More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0394 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0394  polyprenyl synthetase  100 
 
 
285 aa  587  1e-167  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1235  polyprenyl synthetase  50.53 
 
 
300 aa  296  2e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.347308  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0351  polyprenyl synthetase  43.26 
 
 
289 aa  211  1e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.149779  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1417  dimethylallyltranstransferase / geranyltranstransferase  29.28 
 
 
321 aa  143  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000231045  decreased coverage  0.000138058 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2399  farnesyltranstransferase  31.65 
 
 
322 aa  138  1e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0453989  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2135  geranyltranstransferase  34.95 
 
 
327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0551821  decreased coverage  0.00000978796 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2412  Dimethylallyltranstransferase  35.77 
 
 
322 aa  133  3e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00033108 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0054  Polyprenyl synthetase  30.94 
 
 
358 aa  132  9e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00942137  normal  0.0473484 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1365  Polyprenyl synthetase  32.25 
 
 
322 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3205  octaprenyl-diphosphate synthase  35.15 
 
 
322 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.192377  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0472  farnesyltranstransferase  30.49 
 
 
327 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0424008  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase/polyprenyl synthetase  28.01 
 
 
333 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2681  trans-hexaprenyltranstransferase  30.88 
 
 
334 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  29.8 
 
 
322 aa  129  8.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2406  trans-hexaprenyltranstransferase  28.01 
 
 
333 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463272  normal  0.792362 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2031  trans-hexaprenyltranstransferase  34.05 
 
 
333 aa  128  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0164  Trans-hexaprenyltranstransferase  32.8 
 
 
325 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0195554  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0470  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.85 
 
 
320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  33.95 
 
 
333 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  35 
 
 
322 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1687  farnesyl pyrophosphate synthetase  31.47 
 
 
332 aa  125  7e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0622197  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0963  polyprenyl synthetase  33.33 
 
 
324 aa  125  7e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728777  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0492  polyprenyl synthetase family protein  31.47 
 
 
332 aa  125  7e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000926468  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4219  Trans-hexaprenyltranstransferase  34.05 
 
 
345 aa  125  8.000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2899  octaprenyl-diphosphate synthase  31.5 
 
 
322 aa  125  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1849  trans-hexaprenyltranstransferase  33.5 
 
 
323 aa  125  1e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3072  octaprenyl-diphosphate synthase  35.29 
 
 
334 aa  124  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.436808  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2517  Polyprenyl synthetase  31.5 
 
 
322 aa  125  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3354  trans-hexaprenyltranstransferase  34.76 
 
 
331 aa  125  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00431304  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  33.63 
 
 
322 aa  124  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1248  Trans-hexaprenyltranstransferase  32.95 
 
 
323 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3672  Polyprenyl synthetase  32.43 
 
 
323 aa  124  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00904172  normal  0.171557 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1651  Trans-hexaprenyltranstransferase  35.6 
 
 
322 aa  124  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00299697  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1814  farnesyltranstransferase  33.48 
 
 
322 aa  124  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1432  polyprenyl synthetase  28.57 
 
 
344 aa  124  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2470  polyprenyl synthetase  29.58 
 
 
333 aa  123  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870364  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0553  Polyprenyl synthetase  35.27 
 
 
336 aa  123  3e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.926134 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0487  trans-hexaprenyltranstransferase  26.9 
 
 
335 aa  123  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1317  octaprenyl-diphosphate synthase  35.81 
 
 
322 aa  123  4e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3623  octaprenyl diphosphate synthase  31.35 
 
 
323 aa  123  4e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000129591  normal  0.282199 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1534  Polyprenyl synthetase  33.18 
 
 
324 aa  123  4e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  32.74 
 
 
322 aa  122  5e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0193  farnesyltranstransferase  31.06 
 
 
334 aa  122  6e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000332441  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1264  Polyprenyl synthetase  30.24 
 
 
297 aa  122  6e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1042  Dimethylallyltranstransferase  31.43 
 
 
332 aa  122  7e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0211  Polyprenyl synthetase  31.06 
 
 
334 aa  122  9e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.301992 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1267  farnesyltranstransferase  34.97 
 
 
327 aa  122  9e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000414362  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2027  trans-hexaprenyltranstransferase  32.26 
 
 
331 aa  122  9e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0863  trans-hexaprenyltranstransferase  34.39 
 
 
343 aa  122  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0603068  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0840  dimethylallyltranstransferase  34.62 
 
 
327 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0733  Trans-hexaprenyltranstransferase  38.01 
 
 
326 aa  121  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2823  octaprenyl-diphosphate synthase  32.11 
 
 
322 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000462084  normal  0.156809 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2166  trans-hexaprenyltranstransferase  29.45 
 
 
320 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3743  polyprenyl synthetase  36.46 
 
 
322 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0769  Polyprenyl synthetase  34.43 
 
 
327 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3742  farnesyltranstransferase  32.97 
 
 
336 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.326793  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2149  heptaprenyl diphosphate synthase component II  30.74 
 
 
320 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900813  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1103  Polyprenyl synthetase  33.01 
 
 
324 aa  119  6e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.789784  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3376  polyprenyl synthetase  32.18 
 
 
322 aa  119  6e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3918  dimethylallyltranstransferase  36.36 
 
 
342 aa  119  6e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00996484 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0244  octaprenyl-diphosphate synthase  31.22 
 
 
326 aa  119  7e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000222684  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3427  Polyprenyl synthetase  28.42 
 
 
340 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.640132 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0340  trans-hexaprenyltranstransferase  32.38 
 
 
321 aa  118  9e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104163  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03300  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  30.49 
 
 
337 aa  118  9e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5487  polyprenyl synthetase  35.11 
 
 
359 aa  118  9e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.057481  normal  0.26211 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3739  trans-hexaprenyltranstransferase  31.84 
 
 
323 aa  118  9e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000225438  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4513  octaprenyl-diphosphate synthase  33.17 
 
 
327 aa  118  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0766  trans-hexaprenyltranstransferase  28.92 
 
 
325 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1262  Trans-hexaprenyltranstransferase  30.99 
 
 
320 aa  118  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2455  polyprenyl synthetase  34.55 
 
 
322 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000180398  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0413  Polyprenyl synthetase  33.93 
 
 
337 aa  118  9.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0771  trans-hexaprenyltranstransferase  28.92 
 
 
335 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0360  octaprenyl-diphosphate synthase  30.3 
 
 
323 aa  118  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00089716  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0241  Polyprenyl synthetase  32.49 
 
 
280 aa  118  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.362047 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0785  trans-hexaprenyltranstransferase  28.92 
 
 
342 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.856198  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4194  polyprenyl synthetase  36.32 
 
 
349 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07520  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  33 
 
 
337 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0633826 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0890  polyprenyl synthetase  34.97 
 
 
309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0253423 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3068  Polyprenyl synthetase  32.13 
 
 
325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447396  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1350  trans-hexaprenyltranstransferase  28.25 
 
 
318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1756  trans-hexaprenyltranstransferase  32.74 
 
 
344 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.726809  normal  0.071428 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2372  Polyprenyl synthetase  33.33 
 
 
320 aa  117  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.550389  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3108  polyprenyl synthetase  28.08 
 
 
340 aa  116  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1983  octaprenyl diphosphate synthase  31.88 
 
 
322 aa  117  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.977315  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  31.82 
 
 
322 aa  117  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03732  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase  31.14 
 
 
324 aa  116  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100816  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00798  octaprenyl-diphosphate synthase  31.12 
 
 
323 aa  116  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0988  trans-hexaprenyltranstransferase  33.49 
 
 
324 aa  117  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.955039  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3495  octaprenyl diphosphate synthase  31.94 
 
 
370 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000567296  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3215  Polyprenyl synthetase  32.65 
 
 
334 aa  116  3.9999999999999997e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.119356 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3497  octaprenyl diphosphate synthase  31.94 
 
 
370 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000502837  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  32.43 
 
 
332 aa  116  3.9999999999999997e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3602  octaprenyl diphosphate synthase  31.94 
 
 
370 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0102331  normal  0.778789 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3664  octaprenyl diphosphate synthase  31.94 
 
 
370 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000479372  normal  0.0578061 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3566  octaprenyl diphosphate synthase  31.94 
 
 
370 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000499434  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3676  trans-hexaprenyltranstransferase  36.22 
 
 
344 aa  116  5e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1586  trans-hexaprenyltranstransferase  30.66 
 
 
323 aa  116  5e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3673  octaprenyl diphosphate synthase  31.94 
 
 
323 aa  115  6e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000447788  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0796  octylprenyl diphosphate synthase  33.94 
 
 
322 aa  115  6e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3380  octaprenyl diphosphate synthase  31.94 
 
 
323 aa  115  6e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3954399999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>