221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05964 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05964  hypothetical protein  100 
 
 		 260 aa  536  1e-151  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000227  periplasmic linker protein  74.84 
 
 		 353 aa  248  8e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2870  RND family efflux transporter MFP subunit  49.66 
 
 		 351 aa  148  8e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.551784  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1510  secretion protein HlyD  33.85 
 
 		 357 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1279  HlyD family secretion protein  32.56 
 
 		 359 aa  65.9  0.0000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2778  RND family efflux transporter MFP subunit  28.35 
 
 		 359 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.223876 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1352  organic solvent efflux pump precursor (periplasmic linker protein component)  29.68 
 
 		 359 aa  63.5  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.896212  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2562  RND family efflux transporter MFP subunit  34.58 
 
 		 389 aa  60.1  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.718255  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2293  RND family efflux transporter MFP subunit  33.02 
 
 		 371 aa  59.3  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0671  secretion protein HlyD  29.32 
 
 		 432 aa  59.3  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2690  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.82 
 
 		 360 aa  58.2  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4144  RND family efflux transporter MFP subunit  31.29 
 
 		 365 aa  58.2  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.473768 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0673  multidrug resistance protein  31.82 
 
 		 354 aa  57.8  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1418  RND family efflux transporter MFP subunit  25.41 
 
 		 384 aa  57.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.267918  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1354  HlyD family secretion protein  35.58 
 
 		 364 aa  57  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000336467  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1325  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 370 aa  56.2  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.784041  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003810  linker protein putative  30.71 
 
 		 365 aa  56.2  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0630  secretion protein HlyD  30.48 
 
 		 357 aa  55.8  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0232449  normal  0.116732 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3695  RND family efflux transporter MFP subunit  26.62 
 
 		 360 aa  55.1  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.101272  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02529  putative multidrug resistance protein (substrate binding lipoprotein)  43.86 
 
 		 403 aa  54.3  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4314  RND family efflux transporter MFP subunit  30.7 
 
 		 360 aa  54.3  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00180968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2214  putative component of multidrug efflux system  36.45 
 
 		 368 aa  54.7  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.082194  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2178  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.93 
 
 		 371 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700364  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4902  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.74 
 
 		 368 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02664  putative multidrug resistance protein (substrate binding lipoprotein)  28.65 
 
 		 359 aa  53.1  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0150101  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2022  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.59 
 
 		 358 aa  52.8  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.105064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3992  RND efflux system membrane fusion protein  37.25 
 
 		 366 aa  53.1  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5234  RND family efflux transporter MFP subunit  31.5 
 
 		 355 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05965  hypothetical protein  31.86 
 
 		 357 aa  52.8  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5035  HlyD family secretion protein  32.41 
 
 		 396 aa  52.4  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0034  secretion protein, HlyD family  29.46 
 
 		 369 aa  52.4  0.000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6340  secretion protein HlyD  34.07 
 
 		 369 aa  52  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1739  RND family efflux transporter MFP subunit  34.07 
 
 		 369 aa  52  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357806  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1752  RND family efflux transporter MFP subunit  34.07 
 
 		 369 aa  52  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0668  RND family efflux transporter MFP subunit  23.13 
 
 		 360 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0849  RND family efflux transporter MFP subunit  28.71 
 
 		 360 aa  51.6  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.880012  normal  0.445386 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2797  secretion protein HlyD  32.23 
 
 		 367 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.798419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2115  RND family efflux transporter MFP subunit  27.13 
 
 		 358 aa  51.6  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.243289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3513  RND family efflux transporter MFP subunit  28.71 
 
 		 360 aa  51.6  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1660  RND family efflux transporter MFP subunit  32.41 
 
 		 369 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1963  putative secretion protein, HlyD family  32.41 
 
 		 390 aa  52  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000072673  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3643  RND family efflux transporter MFP subunit  28.71 
 
 		 360 aa  51.6  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1660  RND family efflux transporter MFP subunit  37.33 
 
 		 361 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0915  secretion protein, putative  34.13 
 
 		 368 aa  51.2  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0630  RND family efflux transporter MFP subunit  25.32 
 
 		 364 aa  50.4  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2027  secretion protein HlyD  29.75 
 
 		 390 aa  50.1  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.423658  normal  0.283543 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1939  RND family efflux transporter MFP subunit  27.27 
 
 		 418 aa  50.4  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0238209  hitchhiker  0.000755342 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2037  RND family efflux transporter MFP subunit  27.27 
 
 		 418 aa  50.4  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.421969  normal  0.135437 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0653  RND family efflux transporter MFP subunit  36.36 
 
 		 409 aa  50.4  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.356164  normal  0.176029 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1148  RND family efflux transporter MFP subunit  30.95 
 
 		 373 aa  50.4  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1992  secretion protein HlyD family protein  27.27 
 
 		 418 aa  50.4  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.125579  normal  0.0134883 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2567  RND family efflux transporter MFP subunit  25.53 
 
 		 331 aa  50.4  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.17029 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4661  secretion protein HlyD  31.3 
 
 		 386 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411044 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2095  secretion protein HlyD  27.55 
 
 		 354 aa  49.7  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1968  multidrug efflux pump, membrane fusion protein CzcB subfamily  32.97 
 
 		 394 aa  50.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0347448 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0467  RND family efflux transporter MFP subunit  25.97 
 
 		 360 aa  49.7  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.949455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.95 
 
 		 377 aa  50.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000654  putative efflux protein  32.38 
 
 		 360 aa  49.7  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3214  putative efflux protein  28.57 
 
 		 367 aa  49.3  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2034  RND family efflux transporter MFP subunit  28.18 
 
 		 403 aa  49.3  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3130  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.25 
 
 		 377 aa  48.9  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.645496  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1356  secretion protein HlyD  31.52 
 
 		 365 aa  48.9  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.925373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000228  membrane-fusion protein  32.74 
 
 		 357 aa  48.9  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5081  RND family efflux transporter MFP subunit  30.71 
 
 		 355 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.167851  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5174  RND efflux transporter  30.16 
 
 		 355 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.274772  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5087  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.2 
 
 		 357 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.156095  normal  0.0832308 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1414  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.54 
 
 		 387 aa  48.1  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01876  hypothetical protein  29.1 
 
 		 359 aa  48.1  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1704  secretion protein HlyD  32.99 
 
 		 345 aa  48.5  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000161104  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1081  secretion protein HlyD  34 
 
 		 374 aa  48.1  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.157732  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0429  secretion protein HlyD  26.14 
 
 		 213 aa  48.1  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.398543  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1166  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.71 
 
 		 383 aa  48.5  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000507809  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2289  RND family efflux transporter MFP subunit  30.85 
 
 		 371 aa  47.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.412391  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2285  RND family efflux transporter MFP subunit  27.27 
 
 		 428 aa  47.4  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134622 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4074  secretion protein HlyD  34.91 
 
 		 368 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2292  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.52 
 
 		 383 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.516168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0739  RND family efflux transporter MFP subunit  31.43 
 
 		 371 aa  48.1  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.580961  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1520  RND family efflux transporter MFP subunit  32.22 
 
 		 370 aa  47.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.289277 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4143  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 343 aa  47.4  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.478516 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  29.17 
 
 		 376 aa  47.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003046  membrane-fusion protein  30.69 
 
 		 377 aa  47.4  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4222  secretion protein HlyD  37.5 
 
 		 368 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.163749 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2941  RND family efflux transporter MFP subunit  27.04 
 
 		 397 aa  47  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.224778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2140  RND family efflux transporter MFP subunit  27.38 
 
 		 393 aa  47.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0497  RND family efflux transporter MFP subunit  24.63 
 
 		 423 aa  47  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.479969  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3223  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.58 
 
 		 381 aa  47.4  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4767  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  34 
 
 		 399 aa  46.6  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321733  normal  0.815881 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2445  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  31.25 
 
 		 399 aa  46.6  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2192  secretion protein HlyD  32.35 
 
 		 352 aa  46.6  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2752  RND family efflux transporter MFP subunit  25.51 
 
 		 365 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.239628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1142  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  33.33 
 
 		 400 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1598  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  33.33 
 
 		 400 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.671811  normal  0.334674 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1622  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  33.33 
 
 		 400 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1715  acriflavin resistance periplasmic protein  38.6 
 
 		 357 aa  46.6  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000921401  normal  0.0591325 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2192  RND family efflux transporter MFP subunit  26.36 
 
 		 408 aa  46.2  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3112  RND family efflux transporter MFP subunit  26.13 
 
 		 374 aa  46.2  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0942  acriflavine resistance protein E  27.1 
 
 		 374 aa  46.2  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3140  RND family efflux transporter MFP subunit  38.37 
 
 		 369 aa  46.2  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0889  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.25 
 
 		 384 aa  46.2  0.0005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000000756331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0129  hypothetical protein  45.83 
 
 		 344 aa  46.2  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.993938  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>