More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1834 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_1834  Shikimate kinase  100 
 
 		 187 aa  362  2e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.252132  normal  0.208051 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1335  shikimate kinase  65.06 
 
 		 181 aa  215  4e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.89172  normal  0.76234 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1695  3-dehydroquinate synthase  65.68 
 
 		 577 aa  214  4e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.981168  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17860  shikimate kinase  63.79 
 
 		 188 aa  208  4e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.114511  normal  0.708783 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2020  shikimate kinase  62.13 
 
 		 173 aa  188  4e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0278183 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6534  Shikimate kinase  62.8 
 
 		 167 aa  183  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0818749  normal  0.0132303 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2952  Shikimate kinase  56.02 
 
 		 171 aa  175  3e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000140842  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2209  shikimate kinase  56.97 
 
 		 165 aa  174  5e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.218962  normal  0.751084 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2389  Shikimate kinase  56.8 
 
 		 166 aa  171  5.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2413  shikimate kinase  57.14 
 
 		 183 aa  171  6.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237491  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1091  shikimate kinase  55.36 
 
 		 172 aa  169  3e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.393566  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1308  shikimate kinase  56.1 
 
 		 172 aa  169  3e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0211808 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3152  Shikimate kinase  59.49 
 
 		 192 aa  166  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1700  shikimate kinase  56.57 
 
 		 187 aa  164  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.173109  normal  0.18068 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3142  3-dehydroquinate synthase  54.94 
 
 		 519 aa  164  8e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  hitchhiker  0.00997966 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4297  Shikimate kinase  53.85 
 
 		 179 aa  155  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.911234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5254  Shikimate kinase  50.3 
 
 		 171 aa  152  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.12338  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0877  Shikimate kinase  50.93 
 
 		 176 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.317471 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2394  shikimate kinase  49.09 
 
 		 235 aa  145  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0537211  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2353  shikimate kinase  49.09 
 
 		 235 aa  145  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2400  shikimate kinase  49.09 
 
 		 235 aa  145  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0971022 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3208  shikimate kinase  54.6 
 
 		 225 aa  144  6e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.181986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12559  shikimate kinase  48.54 
 
 		 176 aa  144  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121488  normal  0.108726 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1839  shikimate kinase  54.78 
 
 		 167 aa  141  5e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.230469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15450  shikimate kinase  47.65 
 
 		 180 aa  139  3e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.801598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2646  shikimate kinase  46.06 
 
 		 220 aa  137  8.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3757  shikimate kinase  44.38 
 
 		 220 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.28547 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1846  shikimate kinase  52.17 
 
 		 167 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0611  bifunctional shikimate kinase/3-dehydroquinate synthase  42.17 
 
 		 540 aa  125  3e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.488786  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2617  Shikimate kinase  41.01 
 
 		 206 aa  122  3e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15020  shikimate kinase  41.01 
 
 		 204 aa  118  3.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0201152  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0692  shikimate kinase  36.02 
 
 		 180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0611  shikimate kinase  36.02 
 
 		 180 aa  109  3e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.78726  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3029  Shikimate kinase  40.79 
 
 		 190 aa  105  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.194702  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5079  shikimate kinase  40.52 
 
 		 172 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2029  shikimate kinase  42.07 
 
 		 200 aa  105  4e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4952  shikimate kinase  40.52 
 
 		 172 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1951  shikimate kinase  42.07 
 
 		 217 aa  105  5e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3368  shikimate kinase I  40.8 
 
 		 171 aa  104  6e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000011554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5776  shikimate kinase  41.07 
 
 		 172 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5127  shikimate kinase  41.83 
 
 		 172 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2206  shikimate kinase I  40.51 
 
 		 174 aa  102  4e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000184461  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0410  shikimate kinase  40.52 
 
 		 172 aa  101  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0407495  normal  0.100791 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45250  shikimate kinase  42.07 
 
 		 172 aa  100  8e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0213  shikimate kinase I  40.23 
 
 		 171 aa  101  8e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000106831  hitchhiker  0.00783685 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02182  shikimate kinase  37.65 
 
 		 180 aa  101  8e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3686  shikimate kinase I  39.08 
 
 		 173 aa  100  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000028278  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3793  shikimate kinase I  39.08 
 
 		 173 aa  100  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.013782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3855  shikimate kinase I  39.08 
 
 		 173 aa  100  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.0000716125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3684  shikimate kinase I  39.08 
 
 		 173 aa  100  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000504262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3759  shikimate kinase I  39.08 
 
 		 173 aa  100  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00136839  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03242  shikimate kinase I  39.08 
 
 		 173 aa  100  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00034661  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0323  Shikimate kinase  39.08 
 
 		 225 aa  100  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000263169  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0286  shikimate kinase I  38.73 
 
 		 171 aa  100  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4113  shikimate kinase I  38.73 
 
 		 171 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000040137  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3860  shikimate kinase I  39.08 
 
 		 173 aa  100  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000504187  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3586  shikimate kinase I  39.08 
 
 		 173 aa  100  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  2.9305899999999995e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3767  shikimate kinase I  39.08 
 
 		 173 aa  100  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000106668  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1718  shikimate kinase  41.82 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.825758  normal  0.851225 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03194  hypothetical protein  39.08 
 
 		 173 aa  100  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000404125  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4694  shikimate kinase I  39.08 
 
 		 225 aa  100  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000528588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0323  shikimate kinase I  39.08 
 
 		 173 aa  100  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000129228  normal  0.10404 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4202  shikimate kinase I  38.73 
 
 		 171 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000383652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3666  shikimate kinase I  39.08 
 
 		 225 aa  100  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000538429  normal  0.0827574 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3706  shikimate kinase I  38.73 
 
 		 171 aa  100  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000103243  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0238  shikimate kinase I  39.08 
 
 		 171 aa  100  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000334252  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3894  shikimate kinase I  38.73 
 
 		 171 aa  100  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000513438  normal  0.331881 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4003  shikimate kinase I  38.73 
 
 		 171 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000558194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4084  shikimate kinase I  38.73 
 
 		 171 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000358948  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3698  shikimate kinase I  38.73 
 
 		 171 aa  99.8  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000225658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0247  shikimate kinase I  38.73 
 
 		 171 aa  99.8  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000294714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0375  shikimate kinase I  40.8 
 
 		 171 aa  100  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00773873  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66610  shikimate kinase  41.07 
 
 		 172 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3036  shikimate kinase  39.1 
 
 		 180 aa  99.4  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0261  shikimate kinase I  38.73 
 
 		 171 aa  99.4  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000154257  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3803  shikimate kinase I  39.08 
 
 		 173 aa  99  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00268813  normal  0.803666 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1942  Shikimate kinase  37.28 
 
 		 167 aa  98.6  4e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.195968  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3014  Shikimate kinase  44.65 
 
 		 203 aa  99  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0650528 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0408  shikimate kinase  39.87 
 
 		 172 aa  98.2  6e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4605  shikimate kinase I  40.88 
 
 		 173 aa  98.2  7e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000116276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0340  shikimate kinase I  39.08 
 
 		 171 aa  97.8  7e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2137  shikimate kinase  35.47 
 
 		 174 aa  97.8  9e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.628527  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0547  shikimate kinase  41.4 
 
 		 163 aa  97.8  9e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0225  shikimate kinase I  39.62 
 
 		 173 aa  97.4  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000752096  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0472  shikimate kinase  35.84 
 
 		 172 aa  97.4  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0810879  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0528  Shikimate kinase  35.76 
 
 		 166 aa  97.4  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.276227  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0387  shikimate kinase  39.73 
 
 		 163 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.458969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4265  shikimate kinase I  39.08 
 
 		 171 aa  97.4  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00401521  normal  0.220429 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3883  shikimate kinase I  39.62 
 
 		 173 aa  97.4  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000719849  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3727  shikimate kinase I  39.62 
 
 		 173 aa  97.4  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000014395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3966  shikimate kinase I  39.62 
 
 		 173 aa  97.4  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  1.60057e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2326  Shikimate kinase  41.1 
 
 		 185 aa  97.4  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0927033  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0163  shikimate kinase  38.22 
 
 		 171 aa  97.4  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.919882  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0994  shikimate kinase I  37.8 
 
 		 175 aa  96.3  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0963  shikimate kinase I  37.8 
 
 		 175 aa  96.3  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00028  shikimate kinase I  39.87 
 
 		 172 aa  96.3  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5129  shikimate kinase  39.73 
 
 		 163 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.206005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01791  shikimate kinase  33.53 
 
 		 198 aa  95.5  4e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0539701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0909  shikimate kinase  43.97 
 
 		 206 aa  95.1  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2010  Shikimate kinase  38.18 
 
 		 189 aa  94.7  6e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000269674 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>