More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2231 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2231  polyprenyl synthetase  100 
 
 		 341 aa  711    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.317213  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0470  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.4 
 
 		 320 aa  105  8e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5018  Polyprenyl synthetase  36.5 
 
 		 346 aa  100  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61988  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0763  Polyprenyl synthetase  34.8 
 
 		 346 aa  99.4  9e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2149  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.74 
 
 		 320 aa  96.3  6e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900813  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2209  farnesyltranstransferase  28.28 
 
 		 325 aa  95.1  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1997  Polyprenyl synthetase  32.34 
 
 		 368 aa  93.6  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0211657  normal  0.0925303 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0394  polyprenyl synthetase  32.67 
 
 		 285 aa  93.6  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2399  farnesyltranstransferase  29.1 
 
 		 322 aa  93.6  4e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0453989  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  32.67 
 
 		 322 aa  93.2  6e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5487  polyprenyl synthetase  32.17 
 
 		 359 aa  92.4  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.057481  normal  0.26211 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1438  heptaprenyl diphosphate synthase component II  33.33 
 
 		 320 aa  91.7  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2582  hypothetical protein  29.72 
 
 		 322 aa  91.3  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1237  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.39 
 
 		 320 aa  91.7  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.154205  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  30.63 
 
 		 332 aa  91.7  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2823  octaprenyl-diphosphate synthase  31.96 
 
 		 322 aa  90.9  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000462084  normal  0.156809 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2709  hypothetical protein  29.72 
 
 		 322 aa  90.9  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1396  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.8 
 
 		 323 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.947918  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3775  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.8 
 
 		 320 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0992348  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1424  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.8 
 
 		 323 aa  90.1  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1396  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.8 
 
 		 323 aa  90.1  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1535  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.8 
 
 		 320 aa  90.1  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0794192  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1608  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.8 
 
 		 320 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00241713 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1570  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.8 
 
 		 320 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0822  polyprenyl synthetase  32.67 
 
 		 338 aa  89.7  6e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5924  Trans-hexaprenyltranstransferase  35.64 
 
 		 323 aa  89.7  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1641  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.8 
 
 		 320 aa  89.7  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0641659  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13433  multi-functional geranylgeranyl pyrophosphate synthetase idsA1: dimethylallyltransferase + geranyltranstransferase + farnesyltranstransferase  30.51 
 
 		 359 aa  89.7  7e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1677  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.8 
 
 		 320 aa  89.4  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3324  Polyprenyl synthetase  29.82 
 
 		 331 aa  89  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000403675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1417  dimethylallyltranstransferase / geranyltranstransferase  30.05 
 
 		 321 aa  89  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000231045  decreased coverage  0.000138058 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  33.69 
 
 		 326 aa  89  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0966  polyprenyl synthetase  29.82 
 
 		 331 aa  89  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000309131  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1035  polyprenyl synthetase  29.82 
 
 		 331 aa  89  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000587704  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1068  polyprenyl synthetase  29.82 
 
 		 331 aa  89  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000253104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  30.43 
 
 		 322 aa  87.8  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  30.04 
 
 		 299 aa  87.8  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1248  Trans-hexaprenyltranstransferase  33.15 
 
 		 323 aa  87.8  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1816  geranyltranstransferase  29.5 
 
 		 321 aa  88.2  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.204305  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2166  trans-hexaprenyltranstransferase  29.57 
 
 		 320 aa  87.4  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0840  dimethylallyltranstransferase  32.82 
 
 		 327 aa  87.4  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0211  Polyprenyl synthetase  28.67 
 
 		 334 aa  87.4  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.301992 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  30.04 
 
 		 299 aa  87  4e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2412  Dimethylallyltranstransferase  28.87 
 
 		 322 aa  87  4e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033108 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1365  Polyprenyl synthetase  30.14 
 
 		 322 aa  87  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0851  polyprenyl synthetase  32.98 
 
 		 323 aa  87  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000684066  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0193  farnesyltranstransferase  32.99 
 
 		 334 aa  87  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000332441  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1849  trans-hexaprenyltranstransferase  32.55 
 
 		 323 aa  87  4e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1003  polyprenyl synthetase  33.16 
 
 		 323 aa  86.7  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000127512  decreased coverage  0.00000500836 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2886  farnesyltranstransferase  26.45 
 
 		 320 aa  86.7  5e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.435226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0636  polyprenyl synthetase  34.85 
 
 		 341 aa  86.7  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0472  farnesyltranstransferase  32.45 
 
 		 327 aa  86.3  8e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0424008  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1692  Trans-hexaprenyltranstransferase  33.33 
 
 		 321 aa  86.3  8e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  33.85 
 
 		 322 aa  86.3  8e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3068  Polyprenyl synthetase  31.48 
 
 		 325 aa  85.9  9e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3006  Trans-hexaprenyltranstransferase  28.52 
 
 		 324 aa  85.9  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4219  Trans-hexaprenyltranstransferase  30 
 
 		 345 aa  85.5  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5714  polyprenyl synthetase  31.25 
 
 		 338 aa  85.5  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0414957  normal  0.844261 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1275  Polyprenyl synthetase  31 
 
 		 343 aa  85.5  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.360405  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1235  polyprenyl synthetase  33.16 
 
 		 300 aa  85.9  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.347308  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3107  polyprenyl synthetase  33.19 
 
 		 325 aa  85.9  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.339313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  30.65 
 
 		 317 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1016  Polyprenyl synthetase  29.24 
 
 		 332 aa  84.7  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00162211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0769  Polyprenyl synthetase  31.28 
 
 		 327 aa  84.7  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3090  trans-hexaprenyltranstransferase  27.55 
 
 		 323 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0281  trans-hexaprenyltranstransferase  25.71 
 
 		 349 aa  85.1  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1206  polyprenyl synthetase  29.95 
 
 		 334 aa  85.1  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.513986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2592  polyprenyl synthetase  30.26 
 
 		 336 aa  84  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.114773 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0953  trans-hexaprenyltranstransferase  32.24 
 
 		 323 aa  84  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0940385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0158  polyprenyl synthetase  36.17 
 
 		 320 aa  84.3  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0165  polyprenyl synthetase  30.92 
 
 		 334 aa  84.3  0.000000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1286  polyprenyl synthetase  30.77 
 
 		 338 aa  84  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.916051  normal  0.252037 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3354  trans-hexaprenyltranstransferase  29.53 
 
 		 331 aa  84  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00431304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2031  trans-hexaprenyltranstransferase  33.85 
 
 		 333 aa  83.2  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3376  polyprenyl synthetase  33.7 
 
 		 322 aa  83.2  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0295  trans-hexaprenyltranstransferase  26.74 
 
 		 331 aa  83.2  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  32.49 
 
 		 333 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0776  farnesyl-diphosphate synthase  30.7 
 
 		 301 aa  82.8  0.000000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  30.9 
 
 		 300 aa  82.8  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1983  octaprenyl diphosphate synthase  27.66 
 
 		 322 aa  82.8  0.000000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.977315  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0483  Polyprenyl synthetase  28.37 
 
 		 343 aa  82.8  0.000000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  30.47 
 
 		 300 aa  82.8  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1262  Trans-hexaprenyltranstransferase  28.99 
 
 		 320 aa  82.8  0.000000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2956  Polyprenyl synthetase  36.07 
 
 		 308 aa  82.4  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.660662  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0868  trans-hexaprenyltranstransferase  28.16 
 
 		 323 aa  82  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000612724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1186  polyprenyl synthetase  28.57 
 
 		 320 aa  82.4  0.00000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0691  polyprenyl synthetase  29.21 
 
 		 279 aa  82  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0270434  hitchhiker  0.00000384751 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2928  trans-hexaprenyltranstransferase  33.16 
 
 		 323 aa  82  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000191483  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3742  farnesyltranstransferase  31.03 
 
 		 336 aa  82.4  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.326793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0904  polyprenyl synthetase  26.34 
 
 		 317 aa  82  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.28863  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0360  octaprenyl-diphosphate synthase  27.76 
 
 		 323 aa  81.6  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00089716  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17563  predicted protein  27.67 
 
 		 312 aa  81.6  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0164113  normal  0.0513256 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2048  Polyprenyl synthetase  32.54 
 
 		 348 aa  81.6  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.225827  normal  0.179552 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  32.19 
 
 		 300 aa  81.6  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2818  Polyprenyl synthetase  35.6 
 
 		 337 aa  81.6  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  31.33 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4354  farnesyltranstransferase  29.3 
 
 		 336 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.523786  hitchhiker  0.00985531 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004257  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  32.34 
 
 		 294 aa  81.6  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07520  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  28.96 
 
 		 337 aa  81.3  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0633826 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0351  polyprenyl synthetase  30.33 
 
 		 289 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.149779  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>