More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0187 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_0187  shikimate kinase  100 
 
 		 162 aa  308  2e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.521508  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0198  Shikimate kinase  97.53 
 
 		 162 aa  299  1e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0209  Shikimate kinase  96.3 
 
 		 162 aa  296  1e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0207  shikimate kinase  79.75 
 
 		 163 aa  231  3e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0163563 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2486  Shikimate kinase  48.26 
 
 		 192 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0877  Shikimate kinase  49.69 
 
 		 176 aa  105  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.317471 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1855  shikimate kinase  39.52 
 
 		 181 aa  102  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5254  Shikimate kinase  47.71 
 
 		 171 aa  101  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.12338  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1091  shikimate kinase  45.62 
 
 		 172 aa  99  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.393566  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2413  shikimate kinase  45.06 
 
 		 183 aa  98.6  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237491  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1700  Shikimate kinase  30.43 
 
 		 172 aa  97.8  5e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1763  shikimate kinase  36.47 
 
 		 264 aa  97.8  6e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1695  3-dehydroquinate synthase  43.12 
 
 		 577 aa  97.4  8e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.981168  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0960  shikimate kinase  36.47 
 
 		 199 aa  97.1  8e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12559  shikimate kinase  42.86 
 
 		 176 aa  94.7  5e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121488  normal  0.108726 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3757  shikimate kinase  40.37 
 
 		 220 aa  94  8e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.28547 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2952  Shikimate kinase  46.58 
 
 		 171 aa  93.2  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000140842  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2209  shikimate kinase  40.88 
 
 		 165 aa  93.2  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.218962  normal  0.751084 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0441  shikimate kinase  31.55 
 
 		 176 aa  92.8  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.567872  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0528  Shikimate kinase  32.1 
 
 		 166 aa  92  3e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.276227  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2646  shikimate kinase  39.13 
 
 		 220 aa  92  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1516  shikimate kinase  33.53 
 
 		 197 aa  91.7  4e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.681098 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1335  shikimate kinase  42.33 
 
 		 181 aa  91.7  4e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.89172  normal  0.76234 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2394  shikimate kinase  39.75 
 
 		 235 aa  90.9  7e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0537211  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2353  shikimate kinase  39.75 
 
 		 235 aa  90.9  7e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2400  shikimate kinase  39.75 
 
 		 235 aa  90.9  7e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0971022 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1555  shikimate kinase  36.59 
 
 		 170 aa  90.1  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.436884  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0946  shikimate kinase  35.47 
 
 		 199 aa  89.4  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.133424  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1406  shikimate kinase  36.47 
 
 		 202 aa  89.4  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.812389  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0165  Shikimate kinase  33.33 
 
 		 172 aa  88.6  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1220  shikimate kinase  36.47 
 
 		 190 aa  88.2  4e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.455019  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3014  Shikimate kinase  41.51 
 
 		 203 aa  87.8  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0650528 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17860  shikimate kinase  46.67 
 
 		 188 aa  87  8e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.114511  normal  0.708783 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0734  shikimate kinase  40 
 
 		 179 aa  87.4  8e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0882  Shikimate kinase  40 
 
 		 179 aa  87.4  8e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.314525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2345  shikimate kinase  38.32 
 
 		 199 aa  87  9e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2020  shikimate kinase  43.21 
 
 		 173 aa  87  9e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0278183 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1330  Shikimate kinase  36.81 
 
 		 219 aa  87  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0593402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2389  Shikimate kinase  42.94 
 
 		 166 aa  86.7  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3142  3-dehydroquinate synthase  44.3 
 
 		 519 aa  86.7  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  hitchhiker  0.00997966 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0553  shikimate kinase  37.42 
 
 		 181 aa  86.3  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.387005  normal  0.100064 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1556  shikimate kinase  39.51 
 
 		 173 aa  85.9  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0837  shikimate kinase  34.12 
 
 		 190 aa  86.3  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.8297  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1506  shikimate kinase  35.58 
 
 		 184 aa  85.5  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1834  Shikimate kinase  41.57 
 
 		 187 aa  84.7  5e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.252132  normal  0.208051 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2022  shikimate kinase  33.33 
 
 		 192 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1308  shikimate kinase  42.77 
 
 		 172 aa  82.4  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0211808 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2617  Shikimate kinase  38.32 
 
 		 206 aa  81.6  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1799  shikimate kinase  38.65 
 
 		 191 aa  81.6  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.279615  normal  0.998322 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2661  Shikimate kinase  35.37 
 
 		 170 aa  81.6  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000463113 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01201  shikimate kinase  30.91 
 
 		 185 aa  81.6  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0215  shikimate kinase  35.98 
 
 		 172 aa  81.3  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.365544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1900  shikimate kinase  36.75 
 
 		 216 aa  81.3  0.000000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.976916  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0346  shikimate kinase  35.93 
 
 		 191 aa  80.9  0.000000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1819  shikimate kinase  35.4 
 
 		 169 aa  80.9  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02182  shikimate kinase  35.93 
 
 		 180 aa  80.9  0.000000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0989  shikimate kinase  39.31 
 
 		 189 aa  80.5  0.000000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.764928  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01791  shikimate kinase  30.49 
 
 		 198 aa  80.5  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0539701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2255  shikimate kinase  32.53 
 
 		 166 aa  80.5  0.000000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0464  shikimate kinase  31.29 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1476  shikimate kinase  30.49 
 
 		 198 aa  80.5  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4297  Shikimate kinase  42.33 
 
 		 179 aa  79.7  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.911234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1942  Shikimate kinase  33.94 
 
 		 167 aa  80.5  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.195968  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02051  shikimate kinase  35.37 
 
 		 192 aa  80.1  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0977  shikimate kinase  36.77 
 
 		 168 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.937224  normal  0.13223 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2488  shikimate kinase  38.22 
 
 		 168 aa  79  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.995704 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2014  shikimate kinase  36.02 
 
 		 169 aa  79.3  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0611  bifunctional shikimate kinase/3-dehydroquinate synthase  35.19 
 
 		 540 aa  79  0.00000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.488786  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3534  Shikimate kinase  33.96 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6534  Shikimate kinase  38.89 
 
 		 167 aa  78.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0818749  normal  0.0132303 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15450  shikimate kinase  39.26 
 
 		 180 aa  79  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.801598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1804  Shikimate kinase  40 
 
 		 172 aa  78.6  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1517  shikimate kinase  30.67 
 
 		 171 aa  78.2  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4020  shikimate kinase  40.85 
 
 		 181 aa  78.2  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.263055  normal  0.623088 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3524  Shikimate kinase  38.22 
 
 		 169 aa  77.8  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.236256  normal  0.835023 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1282  shikimate kinase  37.2 
 
 		 178 aa  78.2  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3108  shikimate kinase  38.78 
 
 		 184 aa  77.4  0.00000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0973333 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0952  Shikimate kinase  30.49 
 
 		 187 aa  77  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_407  shikimate kinase  30.34 
 
 		 176 aa  77  0.00000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15020  shikimate kinase  40.37 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0201152  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0894  shikimate kinase  34.36 
 
 		 190 aa  77  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00120765  hitchhiker  0.000836884 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0354  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  35.71 
 
 		 593 aa  76.6  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1020  shikimate kinase  30.49 
 
 		 177 aa  77  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1030  shikimate 5-dehydrogenase  30.57 
 
 		 454 aa  76.3  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2010  Shikimate kinase  39.6 
 
 		 189 aa  75.9  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000269674 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1460  shikimate kinase  42.59 
 
 		 168 aa  76.3  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00429425  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1839  shikimate kinase  42.58 
 
 		 167 aa  76.3  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.230469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0979  Shikimate kinase  29.88 
 
 		 187 aa  75.5  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0506883 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0611  shikimate kinase  30.95 
 
 		 180 aa  75.5  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.78726  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0253  3-dehydroquinate synthase  38.06 
 
 		 551 aa  75.5  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0722  shikimate kinase  41.14 
 
 		 198 aa  75.5  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.989492 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0692  shikimate kinase  30.95 
 
 		 180 aa  75.1  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2745  Shikimate kinase  36.81 
 
 		 181 aa  74.7  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.11158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1529  shikimate kinase  35.98 
 
 		 180 aa  75.1  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.140024  normal  0.642585 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0400  shikimate kinase  31.1 
 
 		 180 aa  74.7  0.0000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240866 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2273  shikimate kinase  40.43 
 
 		 199 aa  74.7  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.151657  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2817  shikimate kinase  38.18 
 
 		 181 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.248239  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0547  shikimate kinase  36.94 
 
 		 163 aa  74.7  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0678  shikimate kinase  37.16 
 
 		 182 aa  74.7  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.211914 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0532  shikimate kinase  37.65 
 
 		 206 aa  74.3  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.398364 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>