96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2951 on replicon NC_009939
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009939  Dgeo_2951  ATPase involved in conjugal plasmid transfer TRAG  100 
 
 		 935 aa  1923    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0509  Type IV secretory pathway VirD4 protein  28.39 
 
 		 789 aa  183  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.453337 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0522  Type IV secretory pathway VirD4 protein  28.59 
 
 		 761 aa  180  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.155716 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3625  TRAG family protein  25.93 
 
 		 742 aa  168  5e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0365  TRAG protein  24.88 
 
 		 661 aa  90.9  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00756366  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2519  TRAG family protein  23.99 
 
 		 625 aa  78.2  0.0000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.166499  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1362  TRAG family protein  22.38 
 
 		 663 aa  68.9  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.824009  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0247  putative type IV secretory pathway protein VirD4  22.22 
 
 		 648 aa  65.5  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.865084 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4192  TRAG family protein  24.78 
 
 		 570 aa  64.7  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5823  TRAG family protein  23.89 
 
 		 651 aa  64.3  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3323  TRAG family protein  24.78 
 
 		 570 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0815  TRAG family protein  24.22 
 
 		 648 aa  63.9  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.805111  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1185  TRAG family protein  24.9 
 
 		 630 aa  63.9  0.00000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4843  TRAG protein  26.8 
 
 		 557 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0172  TRAG family protein  22.38 
 
 		 594 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.218422 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0458  putative type IV secretory pathway protein VirD4  21.68 
 
 		 593 aa  62.8  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.626492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1764  putative type IV secretory pathway protein VirD4  21.5 
 
 		 575 aa  62.4  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347607  normal  0.197247 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0976  TRAG family protein  27.23 
 
 		 912 aa  61.6  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2647  putative Type IV secretory pathway protein VirD4  22.14 
 
 		 576 aa  61.6  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0788  TRAG family protein  27.91 
 
 		 590 aa  59.7  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6495  TRAG family protein  24.19 
 
 		 583 aa  58.5  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0724  conjugal transfer coupling protein TraG  25.2 
 
 		 668 aa  57.4  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2469  transfer complex protein TrsK-like protein  23.68 
 
 		 569 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0805174 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0821  TRAG family protein  21.32 
 
 		 673 aa  56.6  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.153462  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4193  conjugal transfer coupling protein TraG  24.9 
 
 		 663 aa  57  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3886  transfer complex protein TrsK-like protein  23.68 
 
 		 569 aa  55.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0680  agrobacteirum virulence protein VirD4  23.77 
 
 		 554 aa  55.8  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0018  type IV secretion system component VirD4  20.09 
 
 		 723 aa  55.1  0.000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.512537  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18910  type IV secretory pathway, VirD4 component  27.91 
 
 		 627 aa  55.5  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.755696  normal  0.106526 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1893  conjugal transfer coupling protein TraG  24.9 
 
 		 670 aa  55.1  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2025  conjugal transfer coupling protein TraG  25.59 
 
 		 678 aa  55.1  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0040  type IV secretion system component VirD4  22.63 
 
 		 714 aa  54.7  0.000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4169  TRAG protein  21.92 
 
 		 678 aa  54.7  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1502  TRAG family protein  24.28 
 
 		 610 aa  54.7  0.000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.343787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0440  conjugal transfer coupling protein TraG  24.9 
 
 		 673 aa  54.7  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1970  TRAG family protein  27.97 
 
 		 580 aa  54.7  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30960  conjugal transfer coupling protein TraG  24.9 
 
 		 666 aa  54.7  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000501937  unclonable  1.70004e-21 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2913  conjugal transfer coupling protein TraG  24.9 
 
 		 665 aa  54.7  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35740  conjugal transfer coupling protein TraG  24.9 
 
 		 666 aa  53.9  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1548  conjugal transfer coupling protein TraG  24.9 
 
 		 664 aa  54.3  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.11101  normal  0.84656 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2344  conjugal transfer coupling protein TraG  21 
 
 		 723 aa  53.9  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.743545  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2701  conjugal transfer coupling protein TraG  24.9 
 
 		 669 aa  53.9  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.143285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0593  TRAG protein  31.82 
 
 		 575 aa  54.3  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3708  conjugal transfer coupling protein TraG  24.9 
 
 		 669 aa  54.3  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2586  conjugal transfer coupling protein TraG  24.8 
 
 		 675 aa  53.1  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0689  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  24.45 
 
 		 636 aa  53.9  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.01424  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1280  conjugal transfer coupling protein TraG  24.51 
 
 		 665 aa  53.5  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3508  conjugal transfer coupling protein TraG  24.9 
 
 		 667 aa  52.8  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1805  TRAG family protein  23.26 
 
 		 598 aa  52.8  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2348  conjugal transfer coupling protein TraG  24.51 
 
 		 669 aa  53.1  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.801098 
 
 
-
 
NC_002978  WD0008  type IV secretion system component VirD4  19.67 
 
 		 648 aa  52  0.00005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.325178  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2643  conjugal transfer coupling protein TraG  24.8 
 
 		 672 aa  52  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0894  TRAG family protein  23.37 
 
 		 627 aa  50.8  0.0001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3905  hypothetical protein  29.41 
 
 		 760 aa  50.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1514  TRAG family protein  26.16 
 
 		 606 aa  50.8  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4368  TRAG family protein  21.72 
 
 		 713 aa  50.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.538935 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3153  TRAG family protein  23.03 
 
 		 762 aa  49.7  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4706  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  20.58 
 
 		 490 aa  50.1  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.220064  normal  0.843758 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4273  conjugative transfer gene complex protein  23.42 
 
 		 591 aa  49.7  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0162  hypothetical protein  23.28 
 
 		 633 aa  50.1  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0180  hypothetical protein  23.52 
 
 		 633 aa  49.3  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1833  conjugal transfer coupling protein TraG  24.8 
 
 		 687 aa  49.3  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2530  TRAG family protein  25.09 
 
 		 661 aa  48.9  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.684984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2256  conjugal transfer coupling protein TraG  25.2 
 
 		 573 aa  48.9  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1339  conjugal transfer coupling protein TraG  24.48 
 
 		 664 aa  49.3  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.953058  normal  0.786812 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0918  TRAG family protein  25.1 
 
 		 677 aa  48.5  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4308  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  29.17 
 
 		 840 aa  48.5  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0280519 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2002  conjugal transfer coupling protein TraG  27.75 
 
 		 665 aa  48.5  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0417239  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2618  conjugal transfer coupling protein TraG  24.51 
 
 		 687 aa  47.8  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3188  conjugal transfer coupling protein TraG  24.71 
 
 		 669 aa  47.8  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0452  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  26.59 
 
 		 621 aa  47.8  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3903  conjugal transfer coupling protein TraG  25.3 
 
 		 665 aa  47.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.342715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0047  TraG/TraD family protein  25.69 
 
 		 620 aa  47.8  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0007  hypothetical protein  24.12 
 
 		 628 aa  47.8  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0320  conjugal transfer coupling protein TraG  24.71 
 
 		 661 aa  46.6  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0236522  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2738  TRAG family protein  25 
 
 		 606 aa  46.6  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0023  transfer complex protein TrsK-like  22.7 
 
 		 588 aa  46.6  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3006  conjugal transfer coupling protein TraG  24.71 
 
 		 663 aa  46.6  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0044  hypothetical protein  23.14 
 
 		 608 aa  46.2  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.612223  normal  0.249044 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2246  Type IV secretory pathway VirD4 components-like  23.48 
 
 		 506 aa  45.8  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3849  conjugal transfer coupling protein TraG  22.92 
 
 		 664 aa  45.4  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00986433  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3548  conjugal transfer coupling protein TraG  22.83 
 
 		 664 aa  45.8  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1733  conjugal transfer coupling protein TraG  22.92 
 
 		 660 aa  45.4  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0092  TaxB  23.02 
 
 		 611 aa  45.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.393332 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1576  Type IV secretory pathway VirD4 components-like  22.71 
 
 		 453 aa  45.4  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540203  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0862  TRAG family protein  24.6 
 
 		 677 aa  45.1  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.777114 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4194  hypothetical protein  30.12 
 
 		 665 aa  45.1  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0224168 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0701  conjugal transfer coupling protein TraG  24.71 
 
 		 661 aa  45.1  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0589  conjugal transfer coupling protein TraG  24.71 
 
 		 659 aa  45.1  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0142  conjugal transfer coupling protein TraG  24.71 
 
 		 674 aa  44.7  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6143  type IV secretion system protein VirD4  22.78 
 
 		 548 aa  44.7  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0647  conjugal transfer coupling protein TraG  21.26 
 
 		 637 aa  45.1  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.600969  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1506  conjugal transfer coupling protein TraG  24.77 
 
 		 661 aa  44.7  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3560  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  23.67 
 
 		 604 aa  44.7  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.486257  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2327  conjugal transfer coupling protein TraG  25.2 
 
 		 662 aa  44.7  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.58309  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1316  TRAG family protein  24.06 
 
 		 670 aa  44.7  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>