More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003284 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003284  integrase  100 
 
 		 401 aa  837    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  35.7 
 
 		 429 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  36.85 
 
 		 421 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  38.5 
 
 		 412 aa  247  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  36.84 
 
 		 404 aa  243  5e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3658  putative bacteriophage integrase  29.3 
 
 		 444 aa  164  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2002  phage integrase  46.3 
 
 		 188 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  37.4 
 
 		 367 aa  143  5e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3424  integrase family protein  28.28 
 
 		 437 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.728899 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1136  phage integrase family protein  28.57 
 
 		 513 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  27.81 
 
 		 379 aa  126  9e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  30.61 
 
 		 402 aa  123  7e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0789  phage integrase family protein  28.19 
 
 		 444 aa  119  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  29.17 
 
 		 353 aa  117  3.9999999999999997e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3738  hypothetical protein  28.84 
 
 		 384 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  39.33 
 
 		 159 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  28.24 
 
 		 384 aa  111  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3986  phage integrase family site specific recombinase  37.01 
 
 		 172 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1554  putative integrase/recombinase protein  30.77 
 
 		 354 aa  107  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  26.83 
 
 		 400 aa  107  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  29.84 
 
 		 359 aa  104  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  31.73 
 
 		 334 aa  103  8e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  27.04 
 
 		 397 aa  102  9e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  27.59 
 
 		 397 aa  102  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  32.41 
 
 		 337 aa  102  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0995  site-specific recombinase, phage integrase family  28.93 
 
 		 349 aa  100  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00503137  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  27.39 
 
 		 411 aa  100  6e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  27.62 
 
 		 251 aa  100  7e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1037  Phage integrase  30.88 
 
 		 338 aa  99.8  8e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3398  phage integrase family site specific recombinase  30.15 
 
 		 407 aa  99  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  26.3 
 
 		 379 aa  99  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  25.87 
 
 		 396 aa  98.2  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0810  site-specific recombinase/integrase  26.13 
 
 		 482 aa  97.8  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0879139  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  27.49 
 
 		 378 aa  98.2  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3783  integrase family protein  34.27 
 
 		 334 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1533  phage integrase family protein  28.16 
 
 		 304 aa  96.3  8e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.372982  normal  0.858007 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  26.92 
 
 		 388 aa  96.3  9e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0832  Phage integrase  27.01 
 
 		 341 aa  95.9  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1247  putative phage related integrase  25.95 
 
 		 434 aa  94.7  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  23.98 
 
 		 451 aa  94.7  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0996  phage integrase family protein  26.78 
 
 		 387 aa  94  5e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000294682 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0165  integrase family protein  28.57 
 
 		 369 aa  93.6  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0290  integrase  28.18 
 
 		 324 aa  93.2  7e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0955438  normal  0.658855 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3005  phage integrase family site specific recombinase  27.73 
 
 		 369 aa  92  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1532  phage integrase family site specific recombinase  27.73 
 
 		 369 aa  92  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3300  phage integrase family site specific recombinase  27.73 
 
 		 369 aa  92  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.248425  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3070  prophage DLP12 integrase  27.73 
 
 		 369 aa  92  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  26.79 
 
 		 354 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0366  site-specific recombinase, phage integrase family  28.05 
 
 		 387 aa  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529105  hitchhiker  0.00000000819042 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0770  phage integrase family protein  27.88 
 
 		 387 aa  91.7  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.17567  normal  0.038003 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2093  integrase family protein  22.92 
 
 		 400 aa  91.3  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  26.72 
 
 		 393 aa  91.7  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  26.79 
 
 		 354 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  24.1 
 
 		 325 aa  91.3  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  24.25 
 
 		 381 aa  91.3  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  26.07 
 
 		 378 aa  90.9  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1227  integrase family protein  25.92 
 
 		 424 aa  90.9  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149921  normal  0.536296 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  26.24 
 
 		 377 aa  90.5  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  24.11 
 
 		 477 aa  90.5  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2809  integrase family protein  34.69 
 
 		 338 aa  90.5  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0272  phage integrase family site specific recombinase  29 
 
 		 386 aa  90.1  6e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3128  integrase family protein  29.05 
 
 		 384 aa  90.1  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.169868  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1092  phage integrase  26.7 
 
 		 276 aa  89.7  8e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00970061  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1037  phage integrase family protein  23.2 
 
 		 372 aa  89.4  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.197081  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00486  predicted integrase  27.63 
 
 		 387 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00491  hypothetical protein  27.63 
 
 		 387 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  26.04 
 
 		 392 aa  88.6  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0600  prophage DLP12 integrase  24.61 
 
 		 387 aa  89  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000371504 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0603  prophage DLP12 integrase  24.09 
 
 		 387 aa  88.6  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.591827  normal  0.109932 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1337  integrase family protein  25.32 
 
 		 392 aa  87.4  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0155558  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  24.22 
 
 		 390 aa  87.4  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  25.3 
 
 		 392 aa  86.7  8e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2847  phage integrase  32.22 
 
 		 366 aa  86.3  9e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0438  hypothetical protein  27.45 
 
 		 337 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1997  site specific recombinase  26.59 
 
 		 279 aa  85.5  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.151252 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  25.6 
 
 		 414 aa  85.1  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2297  integrative genetic element Ppu40, integrase  27.1 
 
 		 274 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880812  normal  0.023746 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3047  phage integrase  28.17 
 
 		 381 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.182322  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  27.84 
 
 		 275 aa  84.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1465  integrase family protein  30.62 
 
 		 334 aa  84  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.890522 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1100  phage integrase family protein  24.43 
 
 		 383 aa  84  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  26.48 
 
 		 376 aa  83.6  0.000000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  23.76 
 
 		 337 aa  82.8  0.000000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  23.43 
 
 		 412 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1633  Phage integrase  25.36 
 
 		 368 aa  82.8  0.00000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.576304  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0447  phage integrase  28.81 
 
 		 381 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0671  phage integrase family protein  21.92 
 
 		 401 aa  82.8  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.707055 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0926  phage integrase family protein  28.81 
 
 		 381 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0712  integrase family protein  27.24 
 
 		 285 aa  82.8  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00227312  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3132  phage integrase family site specific recombinase  27.9 
 
 		 222 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4029  integrase family protein  23.31 
 
 		 467 aa  82  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.0270341 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  23.13 
 
 		 370 aa  82  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  30.9 
 
 		 431 aa  80.9  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4398  integrase family protein  23.08 
 
 		 451 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0364227  hitchhiker  0.00879025 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1615  phage integrase family protein  24.39 
 
 		 368 aa  81.3  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0481425  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1727  phage integrase  27.23 
 
 		 267 aa  80.5  0.00000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2865  site-specific recombinase XerD-like  23.46 
 
 		 417 aa  80.1  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.11888  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0776  phage integrase  25.61 
 
 		 334 aa  79.3  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.228831  normal  0.0322595 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3720  phage integrase family protein  22.83 
 
 		 451 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  22.56 
 
 		 391 aa  79.3  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>