More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2010 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_2010  Shikimate kinase  100 
 
 		 189 aa  379  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000269674 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2273  shikimate kinase  72.36 
 
 		 199 aa  286  1e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.151657  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15020  shikimate kinase  45.39 
 
 		 204 aa  123  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0201152  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2209  shikimate kinase  42.68 
 
 		 165 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.218962  normal  0.751084 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2952  Shikimate kinase  43.45 
 
 		 171 aa  118  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000140842  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1335  shikimate kinase  41.36 
 
 		 181 aa  111  6e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.89172  normal  0.76234 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0505  shikimate kinase  39.33 
 
 		 200 aa  109  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0535  shikimate kinase  38.76 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.74412  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12670  shikimate kinase  37.87 
 
 		 235 aa  105  4e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.799504  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2413  shikimate kinase  38.92 
 
 		 183 aa  105  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237491  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2020  shikimate kinase  39.43 
 
 		 173 aa  105  5e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0278183 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0294  shikimate kinase  39.77 
 
 		 204 aa  104  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.638845 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0532  shikimate kinase  40.61 
 
 		 206 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1308  shikimate kinase  41.78 
 
 		 172 aa  102  3e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0211808 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02182  shikimate kinase  40.74 
 
 		 180 aa  101  6e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0441  shikimate kinase  33.33 
 
 		 176 aa  101  6e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.567872  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0877  Shikimate kinase  43.15 
 
 		 176 aa  101  8e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.317471 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6534  Shikimate kinase  42.86 
 
 		 167 aa  100  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0818749  normal  0.0132303 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2761  shikimate kinase  37.91 
 
 		 179 aa  100  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3757  shikimate kinase  38.73 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.28547 
 
 
-
 
NC_002936  DET0464  shikimate kinase  32.74 
 
 		 176 aa  99.4  3e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1695  3-dehydroquinate synthase  40.91 
 
 		 577 aa  99.4  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.981168  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3740  shikimate kinase  39.55 
 
 		 188 aa  99  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.695476  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0008  shikimate kinase  44.44 
 
 		 187 aa  99.4  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.780526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1091  shikimate kinase  37.27 
 
 		 172 aa  99  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.393566  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2206  shikimate kinase I  37.79 
 
 		 174 aa  98.6  4e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000184461  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4053  shikimate kinase  33.33 
 
 		 197 aa  98.6  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.477248  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2389  Shikimate kinase  39.73 
 
 		 166 aa  98.2  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3036  shikimate kinase  42.95 
 
 		 180 aa  97.8  7e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0380  3-dehydroquinate synthase  36.71 
 
 		 560 aa  97.8  8e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3064  shikimate kinase  39.62 
 
 		 195 aa  97.4  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0692  shikimate kinase  35.71 
 
 		 180 aa  96.7  2e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0611  bifunctional shikimate kinase/3-dehydroquinate synthase  36.6 
 
 		 540 aa  96.7  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.488786  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1900  shikimate kinase  41.96 
 
 		 216 aa  96.3  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.976916  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0611  shikimate kinase  35.71 
 
 		 180 aa  96.3  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.78726  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12559  shikimate kinase  44.22 
 
 		 176 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121488  normal  0.108726 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1467  3-dehydroquinate synthase  44.52 
 
 		 552 aa  96.7  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_407  shikimate kinase  30.95 
 
 		 176 aa  95.9  3e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3152  Shikimate kinase  39.35 
 
 		 192 aa  96.3  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1633  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  37.22 
 
 		 594 aa  95.5  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.364457  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2617  Shikimate kinase  44.52 
 
 		 206 aa  95.1  6e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3142  3-dehydroquinate synthase  38.1 
 
 		 519 aa  94.7  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  hitchhiker  0.00997966 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1834  Shikimate kinase  38.18 
 
 		 187 aa  94.7  7e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.252132  normal  0.208051 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0722  shikimate kinase  38.25 
 
 		 198 aa  94.7  7e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.989492 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2646  shikimate kinase  37.95 
 
 		 220 aa  94.7  7e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2394  shikimate kinase  41.22 
 
 		 235 aa  94.4  8e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0537211  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2353  shikimate kinase  41.22 
 
 		 235 aa  94.4  8e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2400  shikimate kinase  41.22 
 
 		 235 aa  94.4  8e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0971022 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15450  shikimate kinase  37.79 
 
 		 180 aa  94.4  9e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.801598  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1330  Shikimate kinase  40.82 
 
 		 219 aa  94  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0593402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1878  shikimate kinase  33.14 
 
 		 186 aa  93.6  1e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.190429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3029  Shikimate kinase  38.61 
 
 		 190 aa  94.4  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.194702  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2168  shikimate kinase  34.32 
 
 		 186 aa  93.6  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.157663  normal  0.699838 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1700  shikimate kinase  40 
 
 		 187 aa  93.2  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.173109  normal  0.18068 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7573  shikimate kinase  40.61 
 
 		 237 aa  93.6  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0786  shikimate kinase  36.71 
 
 		 174 aa  93.2  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.549744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00028  shikimate kinase I  41.33 
 
 		 172 aa  93.2  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5254  Shikimate kinase  40.69 
 
 		 171 aa  92.4  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.12338  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4605  shikimate kinase I  38.41 
 
 		 173 aa  92.8  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000116276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3727  shikimate kinase I  38.41 
 
 		 173 aa  92  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000014395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0225  shikimate kinase I  38.41 
 
 		 173 aa  92  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000752096  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0261  shikimate kinase I  41.06 
 
 		 171 aa  92  4e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000154257  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3966  shikimate kinase I  38.41 
 
 		 173 aa  92  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  1.60057e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17860  shikimate kinase  37.87 
 
 		 188 aa  92  5e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.114511  normal  0.708783 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0994  shikimate kinase I  34.3 
 
 		 175 aa  92  5e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0963  shikimate kinase I  34.3 
 
 		 175 aa  92  5e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1555  shikimate kinase  37.65 
 
 		 170 aa  91.7  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.436884  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3793  shikimate kinase I  39.74 
 
 		 173 aa  91.3  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.013782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3855  shikimate kinase I  39.74 
 
 		 173 aa  91.3  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.0000716125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3686  shikimate kinase I  39.74 
 
 		 173 aa  91.3  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000028278  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1145  shikimate kinase  39.87 
 
 		 182 aa  91.3  7e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3759  shikimate kinase I  39.74 
 
 		 173 aa  91.3  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00136839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3684  shikimate kinase I  39.74 
 
 		 173 aa  91.3  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000504262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3889  shikimate kinase  35.4 
 
 		 196 aa  90.9  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.090563  decreased coverage  0.00239824 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3368  shikimate kinase I  40.94 
 
 		 171 aa  90.9  9e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000011554  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03242  shikimate kinase I  39.07 
 
 		 173 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00034661  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0323  Shikimate kinase  37.74 
 
 		 225 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000263169  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0286  shikimate kinase I  40.4 
 
 		 171 aa  90.9  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3666  shikimate kinase I  37.74 
 
 		 225 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000538429  normal  0.0827574 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4694  shikimate kinase I  39.07 
 
 		 225 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000528588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3586  shikimate kinase I  39.07 
 
 		 173 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  2.9305899999999995e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4113  shikimate kinase I  40.4 
 
 		 171 aa  90.5  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000040137  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3883  shikimate kinase I  37.75 
 
 		 173 aa  90.5  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000719849  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4003  shikimate kinase I  40.4 
 
 		 171 aa  90.5  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000558194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0354  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  36.36 
 
 		 593 aa  90.5  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0323  shikimate kinase I  39.07 
 
 		 173 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000129228  normal  0.10404 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3767  shikimate kinase I  39.07 
 
 		 173 aa  90.9  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000106668  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4202  shikimate kinase I  40.4 
 
 		 171 aa  90.5  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000383652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03194  hypothetical protein  39.07 
 
 		 173 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000404125  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4084  shikimate kinase I  40.4 
 
 		 171 aa  90.5  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000358948  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3698  shikimate kinase I  40.4 
 
 		 171 aa  90.9  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000225658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0247  shikimate kinase I  40.4 
 
 		 171 aa  90.9  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000294714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3894  shikimate kinase I  40.4 
 
 		 171 aa  90.5  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000513438  normal  0.331881 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3860  shikimate kinase I  39.07 
 
 		 173 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000504187  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3706  shikimate kinase I  40.4 
 
 		 171 aa  90.5  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000103243  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4137  shikimate kinase  33.14 
 
 		 165 aa  90.1  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.151576  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0165  Shikimate kinase  39.73 
 
 		 172 aa  90.1  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3803  shikimate kinase I  37.75 
 
 		 173 aa  90.1  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00268813  normal  0.803666 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4457  shikimate kinase  33.14 
 
 		 165 aa  90.1  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745283  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1609  shikimate kinase  36.47 
 
 		 185 aa  89.7  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.451303 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>