More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2157 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_2157  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 430 aa  877    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0345  hypothetical protein  38.7 
 
 		 421 aa  302  8.000000000000001e-81  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1363  FAD dependent oxidoreductase  38.73 
 
 		 420 aa  288  2e-76  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0226  FAD dependent oxidoreductase  29.09 
 
 		 518 aa  155  1e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0635  FAD dependent oxidoreductase  29.51 
 
 		 516 aa  155  1e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.470789 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3166  FAD dependent oxidoreductase  26.97 
 
 		 539 aa  153  5.9999999999999996e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1673  FAD dependent oxidoreductase  27.13 
 
 		 537 aa  146  7.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0012513  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0537  FAD dependent oxidoreductase  27.08 
 
 		 533 aa  144  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0939614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  26.67 
 
 		 555 aa  144  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3288  FAD dependent oxidoreductase  25.33 
 
 		 537 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3934  FAD dependent oxidoreductase  26.78 
 
 		 549 aa  132  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217875  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3492  FAD dependent oxidoreductase  25.62 
 
 		 536 aa  128  3e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  25.43 
 
 		 547 aa  125  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  24.48 
 
 		 533 aa  124  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2365  FAD dependent oxidoreductase  25.95 
 
 		 535 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0283536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4029  FAD dependent oxidoreductase  25.62 
 
 		 536 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150408  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2878  amine oxidase  25.18 
 
 		 527 aa  118  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.700832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3375  FAD dependent oxidoreductase  26.33 
 
 		 536 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0710471  hitchhiker  0.0059341 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2541  putative phytoene dehydrogenase  26.45 
 
 		 530 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.553028 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3854  FAD dependent oxidoreductase  24.86 
 
 		 530 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1271  amine oxidase  24.71 
 
 		 530 aa  109  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2014  FAD dependent oxidoreductase  25.14 
 
 		 552 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.166375  normal  0.451875 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2744  FAD dependent oxidoreductase  23.95 
 
 		 535 aa  107  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294261  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2838  FAD dependent oxidoreductase  26.54 
 
 		 531 aa  104  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320797  normal  0.430895 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0948  FAD dependent oxidoreductase  23.09 
 
 		 536 aa  102  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3530  oxidoreductase  26.12 
 
 		 531 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3174  FAD dependent oxidoreductase  26.12 
 
 		 531 aa  102  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.919135 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1505  FAD dependent oxidoreductase  23.3 
 
 		 527 aa  101  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00846828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  25.14 
 
 		 556 aa  101  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3380  amine oxidase  24.67 
 
 		 532 aa  100  5e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3444  amine oxidase  24.67 
 
 		 532 aa  100  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5076  FAD dependent oxidoreductase  23.36 
 
 		 520 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  25.56 
 
 		 556 aa  93.6  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13863  dehydrogenase  23.38 
 
 		 536 aa  92  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  23.61 
 
 		 564 aa  92  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0381  amine oxidase  24.37 
 
 		 510 aa  91.7  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  25.78 
 
 		 547 aa  90.1  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  24.28 
 
 		 510 aa  88.6  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  23.68 
 
 		 563 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  23.25 
 
 		 565 aa  84.7  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1978  FAD dependent oxidoreductase  25.38 
 
 		 534 aa  84.7  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413393  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2146  FAD dependent oxidoreductase  23.77 
 
 		 505 aa  83.6  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.220753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1278  FAD dependent oxidoreductase  26.69 
 
 		 523 aa  82.8  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1935  FAD dependent oxidoreductase  23.59 
 
 		 521 aa  82  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.790128  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2257  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  22.94 
 
 		 520 aa  82  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5019  hypothetical protein  22.22 
 
 		 516 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579081 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  21.97 
 
 		 559 aa  78.2  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  22.69 
 
 		 554 aa  77.4  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6398  amine oxidase  23.7 
 
 		 504 aa  77.4  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0647051 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2310  FAD dependent oxidoreductase  24.85 
 
 		 514 aa  77  0.0000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.6902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  21.94 
 
 		 528 aa  76.6  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  22.09 
 
 		 493 aa  76.3  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  23.46 
 
 		 554 aa  75.9  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0637  putative dehydrogenase  24.09 
 
 		 548 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0715988 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03711  phytoene dehydrogenase  23.8 
 
 		 509 aa  75.1  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1701  amine oxidase  23.54 
 
 		 503 aa  75.5  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00066646 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03701  phytoene dehydrogenase  23.45 
 
 		 509 aa  74.7  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0640229  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1027  C-3',4' desaturase CrtD  22.97 
 
 		 504 aa  74.3  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0988  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 528 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  22.5 
 
 		 547 aa  73.6  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0263  FAD dependent oxidoreductase  23.63 
 
 		 513 aa  71.6  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1677  FAD dependent oxidoreductase  24.92 
 
 		 519 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3302  FAD dependent oxidoreductase  34.03 
 
 		 532 aa  71.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  32.12 
 
 		 510 aa  70.9  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  22.37 
 
 		 529 aa  70.9  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2342  amine oxidase  22.79 
 
 		 505 aa  70.1  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1160  FAD dependent oxidoreductase  24.18 
 
 		 516 aa  70.1  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4888  FAD dependent oxidoreductase  23.79 
 
 		 520 aa  70.1  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.162383 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2192  FAD dependent oxidoreductase  22.29 
 
 		 532 aa  70.1  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4273  C-3',4' desaturase CrtD  23.48 
 
 		 499 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.938391 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8148  FAD dependent oxidoreductase  22.26 
 
 		 557 aa  68.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4505  FAD dependent oxidoreductase  23.79 
 
 		 520 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0674  phytoene dehydrogenase  22.03 
 
 		 529 aa  69.3  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4592  FAD dependent oxidoreductase  23.79 
 
 		 520 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353805  normal  0.593862 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4868  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  22.14 
 
 		 517 aa  68.9  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1434  FAD dependent oxidoreductase  25.16 
 
 		 522 aa  68.6  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1331  FAD dependent oxidoreductase  45.12 
 
 		 531 aa  67.8  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2737  C-3',4' desaturase CrtD  22.36 
 
 		 499 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000928862  unclonable  0.00000000408673 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0345  phytoene dehydrogenase  21.3 
 
 		 509 aa  67.4  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0342  FAD dependent oxidoreductase  22.03 
 
 		 531 aa  67  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3374  C-3',4' desaturase CrtD  24.92 
 
 		 499 aa  66.6  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1732  hypothetical protein  48.57 
 
 		 520 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.589428 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0544  amine oxidase  25.29 
 
 		 525 aa  65.1  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00189501  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4519  FAD dependent oxidoreductase  23.28 
 
 		 506 aa  64.7  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1063  FAD dependent oxidoreductase  45.83 
 
 		 545 aa  64.7  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.164132  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03741  phytoene dehydrogenase  21.69 
 
 		 509 aa  63.9  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1954  FAD dependent oxidoreductase  24.56 
 
 		 560 aa  63.9  0.000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04210  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  28.95 
 
 		 527 aa  63.9  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.507647  normal  0.876413 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1960  FAD dependent oxidoreductase  22.3 
 
 		 523 aa  63.5  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4444  FAD dependent oxidoreductase  24.14 
 
 		 523 aa  63.5  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02162  phytoene dehydrogenase  21.97 
 
 		 537 aa  62.8  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0760  FAD dependent oxidoreductase  23.44 
 
 		 503 aa  62.8  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.522072 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05841  putative carotenoid isomerase  23.45 
 
 		 516 aa  61.6  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.515676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5197  phytoene desaturase  20.39 
 
 		 525 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2254  carotene isomerase  22.48 
 
 		 506 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000347702 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3726  phytoene dehydrogenase and related proteins-like  25.17 
 
 		 586 aa  60.8  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4343  amine oxidase  23.3 
 
 		 517 aa  60.5  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3573  phytoene desaturase  21.4 
 
 		 509 aa  59.7  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2330  carotene isomerase  23.18 
 
 		 508 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14681  putative carotenoid isomerase  23.81 
 
 		 520 aa  59.3  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal  0.880307 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>