More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12528 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12528  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 215 aa  424  1e-118  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0275989 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3637  TetR family transcriptional regulator  72.5 
 
 		 207 aa  285  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.262942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3632  TetR family transcriptional regulator  72.5 
 
 		 207 aa  285  5e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3705  TetR family transcriptional regulator  72.5 
 
 		 207 aa  285  5e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  69 
 
 		 206 aa  273  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4092  TetR family transcriptional regulator  69.15 
 
 		 206 aa  268  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1384  TetR family transcriptional regulator  49.28 
 
 		 225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00670258  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1402  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 220 aa  174  7e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000946721 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  53.46 
 
 		 195 aa  160  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  51.48 
 
 		 222 aa  158  7e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  48.52 
 
 		 195 aa  157  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  51.88 
 
 		 197 aa  154  7e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1353  regulatory protein TetR  51.63 
 
 		 210 aa  151  5.9999999999999996e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273808  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0122  transcriptional regulator, TetR family  49.41 
 
 		 204 aa  150  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.288839  decreased coverage  0.00195597 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4052  TetR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 160 aa  147  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.587614  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1469  transcriptional regulator, TetR family  50.9 
 
 		 197 aa  145  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1731  transcriptional regulator, TetR family  45.36 
 
 		 196 aa  143  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0465827  normal  0.0150851 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0949  TetR family transcriptional regulator  47.02 
 
 		 190 aa  138  7.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0189696  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0024  TetR family transcriptional regulator  45.5 
 
 		 193 aa  136  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3322  transcriptional regulator, TetR family  50.29 
 
 		 206 aa  135  4e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6414  putative transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 199 aa  135  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275703  normal  0.0113093 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3263  transcriptional regulator, TetR family  49.06 
 
 		 194 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0030  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 193 aa  132  5e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0140  TetR family transcriptional regulator  43.78 
 
 		 182 aa  128  7.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06840  transcriptional regulator, tetR family  48.59 
 
 		 215 aa  125  6e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1978  transcriptional regulator, TetR family  44.58 
 
 		 195 aa  118  7e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000952091  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0360  TetR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 193 aa  106  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 220 aa  105  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3985  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 425 aa  99.8  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3205  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 197 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3267  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 197 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0261097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3216  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 197 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.278224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2475  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 363 aa  94.7  9e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.161368 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  32.94 
 
 		 400 aa  88.2  8e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  36.08 
 
 		 309 aa  79  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  32.34 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4505  regulatory protein TetR  30.92 
 
 		 390 aa  77  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 388 aa  74.3  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3131  regulatory protein TetR  29.61 
 
 		 403 aa  72  0.000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1507  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 412 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.759911  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1530  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 412 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5264  transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 470 aa  70.5  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.641699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1507  TetR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 412 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0719  TetR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 408 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260522 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  29.41 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 206 aa  67  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0186  TetR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 410 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1640  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 393 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11992  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 406 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4683  transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 		 385 aa  65.5  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1538  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 394 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1561  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 394 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1509  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 394 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0710  transcriptional regulator, TetR family  39.53 
 
 		 248 aa  62  0.000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  34.82 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  33.54 
 
 		 216 aa  62  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  32.92 
 
 		 221 aa  62  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  32.48 
 
 		 206 aa  62  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3994  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 391 aa  61.6  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.777734 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  32.17 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  31.76 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0013  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 424 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0542947  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  27.07 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0008  transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.643837 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4179  transcriptional regulator, TetR family  26.49 
 
 		 396 aa  58.9  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00482  NADH dehydrogenase  42.86 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0266  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.437766  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0559  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 451 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0760  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0913287  normal  0.16222 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0571  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 428 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.108649  hitchhiker  0.00715519 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 243 aa  58.5  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0549  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 451 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.166167  normal  0.823365 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  47.95 
 
 		 266 aa  58.2  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 208 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 214 aa  58.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>