More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0636 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0636  polyprenyl synthetase  100 
 
 		 341 aa  686    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1597  Polyprenyl synthetase  38.56 
 
 		 336 aa  190  2.9999999999999997e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.813492 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0149  Trans-hexaprenyltranstransferase  39.92 
 
 		 338 aa  188  1e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0863  trans-hexaprenyltranstransferase  34.28 
 
 		 343 aa  183  3e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0603068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1814  farnesyltranstransferase  33.65 
 
 		 322 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0211  Polyprenyl synthetase  35.53 
 
 		 334 aa  179  8e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.301992 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1651  Trans-hexaprenyltranstransferase  35.83 
 
 		 322 aa  178  9e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00299697  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0510  dimethylallyltransferase  33.73 
 
 		 330 aa  175  8e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0303508 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0193  farnesyltranstransferase  36.46 
 
 		 334 aa  172  7.999999999999999e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000332441  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0164  Trans-hexaprenyltranstransferase  35.14 
 
 		 325 aa  171  2e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0195554  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0769  Polyprenyl synthetase  34.89 
 
 		 327 aa  170  3e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2517  Polyprenyl synthetase  35.56 
 
 		 322 aa  169  7e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2899  octaprenyl-diphosphate synthase  35.56 
 
 		 322 aa  169  7e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3918  dimethylallyltranstransferase  36.18 
 
 		 342 aa  169  9e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996484 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  37.97 
 
 		 332 aa  167  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1849  trans-hexaprenyltranstransferase  37.55 
 
 		 323 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0658  polyprenyl synthetase  39.18 
 
 		 341 aa  166  4e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.586121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5209  octaprenyl-diphosphate synthase  34.07 
 
 		 322 aa  166  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0409  Polyprenyl synthetase  32.96 
 
 		 317 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000164225  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4239  polyprenyl synthetase  34.06 
 
 		 326 aa  165  8e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000759134  hitchhiker  0.000000348565 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60470  octaprenyl-diphosphate synthase  34.07 
 
 		 322 aa  165  9e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.456687  normal  0.0384277 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0840  dimethylallyltranstransferase  37.1 
 
 		 327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4498  polyprenyl synthetase  39.91 
 
 		 322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3683  polyprenyl synthetase  40.08 
 
 		 322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.719488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1016  Polyprenyl synthetase  40.76 
 
 		 332 aa  164  3e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00162211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1267  farnesyltranstransferase  35.32 
 
 		 327 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000414362  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  36.86 
 
 		 322 aa  162  8.000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0796  octylprenyl diphosphate synthase  37.6 
 
 		 322 aa  161  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3032  trans-hexaprenyltranstransferase  31.29 
 
 		 345 aa  161  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0752  trans-hexaprenyltranstransferase  33.01 
 
 		 327 aa  161  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0130726 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4219  Trans-hexaprenyltranstransferase  36.82 
 
 		 345 aa  161  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5487  polyprenyl synthetase  36.72 
 
 		 359 aa  161  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.057481  normal  0.26211 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2928  trans-hexaprenyltranstransferase  35.77 
 
 		 323 aa  160  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000191483  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0687  polyprenyl synthetase  39.04 
 
 		 322 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.573498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0718  polyprenyl synthetase  39.04 
 
 		 322 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.454253  decreased coverage  0.00754032 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0719  polyprenyl synthetase  39.04 
 
 		 322 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0700  trans-hexaprenyltranstransferase  38.16 
 
 		 322 aa  160  4e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3278  polyprenyl synthetase  33.99 
 
 		 313 aa  160  4e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000293097 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03732  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase  30.89 
 
 		 324 aa  160  4e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100816  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0963  polyprenyl synthetase  34.86 
 
 		 324 aa  159  7e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728777  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1983  octaprenyl diphosphate synthase  32.47 
 
 		 322 aa  159  8e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.977315  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3090  trans-hexaprenyltranstransferase  31.58 
 
 		 323 aa  158  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  33.33 
 
 		 333 aa  158  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3205  octaprenyl-diphosphate synthase  34.46 
 
 		 322 aa  157  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.192377  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0340  trans-hexaprenyltranstransferase  33.98 
 
 		 321 aa  157  2e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104163  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40810  Trans-hexaprenyltranstransferase  37.6 
 
 		 322 aa  157  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.368005  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2004  Trans-hexaprenyltranstransferase  37.99 
 
 		 322 aa  157  2e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3450  Polyprenyl synthetase  34.37 
 
 		 330 aa  157  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.024256  hitchhiker  0.00543361 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  37.79 
 
 		 322 aa  157  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1687  farnesyl pyrophosphate synthetase  29.65 
 
 		 332 aa  155  7e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0622197  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4513  octaprenyl-diphosphate synthase  29.34 
 
 		 327 aa  155  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0506  octylprenyl-diphosphate synthase  34.37 
 
 		 330 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.282953  normal  0.531544 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0833  trans-hexaprenyltranstransferase  37.3 
 
 		 322 aa  155  1e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2653  polyprenyl synthetase  35.49 
 
 		 330 aa  155  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00415418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0742  trans-hexaprenyltranstransferase  37.99 
 
 		 333 aa  154  2e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.247757  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1007  phage tail region protein  31.92 
 
 		 320 aa  154  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000193077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2220  trans-hexaprenyltranstransferase  37.44 
 
 		 322 aa  154  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000307661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0657  polyprenyl synthetase  37.99 
 
 		 333 aa  154  2e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1068  polyprenyl synthetase  34.06 
 
 		 331 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000253104  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2582  hypothetical protein  32.12 
 
 		 322 aa  153  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4861  polyprenyl synthetase  38.6 
 
 		 322 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.615334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0492  polyprenyl synthetase family protein  29.34 
 
 		 332 aa  154  2.9999999999999998e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000926468  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1035  polyprenyl synthetase  34.06 
 
 		 331 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000587704  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0966  polyprenyl synthetase  34.06 
 
 		 331 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000309131  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3497  octaprenyl diphosphate synthase  32.32 
 
 		 370 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000502837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3602  octaprenyl diphosphate synthase  32.32 
 
 		 370 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0102331  normal  0.778789 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1574  octaprenyl-diphosphate synthase  29.43 
 
 		 349 aa  153  4e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.836554 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3566  octaprenyl diphosphate synthase  32.32 
 
 		 370 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000499434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3664  octaprenyl diphosphate synthase  32.32 
 
 		 370 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000479372  normal  0.0578061 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0360  octaprenyl-diphosphate synthase  32.92 
 
 		 323 aa  153  4e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00089716  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3495  octaprenyl diphosphate synthase  32.32 
 
 		 370 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000567296  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2823  octaprenyl-diphosphate synthase  35.92 
 
 		 322 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000462084  normal  0.156809 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2709  hypothetical protein  31.87 
 
 		 322 aa  152  7e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0158  polyprenyl synthetase  43.91 
 
 		 320 aa  152  7e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3739  trans-hexaprenyltranstransferase  31.65 
 
 		 323 aa  152  7e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000225438  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0840  trans-hexaprenyltranstransferase  35.92 
 
 		 327 aa  152  8e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.24671  normal  0.90387 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1534  Polyprenyl synthetase  33.12 
 
 		 324 aa  152  8e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3380  octaprenyl diphosphate synthase  30.42 
 
 		 323 aa  152  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3954399999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0868  trans-hexaprenyltranstransferase  31.46 
 
 		 323 aa  151  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000612724  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0557  octaprenyl diphosphate synthase  32.2 
 
 		 323 aa  152  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000813107  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2524  octaprenyl-diphosphate synthase  36.84 
 
 		 330 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0921642  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2959  trans-hexaprenyltranstransferase  37.35 
 
 		 325 aa  151  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0367555  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0447  octaprenyl-diphosphate synthase  36.84 
 
 		 330 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3257  octaprenyl-diphosphate synthase  36.84 
 
 		 330 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1756  trans-hexaprenyltranstransferase  29.43 
 
 		 344 aa  151  1e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.726809  normal  0.071428 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3491  octaprenyl-diphosphate synthase  36.84 
 
 		 330 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.133442  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1306  octaprenyl-diphosphate synthase  36.84 
 
 		 330 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3483  octaprenyl diphosphate synthase  30.42 
 
 		 323 aa  151  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000324786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0524  octaprenyl-diphosphate synthase  33.62 
 
 		 331 aa  151  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03052  octaprenyl diphosphate synthase  30.42 
 
 		 323 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0077638  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0520  Polyprenyl synthetase  30.42 
 
 		 323 aa  151  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000996752  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1188  Polyprenyl synthetase  40.49 
 
 		 324 aa  151  2e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000116702  normal  0.535135 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3527  octaprenyl-diphosphate synthase  36.84 
 
 		 332 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.491243  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03003  hypothetical protein  30.42 
 
 		 323 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00507808  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3583  octaprenyl diphosphate synthase  30.42 
 
 		 323 aa  151  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000015877  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4509  octaprenyl diphosphate synthase  30.42 
 
 		 323 aa  151  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000159787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0513  octaprenyl diphosphate synthase  30.42 
 
 		 323 aa  151  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000265793  normal  0.0203333 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3673  octaprenyl diphosphate synthase  30.42 
 
 		 323 aa  151  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000447788  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1003  polyprenyl synthetase  30.49 
 
 		 323 aa  150  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000127512  decreased coverage  0.00000500836 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0473  trans-hexaprenyltranstransferase  37.5 
 
 		 337 aa  150  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.521014  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>