histone deacetylase superfamily protein  33.93 
 
 
322 aa  84.7  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459937  normal  0.0813837 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0780  histone deacetylase superfamily protein  26.4 
 
 
309 aa  85.1  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0936  histone deacetylase superfamily protein  28.33 
 
 
316 aa  84.7  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4049  Histone deacetylase  30.04 
 
 
359 aa  84  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.248474  normal  0.645592 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0733  histone deacetylase superfamily protein  33.71 
 
 
307 aa  84  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.780439  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0946  histone deacetylase superfamily protein  32.56 
 
 
348 aa  83.6  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00186  Histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  31.8 
 
 
326 aa  82.8  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3145  histone deacetylase superfamily protein  33.51 
 
 
317 aa  83.2  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.110669 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0919  hypothetical protein  32 
 
 
307 aa  82.8  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.457278  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00780  histone deacetylase clr3, putative  30.14 
 
 
737 aa  82.8  0.000000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.568291  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0335  histone deacetylase superfamily protein  27.6 
 
 
307 aa  82.8  0.000000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0050  histone deacetylase superfamily protein  30.23 
 
 
306 aa  82.4  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0204903  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0635  histone deacetylase superfamily protein  26.13 
 
 
309 aa  82.4  0.000000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.745651  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0496  histone deacetylase superfamily protein  28.93 
 
 
309 aa  82.4  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1151  histone deacetylase superfamily protein  27.72 
 
 
309 aa  82  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3297  histone deacetylase family protein  28.28 
 
 
313 aa  82  0.000000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1360  Histone deacetylase  36 
 
 
307 aa  81.3  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.230539 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4458  histone deacetylase superfamily protein  27.18 
 
 
309 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0695577  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4303  histone deacetylase superfamily protein  26.83 
 
 
309 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  0.261711 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2991  histone deacetylase superfamily  27.99 
 
 
307 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69876  hitchhiker  0.00123553 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1181  histone deacetylase superfamily protein  31.43 
 
 
315 aa  80.9  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.298276  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2656  putative acetylpolyamine aminohydrolase  27.64 
 
 
371 aa  80.9  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1514  putative histone deacetylase-family protein  34.68 
 
 
334 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.14124  normal  0.292905 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1276  histone deacetylase superfamily protein  29.02 
 
 
370 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.296162 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2923  histone deacetylase superfamily protein  32.35 
 
 
308 aa  80.9  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.498273 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3248  histone deacetylase superfamily protein  28.8 
 
 
369 aa  80.1  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000895974 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0756  histone deacetylase superfamily protein  35.23 
 
 
307 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0992  putative histone deacetylase-family protein  34.48 
 
 
334 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1308  histone deacetylase superfamily  34.08 
 
 
347 aa  79.7  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0789  histone deacetylase superfamily protein  27.48 
 
 
325 aa  79.7  0.00000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0563  histone deacetylase superfamily  29.86 
 
 
335 aa  79.3  0.00000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.349825  normal  0.347907 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3064  histone deacetylase superfamily  28.57 
 
 
308 aa  79.3  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2856  histone deacetylase superfamily protein  52 
 
 
342 aa  79.3  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1654  histone deacetylase superfamily protein  32.29 
 
 
341 aa  78.6  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2982  histone deacetylase family protein  31.84 
 
 
307 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>