More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2022 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2022  shikimate kinase  100 
 
 		 192 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2880  shikimate kinase  71.19 
 
 		 188 aa  263  1e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0528  Shikimate kinase  39.88 
 
 		 166 aa  118  6e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.276227  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1900  shikimate kinase  40 
 
 		 216 aa  108  4.0000000000000004e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.976916  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0528  shikimate kinase  39.51 
 
 		 168 aa  107  9.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.361692  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3064  shikimate kinase  39.41 
 
 		 195 aa  107  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0165  Shikimate kinase  37.28 
 
 		 172 aa  105  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0882  Shikimate kinase  39.77 
 
 		 179 aa  105  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.314525  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1330  Shikimate kinase  38.55 
 
 		 219 aa  105  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0593402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0734  shikimate kinase  39.77 
 
 		 179 aa  105  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0553  shikimate kinase  36.47 
 
 		 181 aa  105  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.387005  normal  0.100064 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0008  shikimate kinase  39.19 
 
 		 187 aa  105  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.780526  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2026  shikimate kinase  37.93 
 
 		 175 aa  104  9e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1799  shikimate kinase  34.12 
 
 		 191 aa  103  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.279615  normal  0.998322 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06110  Shikimate kinase  37.8 
 
 		 171 aa  102  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3596  shikimate kinase  33.52 
 
 		 196 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0611  bifunctional shikimate kinase/3-dehydroquinate synthase  38.24 
 
 		 540 aa  102  3e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.488786  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1700  Shikimate kinase  39.39 
 
 		 172 aa  102  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1855  shikimate kinase  38.73 
 
 		 181 aa  100  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1282  shikimate kinase  37.93 
 
 		 178 aa  99.8  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1476  shikimate kinase  39.02 
 
 		 198 aa  99  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01791  shikimate kinase  39.02 
 
 		 198 aa  99.4  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0539701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2097  shikimate kinase  40.24 
 
 		 179 aa  99.4  3e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1718  shikimate kinase  36.67 
 
 		 208 aa  99.4  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.825758  normal  0.851225 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2326  Shikimate kinase  38.37 
 
 		 185 aa  99  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0927033  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2745  Shikimate kinase  38.93 
 
 		 181 aa  98.6  5e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.11158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0124  shikimate kinase  40.24 
 
 		 179 aa  98.2  6e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.529652  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0330  shikimate kinase  39.16 
 
 		 179 aa  97.8  8e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15338  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0979  Shikimate kinase  37.5 
 
 		 187 aa  97.8  9e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0506883 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0952  Shikimate kinase  37.5 
 
 		 187 aa  97.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0354  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  38 
 
 		 593 aa  97.4  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1556  shikimate kinase  36.59 
 
 		 173 aa  97.1  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2794  shikimate kinase  38.78 
 
 		 183 aa  96.7  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2661  Shikimate kinase  34.55 
 
 		 170 aa  96.7  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000463113 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0894  shikimate kinase  34.94 
 
 		 190 aa  96.7  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00120765  hitchhiker  0.000836884 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0652  shikimate kinase  41.29 
 
 		 195 aa  96.3  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2456  shikimate kinase  40.85 
 
 		 170 aa  95.9  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.209695  normal  0.679915 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2617  Shikimate kinase  39.75 
 
 		 206 aa  95.9  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00510  shikimate kinase I  37.5 
 
 		 171 aa  95.5  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1039  Shikimate kinase  37.42 
 
 		 162 aa  95.5  4e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0118821  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1199  bifunctional shikimate kinase/3-dehydroquinate synthase  37.82 
 
 		 495 aa  95.5  4e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.539853  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0038  shikimate kinase  35.58 
 
 		 181 aa  95.1  5e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0781  shikimate kinase  35.37 
 
 		 170 aa  95.1  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.275347  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0207  shikimate kinase  35.8 
 
 		 163 aa  95.5  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0163563 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0410  shikimate kinase  36.69 
 
 		 172 aa  94.7  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0407495  normal  0.100791 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1951  shikimate kinase  33.94 
 
 		 217 aa  94.7  6e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2029  shikimate kinase  33.94 
 
 		 200 aa  94.7  7e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4117  shikimate kinase  35.09 
 
 		 182 aa  94.7  7e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  hitchhiker  0.000000685723 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1804  Shikimate kinase  34.18 
 
 		 172 aa  94.4  9e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1819  shikimate kinase  33.74 
 
 		 169 aa  94.4  9e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1555  shikimate kinase  32.73 
 
 		 170 aa  94.4  9e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.436884  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5079  shikimate kinase  37.58 
 
 		 172 aa  94  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4952  shikimate kinase  37.58 
 
 		 172 aa  94  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01201  shikimate kinase  35.88 
 
 		 185 aa  94  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3889  shikimate kinase  32.4 
 
 		 196 aa  93.2  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.090563  decreased coverage  0.00239824 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0909  shikimate kinase  33.73 
 
 		 206 aa  93.2  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5127  shikimate kinase  35.5 
 
 		 172 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0207  shikimate kinase  38.73 
 
 		 183 aa  93.6  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.807253  normal  0.16478 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0252  shikimate kinase  38.65 
 
 		 190 aa  93.2  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1899  Shikimate kinase  33.33 
 
 		 184 aa  93.2  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000431404 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0722  shikimate kinase  36.25 
 
 		 198 aa  93.2  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.989492 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45250  shikimate kinase  43.9 
 
 		 172 aa  92.8  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3024  shikimate kinase  36.59 
 
 		 199 aa  92.8  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1431  shikimate kinase  34.29 
 
 		 196 aa  92.4  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.373345  normal  0.0895571 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0311  shikimate kinase  38.1 
 
 		 184 aa  92.8  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3977  shikimate kinase  34.73 
 
 		 165 aa  92.4  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.537604  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0408  shikimate kinase  35.5 
 
 		 172 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3206  shikimate kinase  36.59 
 
 		 209 aa  92  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.289523  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1187  shikimate kinase  40 
 
 		 174 aa  92  4e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1308  shikimate kinase  34.91 
 
 		 172 aa  92.4  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0211808 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2486  Shikimate kinase  33.72 
 
 		 192 aa  92  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3729  shikimate kinase  36.77 
 
 		 184 aa  91.7  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.427035  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0692  shikimate kinase  36.36 
 
 		 180 aa  91.7  6e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4255  shikimate kinase  34.73 
 
 		 165 aa  91.7  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2797  shikimate kinase  36.77 
 
 		 177 aa  91.3  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.135069  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2747  shikimate kinase  36.77 
 
 		 177 aa  91.3  7e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1942  Shikimate kinase  37.74 
 
 		 167 aa  91.3  7e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.195968  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2345  shikimate kinase  33.14 
 
 		 199 aa  91.3  7e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2137  shikimate kinase  38.19 
 
 		 174 aa  91.3  7e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.628527  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1757  shikimate kinase  36.77 
 
 		 177 aa  91.3  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3700  shikimate kinase  36.77 
 
 		 177 aa  91.3  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.049823  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3758  shikimate kinase  36.77 
 
 		 177 aa  91.3  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485321  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3489  shikimate kinase  38.1 
 
 		 184 aa  91.3  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3534  Shikimate kinase  32.42 
 
 		 207 aa  91.3  8e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0611  shikimate kinase  36.36 
 
 		 180 aa  91.3  8e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.78726  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7573  shikimate kinase  43.69 
 
 		 237 aa  91.3  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01231  shikimate kinase  35.84 
 
 		 185 aa  90.9  9e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3014  Shikimate kinase  35.33 
 
 		 203 aa  91.3  9e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0650528 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0294  shikimate kinase  35.29 
 
 		 204 aa  90.9  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.638845 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2565  shikimate kinase  32.57 
 
 		 192 aa  90.9  9e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.412267 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0776  shikimate kinase  34.12 
 
 		 173 aa  90.5  1e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0977  shikimate kinase  35.19 
 
 		 168 aa  90.5  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.937224  normal  0.13223 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0053  shikimate kinase  34.91 
 
 		 172 aa  90.5  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.541651  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1634  Shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  31.71 
 
 		 521 aa  90.9  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.412877  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0666  shikimate kinase I  37.06 
 
 		 171 aa  90.9  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000317623  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5776  shikimate kinase  35.98 
 
 		 172 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2273  shikimate kinase  34.16 
 
 		 179 aa  90.5  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.787718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01241  shikimate kinase  35.43 
 
 		 185 aa  90.5  1e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0392  shikimate kinase  37.41 
 
 		 184 aa  90.5  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1340  shikimate kinase  35.84 
 
 		 177 aa  90.9  1e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>