291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4132 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_4132  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 192 aa  380  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21360  transcriptional regulator, TetR family  40.78 
 
 		 206 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.127836  normal  0.357603 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2976  regulatory protein TetR  43.32 
 
 		 199 aa  119  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3348  TetR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 185 aa  117  7e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3070  transcriptional regulator, TetR family  46.31 
 
 		 216 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2792  TetR family transcriptional regulator  38.42 
 
 		 190 aa  111  7.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.782155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3074  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3134  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.641409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3091  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0742554 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3625  TetR family transcriptional regulator  38.34 
 
 		 190 aa  100  9e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1930  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 206 aa  95.9  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189169  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1662  transcriptional regulator, TetR family  35.41 
 
 		 213 aa  94  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.552653  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 220 aa  90.1  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0033  tetracycline repressor protein, class A  33.33 
 
 		 225 aa  89.4  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.370137  normal  0.333737 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0152  tetracycline repressor protein, class A  33.33 
 
 		 225 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0043  tetracycline repressor protein R, class A  33.33 
 
 		 225 aa  89.4  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0658  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 211 aa  87  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0279  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 210 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0763  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 210 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.756053  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0732  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 210 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0683  TetR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 211 aa  84.3  9e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4216  putative transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 212 aa  82  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00833872  hitchhiker  0.000365538 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2728  putative transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 200 aa  81.6  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.427892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3851  TetR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 210 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7060  tetracycline repressor domain-containing protein  32.67 
 
 		 203 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0598818  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19490  transcriptional regulator, tetR family  51.58 
 
 		 168 aa  75.5  0.0000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 271 aa  75.1  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5105  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000423081  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1677  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00000521041  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  33.1 
 
 		 218 aa  67.8  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  24.67 
 
 		 285 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  25.23 
 
 		 268 aa  64.7  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0215  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 246 aa  64.3  0.0000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.674801 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  23.64 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1704  transcriptional regulator, TetR family  41.98 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326361  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 239 aa  61.6  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0819  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 237 aa  61.6  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 228 aa  61.2  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5638  TetR family transcriptional regulator  22.83 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491763  normal  0.336395 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3273  Tetracyclin repressor domain protein  29.8 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.120229  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2285  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8986  putative transcriptional regulator, TetR family  35.35 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3395  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 173 aa  58.9  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.542573  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1551  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 225 aa  57.8  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209171  normal  0.107881 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  27.89 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2480  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0883171  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2997  transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00034517  decreased coverage  0.000048455 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  27.7 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4572  putative transcriptional regulator, TetR family  55.56 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145324  normal  0.111989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  31.86 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3954  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00776564  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 272 aa  55.5  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3544  transcriptional regulator, TetR family  27.46 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.164716  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2683  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  28.91 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2840  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 238 aa  54.7  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3174  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0201096  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 235 aa  54.7  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1404  hypothetical protein  25.7 
 
 		 227 aa  54.3  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.245587  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  26.32 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  29.8 
 
 		 223 aa  53.9  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2596  TetR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 257 aa  53.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1498  TetR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 244 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98693  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1521  TetR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 244 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.290905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1989  TetR family transcriptional regulator  22.9 
 
 		 250 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1498  TetR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 244 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4763  transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 		 252 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000323039  decreased coverage  0.0000700922 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3817  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 223 aa  52.8  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131002  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  25.73 
 
 		 233 aa  52.8  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6418  transcriptional regulator, TetR family  25.47 
 
 		 259 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  28.91 
 
 		 263 aa  52.8  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4284  transcriptional regulator, TetR family  34.02 
 
 		 223 aa  52.8  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  28.38 
 
 		 210 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0837  transcriptional regulator, TetR family  27.92 
 
 		 238 aa  52  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.895795  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2646  transcriptional regulator, TetR family  26.36 
 
 		 236 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2337  transcriptional regulator, TetR family  32.82 
 
 		 218 aa  51.6  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1710  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 200 aa  51.6  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 234 aa  51.2  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 250 aa  51.2  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4355  TetR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 244 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  25.37 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 249 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2378  transcriptional repressor TetR  26.79 
 
 		 260 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287531  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 253 aa  50.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  25.35 
 
 		 234 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1770  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 250 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1817  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 250 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 222 aa  50.8  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1751  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 250 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 242 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3397  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 222 aa  49.7  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15089  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>