More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_3692 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0403  YD repeat-containing protein  40.14 
 
 		 1390 aa  848    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  36.01 
 
 		 1385 aa  727    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  38.76 
 
 		 1410 aa  794    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0330  RHS/YD repeat-containing protein  40.01 
 
 		 1402 aa  850    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.581458  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4805  YD repeat-containing protein  34.33 
 
 		 1229 aa  652    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.739306  normal  0.809733 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  35.31 
 
 		 1409 aa  733    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0321  Rhs family protein  34.86 
 
 		 1359 aa  663    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.73436  hitchhiker  0.000636537 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  45.51 
 
 		 1379 aa  1002    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  35.58 
 
 		 1400 aa  727    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  35.84 
 
 		 1411 aa  710    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  100 
 
 		 1419 aa  2927    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0333  RHS/YD repeat-containing protein  39.89 
 
 		 1418 aa  842    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  35.24 
 
 		 1386 aa  683    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  32.9 
 
 		 1446 aa  561  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  32.29 
 
 		 1421 aa  555  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4081  Rhs family protein  34.28 
 
 		 1140 aa  545  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.451767  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  32.23 
 
 		 1531 aa  529  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  31.94 
 
 		 1568 aa  493  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4085  RHS family protein, putative  30.83 
 
 		 1530 aa  477  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  0.0133781 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4990  YD repeat-containing protein  37.86 
 
 		 867 aa  465  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2613  YD repeat-containing protein  37.27 
 
 		 866 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  31.35 
 
 		 1362 aa  457  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2838  YD repeat-containing protein  28.63 
 
 		 1654 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0573188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  30.52 
 
 		 1602 aa  431  1e-119  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  32.3 
 
 		 1586 aa  427  1e-118  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0373  Rhs family protein  33.49 
 
 		 855 aa  426  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3017  YD repeat-containing protein  31.09 
 
 		 1149 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  29.94 
 
 		 1554 aa  418  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6684  YD repeat-containing protein  30.15 
 
 		 1149 aa  409  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  30.21 
 
 		 1348 aa  405  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0145  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  29.21 
 
 		 1150 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1615  Rhs1 protein  29.21 
 
 		 1150 aa  395  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  34.77 
 
 		 924 aa  392  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0168  Rhs1 protein  29.21 
 
 		 1150 aa  393  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  29.39 
 
 		 1547 aa  389  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  30.29 
 
 		 1527 aa  389  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  31.52 
 
 		 1576 aa  385  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0499  YD repeat-containing protein  29.26 
 
 		 1604 aa  384  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  28.83 
 
 		 1560 aa  381  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0131  Rhs1 protein  28.58 
 
 		 1150 aa  380  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.462528  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  30.17 
 
 		 1551 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  29.26 
 
 		 1550 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  30.04 
 
 		 1520 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  29.97 
 
 		 1614 aa  366  2e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3345  YD repeat-containing protein  29.22 
 
 		 1583 aa  365  5.0000000000000005e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  29.74 
 
 		 1611 aa  360  9.999999999999999e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  29.29 
 
 		 1572 aa  355  2e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  29.87 
 
 		 1981 aa  353  2e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2330  RHS protein  28.38 
 
 		 1573 aa  352  3e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361613 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  28.04 
 
 		 1620 aa  348  5e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  29.04 
 
 		 1429 aa  347  1e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  28.82 
 
 		 1609 aa  342  2.9999999999999998e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  28.44 
 
 		 1595 aa  339  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  28.4 
 
 		 1586 aa  337  7.999999999999999e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  27.22 
 
 		 1485 aa  328  4.0000000000000003e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3695  hypothetical protein  85.56 
 
 		 184 aa  328  5e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.63687  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  27.81 
 
 		 1626 aa  319  2e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29400  hypothetical protein  29.32 
 
 		 1317 aa  304  7.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3959  hypothetical protein  28.24 
 
 		 1319 aa  297  8e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4997  YD repeat-containing protein  35.41 
 
 		 555 aa  295  3e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05482  putative RHS-related transmembrane protein  27.42 
 
 		 1517 aa  295  5e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.489685  normal  0.876645 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2525  YD repeat-containing protein  37.82 
 
 		 561 aa  294  7e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.949888 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0420  YD repeat protein  26.47 
 
 		 1475 aa  290  1e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1504  YD repeat protein  26.55 
 
 		 1457 aa  287  1.0000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1609  YD repeat protein  27.02 
 
 		 1447 aa  285  5.000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4482  YD repeat-containing protein  28.3 
 
 		 1528 aa  283  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2521  YD repeat-containing protein  28.23 
 
 		 1509 aa  283  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0051  YD repeat protein  26.58 
 
 		 1437 aa  283  2e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1160  YD repeat protein  26.87 
 
 		 1423 aa  281  6e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00301652  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  25.87 
 
 		 1197 aa  279  3e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3519  YD repeat protein  26.58 
 
 		 1508 aa  276  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0534715  normal  0.146276 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2694  YD repeat protein  25.93 
 
 		 1428 aa  276  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00194911  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0650  YD repeat protein  25.73 
 
 		 1422 aa  274  1e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.614814  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  27.04 
 
 		 1518 aa  273  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0299  YD repeat-containing protein  27.74 
 
 		 1525 aa  272  2.9999999999999997e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5261  YD repeat-containing protein  27 
 
 		 1487 aa  269  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792751 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0698  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  25.13 
 
 		 1492 aa  268  5e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0766  YD repeat-containing protein  25 
 
 		 1466 aa  267  8.999999999999999e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.668703  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4951  YD repeat-containing protein  25.98 
 
 		 1495 aa  266  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.746977 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3344  PAAR  26.84 
 
 		 1494 aa  265  4e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0030504  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5023  YD repeat-containing protein  26.84 
 
 		 1494 aa  265  4e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00366927  normal  0.185239 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  26.86 
 
 		 1259 aa  265  6e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  28.16 
 
 		 1509 aa  259  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1434  YD repeat-containing protein  26.41 
 
 		 1553 aa  260  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16383  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3079  YD repeat-containing protein  25.51 
 
 		 1505 aa  259  2e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00723203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4473  protein rhsA precursor  28.15 
 
 		 1365 aa  258  8e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0509  YD repeat-containing protein  25.56 
 
 		 1541 aa  257  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575036  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0238  YD repeat-containing protein  25.56 
 
 		 1541 aa  257  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.691901  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1059  YD repeat-containing protein  25.56 
 
 		 1541 aa  257  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2570  YD repeat-containing protein  25.73 
 
 		 1541 aa  255  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1266  YD repeat-containing protein  25.55 
 
 		 1381 aa  254  6e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1403  substrate-binding repeat-containing protein  25.85 
 
 		 1541 aa  254  9.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1322  substrate-binding repeat-containing protein  25.54 
 
 		 1541 aa  252  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0585  YD repeat-containing protein  25.33 
 
 		 1600 aa  251  6e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2806  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  25.34 
 
 		 1552 aa  250  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1171  rhsD protein  25.26 
 
 		 1543 aa  249  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  27.17 
 
 		 1488 aa  246  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8624  YD repeat protein  25.89 
 
 		 1528 aa  244  6e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4988  YD repeat-containing protein  39.95 
 
 		 480 aa  243  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6958  YD repeat protein  26.56 
 
 		 1495 aa  243  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165328  normal  0.66981 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>