More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1138 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_1138  MATE efflux family protein  100 
 
 		 450 aa  900    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000318212  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2828  MATE efflux family protein  35.19 
 
 		 463 aa  285  1.0000000000000001e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2514  MATE efflux family protein  35.19 
 
 		 463 aa  285  1.0000000000000001e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0279  MATE efflux family protein  37.64 
 
 		 445 aa  283  4.0000000000000003e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2766  MATE efflux family protein  34.75 
 
 		 453 aa  278  2e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0984562  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0830  MATE efflux family protein  35.91 
 
 		 445 aa  265  2e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000918772  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0897  MATE efflux family protein  32.43 
 
 		 453 aa  258  1e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000262958  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0330  MATE efflux family protein  32.82 
 
 		 479 aa  251  2e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0857  MATE efflux family protein  32.96 
 
 		 458 aa  246  6e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0848  MATE efflux family protein  32.29 
 
 		 458 aa  246  6e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.720761  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0621  MATE efflux family protein  32.13 
 
 		 460 aa  245  9.999999999999999e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.27098  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1116  MATE efflux family protein  32.36 
 
 		 456 aa  224  3e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0522  MATE efflux family protein  30.67 
 
 		 461 aa  200  5e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0994  MATE efflux family protein  27.68 
 
 		 449 aa  198  2.0000000000000003e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1981  MATE efflux family protein  28.7 
 
 		 455 aa  193  5e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000219259  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0537  hypothetical protein  29.91 
 
 		 460 aa  189  1e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2022  multidrug efflux pump  27.35 
 
 		 459 aa  182  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.54695  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1237  hypothetical protein  28.73 
 
 		 458 aa  181  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0290804  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02650  hypothetical protein  27.48 
 
 		 458 aa  177  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000109  adhesin  27.17 
 
 		 461 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.466925  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0743  MATE efflux family protein  26.93 
 
 		 484 aa  174  3.9999999999999995e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000192336  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05715  Na+-driven multidrug efflux pump  27.19 
 
 		 461 aa  172  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003772  Na+ driven multidrug efflux pump  28.15 
 
 		 458 aa  171  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3712  MATE efflux family protein  30.04 
 
 		 454 aa  166  9e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139203  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2475  MATE efflux family protein  28.79 
 
 		 463 aa  164  3e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.211957  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2425  MATE efflux family protein  27.97 
 
 		 461 aa  161  3e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.264518  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0596  hypothetical protein  29.59 
 
 		 449 aa  151  2e-35  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.207285  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  28.86 
 
 		 453 aa  145  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  27.23 
 
 		 483 aa  138  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0981  MATE efflux family protein  24.77 
 
 		 456 aa  138  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.730082  normal  0.0880752 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  28.02 
 
 		 438 aa  136  8e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2630  MATE efflux family protein  24.43 
 
 		 472 aa  135  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.850794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4103  Na+ driven multidrug efflux pump  24.94 
 
 		 463 aa  133  6e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0660054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1343  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 464 aa  133  6e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000317655  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1106  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 464 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000560081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1088  efflux protein  24.94 
 
 		 464 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000024435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1082  efflux protein  24.94 
 
 		 464 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000125629  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1196  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 464 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000655029  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1239  MATE efflux family protein  25.17 
 
 		 464 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.238085  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1305  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 464 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.40401  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1266  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 464 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  24.72 
 
 		 468 aa  129  9.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  26.49 
 
 		 464 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  26.49 
 
 		 464 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1094  MATE efflux family protein  23.6 
 
 		 464 aa  126  6e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000923462  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0901  MATE efflux family protein  24.71 
 
 		 463 aa  126  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000627796  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  25.67 
 
 		 469 aa  124  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0427  MATE efflux family protein  23.2 
 
 		 446 aa  124  5e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.744275  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  23.93 
 
 		 475 aa  122  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0597  hypothetical protein  25.5 
 
 		 444 aa  122  1.9999999999999998e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  26.21 
 
 		 445 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  24.32 
 
 		 469 aa  117  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  24.77 
 
 		 459 aa  117  5e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3419  MATE efflux family protein  26.88 
 
 		 504 aa  117  6e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1541  MATE efflux family protein  28.29 
 
 		 486 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0686  MATE efflux family protein  28.74 
 
 		 498 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.221481  normal  0.278001 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  24.83 
 
 		 461 aa  114  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  25.54 
 
 		 475 aa  114  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  24.11 
 
 		 452 aa  112  9e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  27.46 
 
 		 463 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0998  MATE efflux family protein  23.85 
 
 		 500 aa  110  6e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.280475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1359  multi anti extrusion protein MatE  26.35 
 
 		 408 aa  108  2e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  25.24 
 
 		 500 aa  105  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  24.2 
 
 		 464 aa  105  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0648  mate efflux family protein  25.06 
 
 		 440 aa  103  5e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.849411  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1672  MATE efflux family protein  23.95 
 
 		 498 aa  103  7e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  23.83 
 
 		 450 aa  102  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2247  Na+-driven multidrug efflux pump  25.54 
 
 		 464 aa  102  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0875  mate efflux family protein  24.14 
 
 		 446 aa  102  2e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  25.49 
 
 		 462 aa  101  3e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  24.23 
 
 		 467 aa  100  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3236  MATE efflux family protein  24.17 
 
 		 502 aa  100  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  22.4 
 
 		 461 aa  99  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  26.17 
 
 		 477 aa  98.2  2e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  25.47 
 
 		 481 aa  98.6  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3760  MATE efflux family protein  21.49 
 
 		 464 aa  97.8  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4400  MATE efflux family protein  25.71 
 
 		 453 aa  97.4  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0055  MATE efflux family protein  23.77 
 
 		 446 aa  97.4  5e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  26.67 
 
 		 454 aa  97.4  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  25 
 
 		 458 aa  97.4  5e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  23.9 
 
 		 467 aa  97.1  6e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  24.82 
 
 		 525 aa  94.4  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6399  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 425 aa  94  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.444399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1415  MATE efflux family protein  23.81 
 
 		 466 aa  93.2  8e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.167041 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1907  MATE efflux family protein  24.38 
 
 		 457 aa  93.2  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0742597  normal  0.100602 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4468  MATE efflux family protein  23.65 
 
 		 481 aa  93.2  8e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0713709  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3886  MATE efflux family protein  24.77 
 
 		 481 aa  92.8  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1139  hypothetical protein  23.15 
 
 		 484 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000023845  hitchhiker  0.0000334983 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01896  predicted multidrug efflux system  23.15 
 
 		 547 aa  91.7  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0202846  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2542  MATE efflux family protein  25.27 
 
 		 459 aa  91.3  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2267  hypothetical protein  23.15 
 
 		 546 aa  91.7  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000010697  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01885  hypothetical protein  23.15 
 
 		 547 aa  91.7  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0187925  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1669  MATE efflux family protein  23.15 
 
 		 495 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135228  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2939  multidrug resistance protein  26.35 
 
 		 468 aa  91.3  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000251457  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2108  hypothetical protein  23.6 
 
 		 546 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.24671e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  24.72 
 
 		 468 aa  90.9  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  23.87 
 
 		 500 aa  90.5  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3112  multidrug efflux protein  23.69 
 
 		 465 aa  90.1  7e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1659  hypothetical protein  23.15 
 
 		 495 aa  90.1  8e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000439345  normal  0.0451104 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2156  MATE efflux family protein  24.77 
 
 		 451 aa  89.7  9e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.540946 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>