More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3724 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3724  Rhs family protein-like protein  100 
 
 		 285 aa  592  1e-168  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0108015  hitchhiker  0.00111387 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3720  YD repeat-containing protein  93.98 
 
 		 1301 aa  266  4e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.148361  decreased coverage  0.000379992 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3726  hypothetical protein  89.8 
 
 		 222 aa  185  6e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.01295  hitchhiker  0.00196674 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3727  hypothetical protein  77.31 
 
 		 187 aa  176  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00259449  hitchhiker  0.0064722 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  42.86 
 
 		 1467 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  43.7 
 
 		 1381 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  47.62 
 
 		 690 aa  108  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00355  putative RHS-related transmembrane protein  40.69 
 
 		 741 aa  106  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  43.7 
 
 		 903 aa  106  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2322  YD repeat-containing protein  39.01 
 
 		 913 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.330208  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05537  putative RHS-related protein  41.54 
 
 		 764 aa  101  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.285743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  45.38 
 
 		 927 aa  100  4e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04760  putative RHS-related protein  39.26 
 
 		 788 aa  99.4  7e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05695  putative RHS-related protein  39.26 
 
 		 788 aa  99.4  7e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05526  putative RHS-related protein  40.77 
 
 		 705 aa  97.1  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0410  YD repeat-containing protein  39.1 
 
 		 1189 aa  97.1  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0341  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  41.98 
 
 		 1527 aa  96.7  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1899  YD repeat-containing protein  40.77 
 
 		 423 aa  96.7  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.126482  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  42.86 
 
 		 1520 aa  96.3  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  40.77 
 
 		 1429 aa  96.3  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0130  Rhs family protein-like protein  44.35 
 
 		 303 aa  93.6  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00908  putative RSH-related protein  39.23 
 
 		 319 aa  93.6  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.303359 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4992  YD repeat-containing protein  40.32 
 
 		 451 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5510  YD repeat-containing protein  38.69 
 
 		 1390 aa  92.8  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.162905  normal  0.931179 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2298  YD repeat protein  39.26 
 
 		 1338 aa  91.7  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4995  RHS protein  39.68 
 
 		 171 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  44.62 
 
 		 1611 aa  90.1  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  42.48 
 
 		 1609 aa  89.4  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  31.31 
 
 		 1527 aa  89.4  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04849  RhsD protein  39.71 
 
 		 917 aa  89.4  7e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0148662  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0254  RhsG core protein with extension  42.5 
 
 		 502 aa  89  9e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.814194 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0437  YD repeat-containing protein  40.5 
 
 		 598 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161008 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0244  protein RhsH  32.75 
 
 		 1417 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2521  YD repeat-containing protein  37.5 
 
 		 1509 aa  88.6  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4482  YD repeat-containing protein  41.8 
 
 		 1528 aa  88.6  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0252  RHS Repeat family protein  38.58 
 
 		 1410 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.661469 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5261  YD repeat-containing protein  39.06 
 
 		 1487 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792751 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  38.71 
 
 		 1409 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  37.68 
 
 		 1981 aa  87.8  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  40.48 
 
 		 1518 aa  87  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00576  RhsD protein  40 
 
 		 613 aa  87  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03450  predicted Rhs-family protein  39.84 
 
 		 314 aa  87  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03401  hypothetical protein  39.84 
 
 		 233 aa  87  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0118  RHS protein  39.84 
 
 		 312 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.604872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4094  RHS domain-containing protein  39.84 
 
 		 314 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.700312  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  39.5 
 
 		 1560 aa  86.7  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3802  Rhs family protein  39.84 
 
 		 314 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.276743  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  36.11 
 
 		 1433 aa  86.7  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4010  protein rhsA precursor  39.84 
 
 		 1388 aa  85.9  8e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3233  YD repeat protein  40.46 
 
 		 1639 aa  85.5  8e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.471244  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  41.03 
 
 		 1551 aa  85.9  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2508  YD repeat-containing protein  39.85 
 
 		 1699 aa  85.5  8e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0105853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1235  hypothetical protein  34.94 
 
 		 1405 aa  85.5  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.617923 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  39.17 
 
 		 1411 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2525  YD repeat-containing protein  35.34 
 
 		 561 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.949888 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3344  PAAR  37.69 
 
 		 1494 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0030504  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5023  YD repeat-containing protein  37.69 
 
 		 1494 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00366927  normal  0.185239 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  41.88 
 
 		 1550 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0355  YD repeat-containing protein  39.52 
 
 		 414 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  37.96 
 
 		 1385 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2646  RHS protein  39.67 
 
 		 583 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2813  YD repeat protein  38.16 
 
 		 1673 aa  84.3  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1945  YD repeat-containing protein  36.96 
 
 		 605 aa  84.3  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.312246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4990  YD repeat-containing protein  38.74 
 
 		 867 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2441  hypothetical protein  60.94 
 
 		 232 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2251  YD repeat protein  35.4 
 
 		 1577 aa  82.8  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  36.51 
 
 		 1547 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4988  YD repeat-containing protein  39.02 
 
 		 480 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0333  RHS/YD repeat-containing protein  37.97 
 
 		 1418 aa  83.2  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4965  Rhs family protein  39.02 
 
 		 1409 aa  82.8  0.000000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.832182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0321  Rhs family protein  41.67 
 
 		 1359 aa  82.4  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.73436  hitchhiker  0.000636537 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  39.84 
 
 		 1595 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0017  YD repeat protein  38.21 
 
 		 738 aa  82.4  0.000000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215545  hitchhiker  0.000002636 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  39.26 
 
 		 1586 aa  82.4  0.000000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  39.84 
 
 		 1586 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0403  YD repeat-containing protein  42.06 
 
 		 1390 aa  82  0.000000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03331  rhsB element core protein RshB  39.68 
 
 		 1411 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0233  YD repeat protein  39.68 
 
 		 1411 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4092  protein rhsB precursor  39.68 
 
 		 1411 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.576153  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0330  RHS/YD repeat-containing protein  41.6 
 
 		 1402 aa  81.6  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.581458  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  39.04 
 
 		 1379 aa  82  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03284  hypothetical protein  39.68 
 
 		 1411 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0234  YD repeat-containing protein  38.89 
 
 		 1411 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  29.2 
 
 		 1576 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2699  YD repeat protein  39.02 
 
 		 1892 aa  81.3  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.499088  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3681  RhsB protein  38.89 
 
 		 1411 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6958  YD repeat protein  39.02 
 
 		 1495 aa  80.5  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165328  normal  0.66981 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  38.84 
 
 		 1489 aa  79.7  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  38.94 
 
 		 1626 aa  80.1  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  37.1 
 
 		 1528 aa  79.7  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1434  YD repeat-containing protein  32.24 
 
 		 1553 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16383  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  38.93 
 
 		 1531 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1639  protein rhsD, truncation  37.68 
 
 		 1405 aa  79.7  0.00000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2065  protein rhsD  37.68 
 
 		 1400 aa  79.3  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.595023 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0299  YD repeat-containing protein  40.98 
 
 		 1525 aa  79.3  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32830  hypothetical protein  42.27 
 
 		 889 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000050197  hitchhiker  0.0000345173 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2213  RhsD protein precursor  59.42 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017753  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0115  YD repeat protein  36.62 
 
 		 1377 aa  79  0.00000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4951  YD repeat-containing protein  37.5 
 
 		 1495 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.746977 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0120  YD repeat-containing protein  36.62 
 
 		 1377 aa  79  0.00000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>