276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0098 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0098  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase-like protein  100 
 
 		 318 aa  655    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3184  Polyprenyl synthetase  40.71 
 
 		 326 aa  217  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2399  farnesyltranstransferase  31.53 
 
 		 322 aa  90.9  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0453989  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23090  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  29.2 
 
 		 335 aa  91.3  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.55516  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0533  polyprenyl synthetase  29.17 
 
 		 338 aa  85.1  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.506738 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1286  polyprenyl synthetase  29.63 
 
 		 338 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.916051  normal  0.252037 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1465  Polyprenyl synthetase  23.64 
 
 		 345 aa  79.7  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1844  Polyprenyl synthetase  26.47 
 
 		 321 aa  76.6  0.0000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1604  Polyprenyl synthetase  26.04 
 
 		 343 aa  76.3  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.643499 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2372  Polyprenyl synthetase  29.52 
 
 		 320 aa  75.9  0.0000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.550389  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13417  polyprenyl synthetase idsB  27.63 
 
 		 350 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1417  dimethylallyltranstransferase / geranyltranstransferase  29.68 
 
 		 321 aa  73.9  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000231045  decreased coverage  0.000138058 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1263  polyprenyl synthetase  25.44 
 
 		 324 aa  73.6  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2818  Polyprenyl synthetase  30.61 
 
 		 337 aa  72.8  0.000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01980  putative isoprenoid biosynthesis related protein  25.27 
 
 		 324 aa  72  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1997  Polyprenyl synthetase  28.96 
 
 		 368 aa  69.7  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0211657  normal  0.0925303 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13433  multi-functional geranylgeranyl pyrophosphate synthetase idsA1: dimethylallyltransferase + geranyltranstransferase + farnesyltranstransferase  26.57 
 
 		 359 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1219  trans-hexaprenyltranstransferase  25.27 
 
 		 324 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.581853 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1042  Dimethylallyltranstransferase  25.27 
 
 		 332 aa  67  0.0000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1275  Polyprenyl synthetase  23.61 
 
 		 343 aa  66.6  0.0000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.360405  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0763  Polyprenyl synthetase  25.32 
 
 		 346 aa  65.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0769  Polyprenyl synthetase  28.88 
 
 		 341 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.555577 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1042  polyprenyl synthetase  22.78 
 
 		 317 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.623686 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2209  farnesyltranstransferase  28.69 
 
 		 325 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1816  geranyltranstransferase  28.45 
 
 		 321 aa  64.7  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.204305  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3714  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase-like protein  35 
 
 		 350 aa  63.9  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000327917  normal  0.60035 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  29.03 
 
 		 297 aa  64.3  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5018  Polyprenyl synthetase  26.43 
 
 		 346 aa  64.3  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61988  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0394  polyprenyl synthetase  28.43 
 
 		 285 aa  63.5  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2412  Dimethylallyltranstransferase  27.75 
 
 		 322 aa  63.5  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033108 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2538  Dimethylallyltranstransferase  38.1 
 
 		 349 aa  62.8  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5714  polyprenyl synthetase  27.49 
 
 		 338 aa  62.8  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0414957  normal  0.844261 
 
 
-
 
NC_002950  PG0784  polyprenyl synthetase  27.49 
 
 		 325 aa  62.8  0.000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0552  polyprenyl synthetase  29.73 
 
 		 338 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0863635 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  27.96 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0345  Polyprenyl synthetase  26.87 
 
 		 347 aa  61.6  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1696  polyprenyl synthetase  29.65 
 
 		 339 aa  62  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000054414 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1635  dimethylallyltranstransferase  22.01 
 
 		 317 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.750047  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  25.19 
 
 		 326 aa  61.2  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  27.8 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0287  polyprenyl synthetase  26.64 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000205229 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  29.56 
 
 		 364 aa  60.8  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0263779 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0904  polyprenyl synthetase  22.39 
 
 		 317 aa  60.8  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.28863  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0577  Polyprenyl synthetase  29.74 
 
 		 349 aa  60.5  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.25249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  27.8 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0389  heptaprenyl diphosphate synthase component II  28.99 
 
 		 324 aa  60.1  0.00000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0293538  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1628  Polyprenyl synthetase  25.36 
 
 		 322 aa  59.7  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.310703 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0822  polyprenyl synthetase  26.94 
 
 		 338 aa  59.7  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0315  Polyprenyl synthetase  23.02 
 
 		 332 aa  59.7  0.00000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1186  polyprenyl synthetase  23.22 
 
 		 320 aa  59.7  0.00000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3448  polyprenyl synthetase  28.36 
 
 		 341 aa  59.7  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.142936 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0472  farnesyltranstransferase  28.08 
 
 		 327 aa  59.7  0.00000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0424008  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1537  polyprenyl synthetase family protein  25.99 
 
 		 350 aa  59.3  0.00000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1103  Polyprenyl synthetase  27.1 
 
 		 324 aa  59.3  0.00000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.789784  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0968  polyprenyl synthetase  26.04 
 
 		 313 aa  59.3  0.00000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0241  Polyprenyl synthetase  27.83 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.362047 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3006  Trans-hexaprenyltranstransferase  23.79 
 
 		 324 aa  58.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6906  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase-like protein  27.91 
 
 		 346 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0776  farnesyl-diphosphate synthase  26.98 
 
 		 301 aa  58.9  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  22.34 
 
 		 322 aa  58.5  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2084  Polyprenyl synthetase  23.55 
 
 		 326 aa  58.5  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.235717  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0606  geranyltranstransferase  26.11 
 
 		 337 aa  58.5  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3743  polyprenyl synthetase  28.89 
 
 		 322 aa  58.9  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5921  Polyprenyl synthetase  28.75 
 
 		 340 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214743  normal  0.354023 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3342  Polyprenyl synthetase  38.64 
 
 		 331 aa  58.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000667178  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0383  Polyprenyl synthetase  24.08 
 
 		 337 aa  57.8  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.955565  normal  0.0650374 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1788  geranyltranstransferase  28.65 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188169  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1262  Trans-hexaprenyltranstransferase  24.56 
 
 		 320 aa  57.8  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  28.79 
 
 		 322 aa  58.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0443  Dimethylallyltranstransferase  35.24 
 
 		 349 aa  58.5  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.843643  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09331  polyprenyl synthetase  27.14 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2135  geranyltranstransferase  25 
 
 		 327 aa  57.4  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0551821  decreased coverage  0.00000978796 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  29.19 
 
 		 322 aa  57.4  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5075  Polyprenyl synthetase  27.64 
 
 		 326 aa  57  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.581141 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0514  trans-hexaprenyltranstransferase  25 
 
 		 337 aa  57.4  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1935  farnesyl-diphosphate synthase  26.18 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  28.35 
 
 		 322 aa  56.6  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1446  isoprenyl synthetase  25.26 
 
 		 331 aa  56.6  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  25.57 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0598  Trans-hexaprenyltranstransferase  25.87 
 
 		 331 aa  56.2  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1188  Polyprenyl synthetase  24.82 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000116702  normal  0.535135 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  21.86 
 
 		 317 aa  56.2  0.0000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4173  farnesyl-diphosphate synthase  25.63 
 
 		 316 aa  56.2  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  normal  0.522672 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  25.47 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1698  polyprenyl synthetase  28.36 
 
 		 349 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2231  polyprenyl synthetase  27.87 
 
 		 341 aa  55.5  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.317213  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1534  Polyprenyl synthetase  26.67 
 
 		 324 aa  55.5  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0416  Polyprenyl synthetase  24.8 
 
 		 332 aa  55.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0642376 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2049  Polyprenyl synthetase  35.83 
 
 		 346 aa  55.5  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.000493992  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2074  geranyltranstransferase  27.53 
 
 		 290 aa  55.8  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00203562  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1248  Trans-hexaprenyltranstransferase  23.53 
 
 		 323 aa  55.8  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0384  polyprenyl synthetase  25.76 
 
 		 332 aa  55.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.671664  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  26.02 
 
 		 300 aa  55.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05420  polyprenyl synthetase  22.43 
 
 		 311 aa  54.7  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.242903  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17563  predicted protein  23.86 
 
 		 312 aa  54.7  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0164113  normal  0.0513256 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2320  Polyprenyl synthetase  26.8 
 
 		 297 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0054  Polyprenyl synthetase  29.48 
 
 		 358 aa  54.7  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00942137  normal  0.0473484 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0988  trans-hexaprenyltranstransferase  22.7 
 
 		 324 aa  54.7  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.955039  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0295  trans-hexaprenyltranstransferase  27.95 
 
 		 331 aa  55.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6080  polyprenyl synthetase  31.01 
 
 		 338 aa  53.9  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.176249 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>