290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3184 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3184  Polyprenyl synthetase  100 
 
 		 326 aa  670    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0098  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase-like protein  40.71 
 
 		 318 aa  217  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1465  Polyprenyl synthetase  26.2 
 
 		 345 aa  80.5  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2818  Polyprenyl synthetase  30.41 
 
 		 337 aa  72.8  0.000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23090  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  26.32 
 
 		 335 aa  70.1  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.55516  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2209  farnesyltranstransferase  27.76 
 
 		 325 aa  70.1  0.00000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  26.34 
 
 		 322 aa  69.7  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01980  putative isoprenoid biosynthesis related protein  23.3 
 
 		 324 aa  69.3  0.00000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1635  dimethylallyltranstransferase  25.91 
 
 		 317 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.750047  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1263  polyprenyl synthetase  24.74 
 
 		 324 aa  67.8  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0904  polyprenyl synthetase  25.91 
 
 		 317 aa  67.4  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.28863  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1042  polyprenyl synthetase  25.45 
 
 		 317 aa  67.4  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.623686 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2372  Polyprenyl synthetase  30.1 
 
 		 320 aa  67.4  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.550389  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3006  Trans-hexaprenyltranstransferase  27.6 
 
 		 324 aa  66.6  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6906  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase-like protein  30.11 
 
 		 346 aa  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13417  polyprenyl synthetase idsB  27.23 
 
 		 350 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0470  heptaprenyl diphosphate synthase component II  27.87 
 
 		 320 aa  65.1  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5714  polyprenyl synthetase  27.04 
 
 		 338 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0414957  normal  0.844261 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1417  dimethylallyltranstransferase / geranyltranstransferase  26.44 
 
 		 321 aa  64.3  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000231045  decreased coverage  0.000138058 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4051  polyprenyl synthetase  28.04 
 
 		 356 aa  63.2  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0598  Trans-hexaprenyltranstransferase  29.02 
 
 		 331 aa  62.8  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  24.77 
 
 		 317 aa  62.8  0.000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2149  heptaprenyl diphosphate synthase component II  25.1 
 
 		 320 aa  62.4  0.000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900813  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2399  farnesyltranstransferase  25.94 
 
 		 322 aa  62  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0453989  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0472  farnesyltranstransferase  28.16 
 
 		 327 aa  62  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0424008  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1816  geranyltranstransferase  27.53 
 
 		 321 aa  62  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.204305  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2166  trans-hexaprenyltranstransferase  26.8 
 
 		 320 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05420  polyprenyl synthetase  23.91 
 
 		 311 aa  61.6  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.242903  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0822  polyprenyl synthetase  28.24 
 
 		 338 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0533  polyprenyl synthetase  28.4 
 
 		 338 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.506738 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1628  Polyprenyl synthetase  26.32 
 
 		 322 aa  61.2  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.310703 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0769  Polyprenyl synthetase  30.26 
 
 		 341 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.555577 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1186  polyprenyl synthetase  25.23 
 
 		 320 aa  60.5  0.00000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3491  Polyprenyl synthetase  28.16 
 
 		 290 aa  59.7  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000932682  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1604  Polyprenyl synthetase  25.47 
 
 		 343 aa  60.1  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.643499 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21410  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  29.72 
 
 		 324 aa  60.1  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.242583  hitchhiker  0.0000164953 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0968  polyprenyl synthetase  24.36 
 
 		 313 aa  59.7  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3130  trans-hexaprenyltranstransferase  28.21 
 
 		 367 aa  59.7  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0295  trans-hexaprenyltranstransferase  26.24 
 
 		 331 aa  59.7  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1286  polyprenyl synthetase  27.46 
 
 		 338 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.916051  normal  0.252037 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3212  geranyltranstransferase  28.14 
 
 		 299 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000111364 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0636  polyprenyl synthetase  28.57 
 
 		 341 aa  58.9  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1235  Polyprenyl synthetase  26.15 
 
 		 330 aa  57.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4544  Trans-hexaprenyltranstransferase  26.15 
 
 		 352 aa  57.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4449  polyprenyl synthetase  28 
 
 		 344 aa  57.4  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0447682 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1526  Polyprenyl synthetase  21.85 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.52823  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3810  Polyprenyl synthetase  24.35 
 
 		 361 aa  57.4  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1004  Polyprenyl synthetase  25.32 
 
 		 299 aa  57  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000588963  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0680  trans-hexaprenyltranstransferase  24.12 
 
 		 322 aa  57  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000360106  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1248  Trans-hexaprenyltranstransferase  23.89 
 
 		 323 aa  57  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0784  polyprenyl synthetase  25.28 
 
 		 325 aa  56.6  0.0000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07520  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  26.13 
 
 		 337 aa  56.6  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0633826 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1103  Polyprenyl synthetase  24.34 
 
 		 324 aa  56.6  0.0000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.789784  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3558  Polyprenyl synthetase  27.27 
 
 		 324 aa  56.6  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2276  octaprenyl-diphosphate synthase  27.59 
 
 		 326 aa  56.2  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2084  Polyprenyl synthetase  24.09 
 
 		 326 aa  56.2  0.0000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.235717  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3215  Polyprenyl synthetase  26.07 
 
 		 334 aa  55.8  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.119356 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13433  multi-functional geranylgeranyl pyrophosphate synthetase idsA1: dimethylallyltransferase + geranyltranstransferase + farnesyltranstransferase  25.63 
 
 		 359 aa  55.8  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5921  Polyprenyl synthetase  28.05 
 
 		 340 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214743  normal  0.354023 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5946  Trans-hexaprenyltranstransferase  26.13 
 
 		 322 aa  55.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.112624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0461  geranyltranstransferase (farnesyl-diphosphate synthase)  25 
 
 		 325 aa  55.5  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.215839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1262  Trans-hexaprenyltranstransferase  27.27 
 
 		 320 aa  55.8  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2135  geranyltranstransferase  28.57 
 
 		 327 aa  55.5  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0551821  decreased coverage  0.00000978796 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1084  polyprenyl synthetase  25.17 
 
 		 326 aa  54.7  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1844  Polyprenyl synthetase  23.21 
 
 		 321 aa  54.7  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3361  Polyprenyl synthetase  26.99 
 
 		 322 aa  55.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00532412  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6668  Polyprenyl synthetase  27.85 
 
 		 333 aa  55.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0963  polyprenyl synthetase  24.76 
 
 		 324 aa  54.7  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728777  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2886  farnesyltranstransferase  33.33 
 
 		 320 aa  55.1  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.435226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2825  Polyprenyl synthetase  27.18 
 
 		 366 aa  54.7  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0348923 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  26 
 
 		 294 aa  55.1  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3714  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase-like protein  26.56 
 
 		 350 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000327917  normal  0.60035 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6080  polyprenyl synthetase  28.32 
 
 		 338 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.176249 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0011  Polyprenyl synthetase  27.41 
 
 		 336 aa  55.1  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1038  polyprenyl synthetase  24.87 
 
 		 319 aa  54.3  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1219  trans-hexaprenyltranstransferase  27.05 
 
 		 324 aa  53.5  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.581853 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1557  polyprenyl synthetase  24.74 
 
 		 319 aa  53.9  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1527  polyprenyl synthetase  24.74 
 
 		 319 aa  53.9  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.261183  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1905  Polyprenyl synthetase  26.98 
 
 		 338 aa  53.5  0.000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0281  trans-hexaprenyltranstransferase  24.56 
 
 		 349 aa  53.5  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0416  Polyprenyl synthetase  26.09 
 
 		 332 aa  53.1  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0642376 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0351  polyprenyl synthetase  23.87 
 
 		 289 aa  53.1  0.000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.149779  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5018  Polyprenyl synthetase  25 
 
 		 346 aa  53.1  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61988  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0394  polyprenyl synthetase  25.34 
 
 		 285 aa  53.1  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2007  trans-hexaprenyltranstransferase  23.76 
 
 		 322 aa  53.1  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00197396  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1784  polyprenyl synthetase  24.47 
 
 		 325 aa  52.8  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.60288  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5075  Polyprenyl synthetase  25.37 
 
 		 326 aa  52.8  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.581141 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2702  Trans-hexaprenyltranstransferase  25.37 
 
 		 335 aa  52.8  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  26.03 
 
 		 297 aa  52.4  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1042  Dimethylallyltranstransferase  26.41 
 
 		 332 aa  52.4  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1365  Polyprenyl synthetase  26.32 
 
 		 322 aa  52.4  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  31.31 
 
 		 322 aa  52  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03300  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  24.88 
 
 		 337 aa  52.4  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5744  Dimethylallyltranstransferase  25.13 
 
 		 323 aa  52  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  26.7 
 
 		 326 aa  52  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3215  farnesyltranstransferase  26.34 
 
 		 336 aa  52  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.153645  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1275  Polyprenyl synthetase  24.62 
 
 		 343 aa  52  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.360405  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0685  GCN5-related N-acetyltransferase  28.29 
 
 		 322 aa  52  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.27357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2592  polyprenyl synthetase  26.34 
 
 		 336 aa  51.6  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.114773 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4354  farnesyltranstransferase  27.94 
 
 		 336 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.523786  hitchhiker  0.00985531 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>