More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0769 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0769  Polyprenyl synthetase  100 
 
 		 341 aa  703    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.555577 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1286  polyprenyl synthetase  32.5 
 
 		 338 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.916051  normal  0.252037 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0533  polyprenyl synthetase  31.67 
 
 		 338 aa  89.4  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.506738 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1604  Polyprenyl synthetase  30.04 
 
 		 343 aa  79.7  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.643499 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  33.17 
 
 		 294 aa  70.9  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0763  Polyprenyl synthetase  28.94 
 
 		 346 aa  69.3  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5018  Polyprenyl synthetase  27.46 
 
 		 346 aa  68.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61988  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13433  multi-functional geranylgeranyl pyrophosphate synthetase idsA1: dimethylallyltransferase + geranyltranstransferase + farnesyltranstransferase  31.31 
 
 		 359 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  31.51 
 
 		 295 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6988  Trans-hexaprenyltranstransferase  31.01 
 
 		 321 aa  67  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.955894  hitchhiker  0.000428726 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3714  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase-like protein  31.45 
 
 		 350 aa  67  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000327917  normal  0.60035 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1042  Dimethylallyltranstransferase  25.72 
 
 		 332 aa  65.9  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0098  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase-like protein  28.88 
 
 		 318 aa  65.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09331  polyprenyl synthetase  30.49 
 
 		 306 aa  65.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2818  Polyprenyl synthetase  30.7 
 
 		 337 aa  65.5  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1219  trans-hexaprenyltranstransferase  31.17 
 
 		 324 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.581853 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  32.24 
 
 		 296 aa  64.7  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2586  Polyprenyl synthetase  31.1 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0968269  normal  0.362813 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2404  polyprenyl synthetase  30.99 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0620494  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1586  trans-hexaprenyltranstransferase  30.15 
 
 		 323 aa  63.5  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2399  farnesyltranstransferase  27.44 
 
 		 322 aa  62.8  0.000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0453989  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0680  trans-hexaprenyltranstransferase  27.8 
 
 		 322 aa  62.8  0.000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000360106  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2027  trans-hexaprenyltranstransferase  27.74 
 
 		 331 aa  62.8  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  26.43 
 
 		 326 aa  62.8  0.000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  30.49 
 
 		 295 aa  62  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  29.6 
 
 		 364 aa  62  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0263779 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6906  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase-like protein  30.39 
 
 		 346 aa  62.4  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1814  farnesyltranstransferase  24.19 
 
 		 322 aa  61.6  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0510  dimethylallyltransferase  29.75 
 
 		 330 aa  60.8  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0303508 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  28.79 
 
 		 297 aa  61.2  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2441  Polyprenyl synthetase  28.84 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0963  polyprenyl synthetase  32.28 
 
 		 324 aa  60.5  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728777  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3184  Polyprenyl synthetase  30.26 
 
 		 326 aa  60.5  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1275  Polyprenyl synthetase  25.28 
 
 		 343 aa  60.1  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.360405  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001674  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  30.32 
 
 		 323 aa  60.1  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000010929  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0193  farnesyltranstransferase  25.09 
 
 		 334 aa  60.1  0.00000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000332441  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17563  predicted protein  29.91 
 
 		 312 aa  60.1  0.00000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0164113  normal  0.0513256 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2183  Polyprenyl synthetase  27.52 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000465843  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5714  polyprenyl synthetase  26.02 
 
 		 338 aa  59.3  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0414957  normal  0.844261 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1765  geranyltranstransferase  29.15 
 
 		 297 aa  59.3  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316781  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0345  Polyprenyl synthetase  25.6 
 
 		 347 aa  58.9  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1188  Polyprenyl synthetase  29.68 
 
 		 324 aa  58.5  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000116702  normal  0.535135 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  27.35 
 
 		 300 aa  58.9  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  29.8 
 
 		 322 aa  59.3  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  28.64 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0577  Polyprenyl synthetase  29.39 
 
 		 349 aa  58.2  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.25249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1784  polyprenyl synthetase  29.33 
 
 		 325 aa  58.5  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.60288  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2320  Polyprenyl synthetase  28.57 
 
 		 297 aa  58.2  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0492  polyprenyl synthetase family protein  27.7 
 
 		 332 aa  58.5  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000926468  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  29.2 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2166  trans-hexaprenyltranstransferase  32.79 
 
 		 320 aa  57.4  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1186  polyprenyl synthetase  25.57 
 
 		 320 aa  57  0.0000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03940  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  28.28 
 
 		 354 aa  57  0.0000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.530934 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1997  Polyprenyl synthetase  29.56 
 
 		 368 aa  56.6  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0211657  normal  0.0925303 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  28 
 
 		 322 aa  56.6  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0700  trans-hexaprenyltranstransferase  29.45 
 
 		 322 aa  57  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1446  isoprenyl synthetase  27.27 
 
 		 331 aa  56.6  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1935  farnesyl-diphosphate synthase  28.76 
 
 		 297 aa  57  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1687  farnesyl pyrophosphate synthetase  27.7 
 
 		 332 aa  56.6  0.0000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0622197  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2852  octaprenyl-diphosphate synthase  30.19 
 
 		 348 aa  56.6  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000355591  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1454  Polyprenyl synthetase  32.05 
 
 		 324 aa  56.6  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.322683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1438  heptaprenyl diphosphate synthase component II  29.75 
 
 		 320 aa  56.6  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00798  octaprenyl-diphosphate synthase  27.92 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  29.2 
 
 		 299 aa  56.2  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  28.37 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0606  geranyltranstransferase  25.93 
 
 		 337 aa  56.2  0.0000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1264  Polyprenyl synthetase  25.3 
 
 		 297 aa  55.8  0.0000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1696  polyprenyl synthetase  32.46 
 
 		 339 aa  56.2  0.0000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000054414 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0863  trans-hexaprenyltranstransferase  28.67 
 
 		 343 aa  55.5  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0603068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  23.79 
 
 		 322 aa  55.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0211  Polyprenyl synthetase  23.83 
 
 		 334 aa  55.5  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.301992 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0369  polyprenyl synthetase  24.68 
 
 		 324 aa  55.5  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000634343  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0524  octaprenyl-diphosphate synthase  26.94 
 
 		 331 aa  55.5  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0953  trans-hexaprenyltranstransferase  29.94 
 
 		 323 aa  55.5  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0940385  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0389  heptaprenyl diphosphate synthase component II  25.32 
 
 		 324 aa  55.1  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0293538  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4509  octaprenyl diphosphate synthase  26.18 
 
 		 323 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000159787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23090  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  26.53 
 
 		 335 aa  55.1  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.55516  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0360  octaprenyl-diphosphate synthase  28.39 
 
 		 323 aa  55.1  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00089716  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1926  farnesyl-diphosphate synthase  28.63 
 
 		 296 aa  55.1  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1538  polyprenyl synthetase  27.62 
 
 		 294 aa  54.7  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000356422  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1007  phage tail region protein  31.9 
 
 		 320 aa  55.5  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000193077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6668  Polyprenyl synthetase  30.9 
 
 		 333 aa  55.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2084  Polyprenyl synthetase  27.81 
 
 		 326 aa  55.1  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.235717  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1049  farnesyl-diphosphate synthase  29.55 
 
 		 294 aa  54.7  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  27.91 
 
 		 300 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1317  octaprenyl-diphosphate synthase  32.04 
 
 		 322 aa  54.3  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0796  octylprenyl diphosphate synthase  28.22 
 
 		 322 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1237  heptaprenyl diphosphate synthase component II  29.11 
 
 		 320 aa  54.3  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.154205  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3032  trans-hexaprenyltranstransferase  28.3 
 
 		 345 aa  54.7  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33990  geranylgeranyl pyrophosphate synthase protein  27.08 
 
 		 322 aa  54.3  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1635  dimethylallyltranstransferase  26.07 
 
 		 317 aa  53.9  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.750047  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0904  polyprenyl synthetase  26.46 
 
 		 317 aa  53.9  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.28863  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1500  polyprenyl synthetase  29.95 
 
 		 327 aa  53.9  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03052  octaprenyl diphosphate synthase  25.82 
 
 		 323 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0077638  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1417  dimethylallyltranstransferase / geranyltranstransferase  27.36 
 
 		 321 aa  53.5  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000231045  decreased coverage  0.000138058 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4498  polyprenyl synthetase  27.61 
 
 		 322 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0988  trans-hexaprenyltranstransferase  32.9 
 
 		 324 aa  53.5  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.955039  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0513  octaprenyl diphosphate synthase  25.82 
 
 		 323 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000265793  normal  0.0203333 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1400  Polyprenyl synthetase  24.59 
 
 		 286 aa  53.5  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3673  octaprenyl diphosphate synthase  25.82 
 
 		 323 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000447788  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>