100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0522 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_0509  Type IV secretory pathway VirD4 protein  81.32 
 
 		 789 aa  1187    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.453337 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0522  Type IV secretory pathway VirD4 protein  100 
 
 		 761 aa  1528    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.155716 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2951  ATPase involved in conjugal plasmid transfer TRAG  28.27 
 
 		 935 aa  198  3e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3625  TRAG family protein  28.27 
 
 		 742 aa  197  7e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0365  TRAG protein  25.76 
 
 		 661 aa  94.4  7e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00756366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3794  TRAG protein  24.95 
 
 		 668 aa  75.1  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0170  cmgd4  21.5 
 
 		 658 aa  73.9  0.00000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.035471  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5000  TRAG family protein  23.61 
 
 		 670 aa  72.8  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0815  TRAG family protein  23.87 
 
 		 648 aa  72.4  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.805111  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1185  TRAG family protein  21.33 
 
 		 630 aa  71.2  0.00000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3655  TRAG family protein  24.73 
 
 		 667 aa  70.1  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.291322  decreased coverage  0.00000244512 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3988  TRAG family protein  24.51 
 
 		 670 aa  70.1  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.420427  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0040  cmgD4  20.59 
 
 		 603 aa  68.9  0.0000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1805  TRAG family protein  21.64 
 
 		 598 aa  68.2  0.0000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0821  TRAG family protein  23.66 
 
 		 673 aa  67  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.153462  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0247  putative type IV secretory pathway protein VirD4  23.51 
 
 		 648 aa  67  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.865084 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1362  TRAG family protein  25.16 
 
 		 663 aa  67  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.824009  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2519  TRAG family protein  22.52 
 
 		 625 aa  66.2  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.166499  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0023  transfer complex protein TrsK-like  21.98 
 
 		 588 aa  66.6  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6495  TRAG family protein  23.78 
 
 		 583 aa  65.5  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1514  TRAG family protein  21.81 
 
 		 606 aa  64.7  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0044  hypothetical protein  22.96 
 
 		 608 aa  63.5  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.612223  normal  0.249044 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4368  TRAG family protein  23.76 
 
 		 713 aa  62  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.538935 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0788  TRAG family protein  27.46 
 
 		 590 aa  61.6  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5823  TRAG family protein  24.01 
 
 		 651 aa  60.8  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0458  putative type IV secretory pathway protein VirD4  23.56 
 
 		 593 aa  60.8  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.626492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4554  TRAG family protein  23.34 
 
 		 695 aa  60.1  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.337664  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0843  TRAG family protein  22.91 
 
 		 682 aa  58.9  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18910  type IV secretory pathway, VirD4 component  25.54 
 
 		 627 aa  58.5  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.755696  normal  0.106526 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0894  TRAG family protein  20.23 
 
 		 627 aa  58.5  0.0000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1502  TRAG family protein  26.22 
 
 		 610 aa  57.8  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.343787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2738  TRAG family protein  22.08 
 
 		 606 aa  57.8  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0751  conjugal transfer coupling protein TraG  24.02 
 
 		 661 aa  56.2  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3006  conjugal transfer coupling protein TraG  23.6 
 
 		 663 aa  56.2  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5331  TRAG family protein  21.17 
 
 		 658 aa  55.5  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.390385 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5456  transfer complex protein TrsK-like protein  24.48 
 
 		 638 aa  55.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5695  transfer complex protein TrsK-like protein  24.48 
 
 		 638 aa  55.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.604846 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0968  conjugal transfer coupling protein TraG  24.89 
 
 		 666 aa  55.1  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4192  TRAG family protein  23.21 
 
 		 570 aa  54.7  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2327  conjugal transfer coupling protein TraG  23.3 
 
 		 662 aa  54.7  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.58309  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2647  putative Type IV secretory pathway protein VirD4  23.5 
 
 		 576 aa  54.7  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2876  conjugal transfer coupling protein TraG  24.02 
 
 		 662 aa  53.9  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.333866 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6396  TRAG family protein  22.08 
 
 		 699 aa  53.5  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.969912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1764  putative type IV secretory pathway protein VirD4  23.11 
 
 		 575 aa  53.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347607  normal  0.197247 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4843  TRAG protein  22.97 
 
 		 557 aa  52.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3323  TRAG family protein  22.97 
 
 		 570 aa  53.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3084  conjugal transfer coupling protein TraG  23.87 
 
 		 661 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.847978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9810  conjugative coupling protein  22.91 
 
 		 699 aa  53.1  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8210  type IV secretion system protein VirD4  21.33 
 
 		 663 aa  52.4  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.493038  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0680  agrobacteirum virulence protein VirD4  24.19 
 
 		 554 aa  52.4  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2490  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  22.32 
 
 		 629 aa  52  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0320  conjugal transfer coupling protein TraG  23.97 
 
 		 661 aa  52.4  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0236522  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2467  TRAG family protein  22.83 
 
 		 511 aa  51.6  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.606871  hitchhiker  0.00000000721319 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1821  putative type IV secretory pathway VirD4 component  26.13 
 
 		 565 aa  51.2  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.49149 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2002  conjugal transfer coupling protein TraG  23.33 
 
 		 665 aa  51.2  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0417239  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2344  conjugal transfer coupling protein TraG  21.89 
 
 		 723 aa  50.8  0.00009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.743545  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3849  conjugal transfer coupling protein TraG  24.03 
 
 		 664 aa  50.1  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00986433  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7739  conjugal transfer coupling protein TraG  23.95 
 
 		 661 aa  50.4  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.477093 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3903  conjugal transfer coupling protein TraG  23.52 
 
 		 665 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.342715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3982  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  23.58 
 
 		 776 aa  50.1  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4193  conjugal transfer coupling protein TraG  23.78 
 
 		 663 aa  50.1  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3193  conjugal transfer coupling protein TraG  23.55 
 
 		 661 aa  50.1  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0684551  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1493  conjugal transfer coupling protein TraG  22.52 
 
 		 700 aa  49.3  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00200644  normal  0.246461 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4169  TRAG protein  22.59 
 
 		 678 aa  48.9  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3905  hypothetical protein  22.43 
 
 		 760 aa  48.9  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0701  conjugal transfer coupling protein TraG  23.66 
 
 		 661 aa  48.9  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1833  conjugal transfer coupling protein TraG  24.2 
 
 		 687 aa  48.5  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2348  conjugal transfer coupling protein TraG  22.57 
 
 		 669 aa  48.9  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.801098 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1893  conjugal transfer coupling protein TraG  23.68 
 
 		 670 aa  48.5  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30960  conjugal transfer coupling protein TraG  23.56 
 
 		 666 aa  48.5  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000501937  unclonable  1.70004e-21 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2184  Type IV secretory pathway VirD4 components-like  22.54 
 
 		 798 aa  48.5  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3508  conjugal transfer coupling protein TraG  23.32 
 
 		 667 aa  48.1  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3708  conjugal transfer coupling protein TraG  23.11 
 
 		 669 aa  48.1  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6215  TRAG family protein  21.84 
 
 		 902 aa  48.1  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.371474 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2643  conjugal transfer coupling protein TraG  23.67 
 
 		 672 aa  48.1  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3539  conjugal transfer coupling protein TraG  24.02 
 
 		 663 aa  47.8  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1196  conjugal transfer coupling protein TraG  24.02 
 
 		 663 aa  47.8  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0400673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2618  conjugal transfer coupling protein TraG  22.89 
 
 		 687 aa  47  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3886  transfer complex protein TrsK-like protein  20.15 
 
 		 569 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1023  conjugal transfer coupling protein TraG  22.83 
 
 		 660 aa  47.4  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08203  conjugal transfer protein TraK  26.22 
 
 		 592 aa  47.4  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0440  conjugal transfer coupling protein TraG  23.7 
 
 		 673 aa  47.4  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0038  hypothetical protein  20.6 
 
 		 667 aa  47.4  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.140641  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3153  TRAG family protein  26.67 
 
 		 762 aa  46.6  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2425  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  21.94 
 
 		 616 aa  46.6  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146549  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4007  conjugal transfer coupling protein TraG  22.89 
 
 		 659 aa  46.2  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35740  conjugal transfer coupling protein TraG  23.56 
 
 		 666 aa  46.2  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2256  conjugal transfer coupling protein TraG  26.26 
 
 		 573 aa  46.2  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0738  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  23.21 
 
 		 557 aa  45.4  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1506  conjugal transfer coupling protein TraG  23.81 
 
 		 661 aa  46.2  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5397  hypothetical protein  21.03 
 
 		 562 aa  45.8  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2586  conjugal transfer coupling protein TraG  23.37 
 
 		 675 aa  45.4  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7522  TRAG family protein  23 
 
 		 601 aa  45.4  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.445518  normal  0.175078 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4436  TRAG protein  21.09 
 
 		 714 aa  45.1  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0724  conjugal transfer coupling protein TraG  23.19 
 
 		 668 aa  45.1  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2913  conjugal transfer coupling protein TraG  23.9 
 
 		 665 aa  45.1  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1280  conjugal transfer coupling protein TraG  24.95 
 
 		 665 aa  45.1  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7438  conjugal transfer coupling protein TraG  23.52 
 
 		 660 aa  44.7  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291662  normal  0.932105 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2701  conjugal transfer coupling protein TraG  22.9 
 
 		 669 aa  44.7  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.143285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0689  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  23.47 
 
 		 636 aa  44.7  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.01424  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>