91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00633 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00633  periplasmic protein TonB  100 
 
 		 209 aa  420  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001860  ferric siderophore transport system binding protein TonB  90.48 
 
 		 210 aa  346  1e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0610  TonB-like protein  33.91 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00121909  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1828  TonB2 protein  31.94 
 
 		 207 aa  89.7  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3752  putative TonB protein  29.85 
 
 		 203 aa  78.2  0.00000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0901  TonB3 protein  27.8 
 
 		 207 aa  77.8  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.686601  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3075  TonB family protein  31.92 
 
 		 206 aa  77  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000259813  hitchhiker  0.0000181204 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2530  TonB family protein  31.43 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0930867  unclonable  0.0000251685 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2460  TonB family protein  31.43 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.43169  hitchhiker  0.0000000910497 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03431  putative TonB2 protein  33.33 
 
 		 202 aa  75.5  0.0000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2622  TonB family protein  31.43 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052579  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1258  TonB-like protein  33.33 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.973667  hitchhiker  0.0001567 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2648  TonB family protein  33.02 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0343675  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1064  TonB family protein  30.28 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3457  TonB2 protein, putative  30.73 
 
 		 202 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3972  putative TonB protein  31.47 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1521  TonB family protein  31.92 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3539  TonB family protein  27.18 
 
 		 219 aa  71.2  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2622  TonB family protein  32.69 
 
 		 206 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.083203  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2986  TonB family protein  28.86 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.328592  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2421  TonB-like protein  31.9 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00537232  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1629  TonB family protein  31.66 
 
 		 206 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.589143  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2714  TonB family protein  30.39 
 
 		 206 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0362691  decreased coverage  0.0000000109888 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1666  TonB family protein  31.66 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.13034 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1150  tonB2 protein  27.09 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.595511  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2474  TonB family protein  31.16 
 
 		 205 aa  67  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.945787  hitchhiker  0.0000507957 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0905  TonB-like protein  29.79 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02810  TonB2 protein  42.31 
 
 		 131 aa  66.2  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.417398  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0115  TonB protein  27.4 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1644  TonB family protein  30.05 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.219382  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1575  TonB family protein  30.23 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00700508  normal  0.018049 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06756  hypothetical protein  25.48 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4148  TonB family protein  29.13 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0186  TonB family protein  30.1 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0245  TonB family protein  28.02 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2614  TonB-like periplasmic protein  45.45 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.496859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  26.58 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0077  TonB-like protein  39.53 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  32.33 
 
 		 237 aa  54.3  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3957  TonB family protein  26.5 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0385  TonB family protein  33.71 
 
 		 112 aa  53.5  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4564  TonB2 protein, putative  25.74 
 
 		 203 aa  52.4  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2344  TonB family protein  38.1 
 
 		 220 aa  52  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.388453  hitchhiker  0.00869444 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3759  TonB family protein  25.5 
 
 		 203 aa  52  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000844  ferric siderophore transport system binding protein TonB  25.82 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3832  TonB family protein  31.11 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3481  TonB family protein  34.12 
 
 		 363 aa  48.5  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00509083  normal  0.0825777 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  37.5 
 
 		 244 aa  48.1  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72970  TonB protein  32.53 
 
 		 342 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.953349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  37.5 
 
 		 244 aa  48.1  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2537  TonB family protein  34.48 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0741915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1009  TonB family protein  36.17 
 
 		 565 aa  47.4  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0137762 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4804  TonB domain-containing protein  35.29 
 
 		 349 aa  47  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3059  TonB family protein  32.08 
 
 		 285 aa  46.2  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1002  TonB family protein  34.18 
 
 		 260 aa  46.6  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000685032 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1862  TonB-like protein  32.18 
 
 		 332 aa  46.6  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  33.33 
 
 		 249 aa  45.8  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0009  TonB protein  34.62 
 
 		 221 aa  46.2  0.0004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0009  TonB family protein  34.62 
 
 		 221 aa  46.2  0.0004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0573  TonB-like protein  34.85 
 
 		 93 aa  45.8  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  30.95 
 
 		 228 aa  45.8  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4762  TonB domain-containing protein  30.59 
 
 		 367 aa  45.8  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2922  TonB family protein  29.55 
 
 		 458 aa  45.1  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.947626 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2615  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like  28.41 
 
 		 467 aa  45.1  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1890  TonB family protein  32.88 
 
 		 391 aa  44.7  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3561  TonB family protein  32.88 
 
 		 308 aa  44.7  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1499  TonB protein  35.38 
 
 		 371 aa  44.7  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3868  TonB family protein  38.1 
 
 		 227 aa  43.5  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1444  TonB family protein  35.38 
 
 		 371 aa  43.9  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.232122  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1508  TonB family protein  32.95 
 
 		 121 aa  43.9  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4383  TonB domain/peptidase M56 domain-containing protein  27.71 
 
 		 700 aa  43.5  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0356  periplasmic protein TonB  22.84 
 
 		 199 aa  43.5  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0245094  normal  0.451591 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0245  TonB-like protein  28.24 
 
 		 255 aa  43.5  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.854856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2444  TonB domain-containing protein  32.14 
 
 		 361 aa  43.5  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0960107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1236  TonB family protein  30.11 
 
 		 269 aa  43.9  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0873  TonB family protein  31.58 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3738  TonB family protein  35.94 
 
 		 404 aa  43.1  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4331  TonB family protein  33.75 
 
 		 288 aa  43.1  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.141316  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1889  hypothetical protein  34.33 
 
 		 462 aa  43.1  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0876  TonB family protein  26.09 
 
 		 205 aa  43.1  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3286  TonB family protein  33.33 
 
 		 368 aa  43.1  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0146  TonB family protein  33.75 
 
 		 287 aa  43.1  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1403  TonB family protein  27.63 
 
 		 231 aa  42.7  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0560  TonB-like protein  28.3 
 
 		 352 aa  42.4  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000337767  normal  0.21091 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  34.21 
 
 		 258 aa  42  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3146  TonB family protein  32.05 
 
 		 223 aa  42  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00104452  normal  0.89985 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3342  antirepressor regulating drug resistance protein  29.47 
 
 		 403 aa  42  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2999  TonB family protein  33.33 
 
 		 396 aa  41.6  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3235  TonB family protein  39.29 
 
 		 225 aa  41.6  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1782  TonB family protein  32.56 
 
 		 252 aa  41.6  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3579  TonB family protein  39.62 
 
 		 245 aa  41.2  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>