105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8225 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8225  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 232 aa  454  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.133107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10335  hypothetical protein  35.94 
 
 		 246 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.902876 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2592  regulatory protein TetR  28.64 
 
 		 234 aa  64.7  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.28583  normal  0.135199 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 228 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1516  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 218 aa  52.4  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 219 aa  52  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 214 aa  51.6  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 238 aa  50.8  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2111  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 214 aa  50.8  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.780559 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 242 aa  50.4  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 211 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1156  transcriptional regulator, TetR family  46.88 
 
 		 227 aa  48.9  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 211 aa  48.9  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 211 aa  48.9  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 211 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 211 aa  48.9  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 211 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2962  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 201 aa  48.5  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 211 aa  48.5  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 209 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 243 aa  48.1  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7113  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 240 aa  47.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0979  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 228 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 230 aa  47.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3447  regulatory protein TetR  35.71 
 
 		 199 aa  47.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6913  putative transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 183 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0507  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 211 aa  46.6  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.982351 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  26.6 
 
 		 230 aa  47  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6448  transcriptional regulator, TetR family  38.78 
 
 		 222 aa  46.6  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000264064  hitchhiker  1.59583e-16 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1103  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 248 aa  47  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.575371  normal  0.523139 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0319  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3994  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 391 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.777734 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8100  transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 		 218 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978856  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 205 aa  46.2  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 214 aa  46.2  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3090  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 218 aa  45.8  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.595832  hitchhiker  0.000923351 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  29.85 
 
 		 212 aa  45.8  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 219 aa  45.8  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 241 aa  45.4  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  25.71 
 
 		 211 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3314  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 		 194 aa  45.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1584  transcriptional regulator, TetR family  23.58 
 
 		 211 aa  45.4  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2803  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 		 194 aa  45.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.014286  normal  0.214284 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5376  transcriptional regulator, TetR family  31.86 
 
 		 445 aa  45.4  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 205 aa  45.1  0.0009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  38.68 
 
 		 192 aa  45.1  0.0009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1920  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 213 aa  45.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3172  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 198 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0293  transcriptional regulator, TetR family  30.08 
 
 		 230 aa  44.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0142  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 288 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1036  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 288 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0441  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 233 aa  43.9  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4111  regulatory protein, TetR  27.64 
 
 		 211 aa  44.3  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.856223  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  34.72 
 
 		 221 aa  43.9  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1313  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 321 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2773  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 321 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2630  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 321 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0169  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 321 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.964419  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 191 aa  43.9  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  37.66 
 
 		 194 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 231 aa  43.5  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 216 aa  43.5  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 223 aa  43.5  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11992  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 406 aa  43.1  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  24.2 
 
 		 217 aa  43.5  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4533  TetR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 218 aa  43.5  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.505005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 208 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1313  transcriptional regulator TetR family  40 
 
 		 213 aa  43.1  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1601  transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 202 aa  43.5  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0385  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 219 aa  43.5  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.464521 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  23.2 
 
 		 196 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1767  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 209 aa  43.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.271955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1604  AcrR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 221 aa  43.1  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.388293  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 223 aa  42.7  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 194 aa  42.7  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1479  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 190 aa  42.7  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.210194  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 216 aa  43.1  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 201 aa  43.1  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0332  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 208 aa  42.7  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3349  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 209 aa  42.7  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.545743 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 226 aa  42.7  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 206 aa  42.7  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5087  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 196 aa  42.7  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.305126  normal  0.842071 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  40 
 
 		 230 aa  42.7  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2695  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 185 aa  42.7  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000333836  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2781  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 206 aa  42.4  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000487748 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2883  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 211 aa  42.4  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 233 aa  42.4  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2540  transcriptional regulator, TetR family  26.72 
 
 		 220 aa  42.4  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.34282 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 197 aa  42.4  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0282  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 201 aa  42.4  0.007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.356366  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4318  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 214 aa  42.4  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2103  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 239 aa  42.4  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3910  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 242 aa  42.4  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.104674 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1293  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 199 aa  42  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1600  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 288 aa  42  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1404  transcriptional regulator, TetR family  33.96 
 
 		 193 aa  42  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1241  regulatory protein TetR  38.6 
 
 		 193 aa  42  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0907421  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>