More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2025 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013526  Tter_2025  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 434 aa  895    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165485  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11600  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.73 
 
 		 444 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.558288  normal  0.039331 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2031  extracellular solute-binding protein family 1  25.4 
 
 		 442 aa  132  9e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.298737 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  26.16 
 
 		 434 aa  129  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1879  extracellular solute-binding protein  25.06 
 
 		 452 aa  116  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2896  extracellular solute-binding protein  25.06 
 
 		 452 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6584  ABC transporter sugar binding protein  27.56 
 
 		 437 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0411  extracellular solute-binding protein family 1  29.37 
 
 		 449 aa  114  4.0000000000000004e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.439626  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3222  extracellular solute-binding protein family 1  27.04 
 
 		 457 aa  108  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.950328  normal  0.818094 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03920  carbohydrate-binding protein  26.85 
 
 		 437 aa  107  5e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3641  extracellular solute-binding protein  25.54 
 
 		 444 aa  99  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0284  extracellular solute-binding protein family 1  24.67 
 
 		 410 aa  97.1  6e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0514987  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1454  extracellular solute-binding protein family 1  26.15 
 
 		 445 aa  96.3  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0381  extracellular solute-binding protein family 1  22.58 
 
 		 445 aa  95.5  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.491759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0508  extracellular solute-binding protein family 1  25.37 
 
 		 421 aa  95.1  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000506303  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6524  extracellular solute-binding protein family 1  27.49 
 
 		 424 aa  94  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.514278  normal  0.451088 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6112  extracellular solute-binding protein family 1  27.79 
 
 		 424 aa  94  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0310  extracellular solute-binding protein family 1  26.3 
 
 		 440 aa  93.2  8e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0877495  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  24.76 
 
 		 412 aa  91.3  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06560  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.45 
 
 		 453 aa  91.3  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5099  extracellular solute-binding protein family 1  24.5 
 
 		 444 aa  89.7  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.291523  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  24.52 
 
 		 412 aa  89.7  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  24.54 
 
 		 412 aa  89.4  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0842  extracellular solute-binding protein family 1  24.29 
 
 		 432 aa  87  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.516605 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1215  extracellular solute-binding protein family 1  25.73 
 
 		 446 aa  87.4  5e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000064062  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2862  extracellular solute-binding protein family 1  23.77 
 
 		 467 aa  87.4  5e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04000  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.17 
 
 		 445 aa  87  6e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0130  extracellular solute-binding protein  23.25 
 
 		 462 aa  85.9  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4419  extracellular solute-binding protein family 1  26 
 
 		 456 aa  86.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0048  extracellular solute-binding protein family 1  23.91 
 
 		 434 aa  84.7  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0922  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  24.4 
 
 		 447 aa  84.3  0.000000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.755265  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0917  extracellular solute-binding protein family 1  23.9 
 
 		 455 aa  82.8  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.728334  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2808  extracellular solute-binding protein family 1  25.32 
 
 		 430 aa  80.9  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.512241 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3566  extracellular solute-binding protein  23.62 
 
 		 454 aa  80.9  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.42847  normal  0.297516 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0828  extracellular solute-binding protein  24.18 
 
 		 424 aa  80.5  0.00000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.142269  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  23.3 
 
 		 430 aa  80.5  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04270  extracellular solute-binding protein family 1  21.8 
 
 		 418 aa  80.1  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  23.32 
 
 		 399 aa  79  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1927  extracellular solute-binding protein family 1  23.9 
 
 		 439 aa  79  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1594  extracellular solute-binding protein family 1  29.33 
 
 		 961 aa  78.6  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2574  extracellular solute-binding protein family 1  23.32 
 
 		 449 aa  77.8  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316894  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1359  extracellular solute-binding protein  24.34 
 
 		 458 aa  77.8  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3304  extracellular solute-binding protein family 1  24.58 
 
 		 441 aa  77.8  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753481 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4136  extracellular solute-binding protein  24.41 
 
 		 424 aa  77  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.518326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4188  extracellular solute-binding protein family 1  25.24 
 
 		 454 aa  76.6  0.0000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.643354  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  23.82 
 
 		 456 aa  76.3  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04070  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25 
 
 		 444 aa  75.1  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2315  extracellular solute-binding protein  28.99 
 
 		 455 aa  75.1  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2513  extracellular solute-binding protein family 1  23.38 
 
 		 441 aa  74.7  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3308  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.68 
 
 		 450 aa  72.8  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1099  extracellular solute-binding protein  22.1 
 
 		 420 aa  72.8  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000491601  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0556  extracellular solute-binding protein family 1  23.73 
 
 		 430 aa  71.6  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.71623 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3566  extracellular solute-binding protein family 1  22.38 
 
 		 434 aa  70.5  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0143758 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1785  extracellular solute-binding protein family 1  24.19 
 
 		 424 aa  69.7  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.155279  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1522  extracellular solute-binding protein family 1  24.38 
 
 		 421 aa  69.7  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.569671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0923  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  27.37 
 
 		 450 aa  68.9  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.293658  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4488  extracellular solute-binding protein family 1  24.91 
 
 		 434 aa  67.8  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.395657  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17020  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.38 
 
 		 431 aa  67.4  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00301962  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0972  extracellular solute-binding protein family 1  24.18 
 
 		 421 aa  67  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  28.67 
 
 		 420 aa  67  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0736  extracellular solute-binding protein family 1  23.59 
 
 		 421 aa  66.6  0.0000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4289  extracellular solute-binding protein  27.21 
 
 		 466 aa  66.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2714  extracellular solute-binding protein family 1  27.67 
 
 		 414 aa  66.2  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.36636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3121  extracellular solute-binding protein family 1  25.43 
 
 		 445 aa  66.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116931 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2297  extracellular solute-binding protein  22.4 
 
 		 416 aa  66.2  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7173  sugar transport system (sugar-binding protein)  22.01 
 
 		 433 aa  66.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.119283 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0890  extracellular solute-binding protein  23.48 
 
 		 450 aa  65.9  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.315589  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1064  extracellular solute-binding protein  24.74 
 
 		 480 aa  65.9  0.000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.075314 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5330  extracellular solute-binding protein family 1  22.06 
 
 		 438 aa  65.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489769  normal  0.341368 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  22.51 
 
 		 410 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  26.21 
 
 		 504 aa  65.1  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27690  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.54 
 
 		 431 aa  64.7  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.340884 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2644  extracellular solute-binding protein family 1  23.67 
 
 		 431 aa  64.3  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  22.27 
 
 		 410 aa  63.9  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4320  extracellular solute-binding protein family 1  24.73 
 
 		 425 aa  63.9  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  hitchhiker  0.00841489 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1736  extracellular solute-binding protein family 1  22.88 
 
 		 435 aa  63.5  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.395658  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  20.24 
 
 		 434 aa  63.5  0.000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  23.71 
 
 		 411 aa  63.2  0.000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0934  putative solute binding lipoprotein  23.84 
 
 		 432 aa  63.2  0.000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.46058  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  24.12 
 
 		 424 aa  62.4  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5459  extracellular solute-binding protein  21.05 
 
 		 422 aa  62.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  23.39 
 
 		 411 aa  61.6  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  23.39 
 
 		 411 aa  61.6  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  25.1 
 
 		 419 aa  60.8  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2399  extracellular solute-binding protein family 1  23.28 
 
 		 433 aa  61.2  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275508 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  23.81 
 
 		 415 aa  60.8  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2859  extracellular solute-binding protein  20.24 
 
 		 417 aa  60.5  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.511665  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  22.9 
 
 		 430 aa  60.5  0.00000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  23.49 
 
 		 446 aa  60.1  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4289  extracellular solute-binding protein family 1  25.49 
 
 		 400 aa  60.1  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.53848  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6282  extracellular solute-binding protein family 1  21.49 
 
 		 433 aa  60.5  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  22.57 
 
 		 424 aa  59.7  0.00000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.35 
 
 		 426 aa  59.7  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1762  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  23.26 
 
 		 438 aa  59.7  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000740157  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1008  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  23.2 
 
 		 449 aa  58.9  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2703  extracellular solute-binding protein family 1  24.82 
 
 		 450 aa  59.3  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263225  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  21.56 
 
 		 433 aa  59.3  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1891  extracellular solute-binding protein family 1  24.46 
 
 		 447 aa  59.3  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.276259 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0101  extracellular solute-binding protein family 1  23.24 
 
 		 438 aa  58.5  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.494877  normal  0.060225 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  22.56 
 
 		 430 aa  58.5  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>