More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7118 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7118  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 186 aa  367  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0105564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4649  transcriptional regulator, TetR family  66.13 
 
 		 186 aa  243  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.490512  normal  0.521268 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5016  transcriptional regulator, TetR family  48.94 
 
 		 191 aa  182  4.0000000000000006e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000793722  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3452  transcriptional regulator, TetR family  43.17 
 
 		 205 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0294937  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1740  transcriptional regulator, TetR family  41.76 
 
 		 188 aa  125  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.976934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5671  transcriptional regulator, TetR family  40.46 
 
 		 190 aa  119  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0275  TetR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 193 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.280469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2948  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 193 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000720602  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2114  transcriptional regulator, TetR family  38.12 
 
 		 193 aa  115  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4057  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 191 aa  114  5e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3185  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 192 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0735  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 212 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.177644  normal  0.315987 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4071  putative transcriptional regulator, TetR family  34.81 
 
 		 193 aa  108  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294777  normal  0.94431 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1467  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 192 aa  101  8e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.861342  normal  0.113855 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2750  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 194 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209675  normal  0.0475693 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5860  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 194 aa  100  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2720  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 194 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.532546  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2764  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 194 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5683  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 189 aa  99.4  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0274  transcriptional regulator, TetR family  36.14 
 
 		 193 aa  98.6  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0206  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 205 aa  98.2  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.611612 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3237  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 193 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0582489  normal  0.651915 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2924  regulatory protein TetR  35.67 
 
 		 204 aa  97.4  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10198  transcriptional regulator  33.51 
 
 		 194 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0581  putative transcriptional regulator  34.83 
 
 		 189 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06210  putative transcriptional regulator  32.43 
 
 		 189 aa  95.1  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0238159 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4133  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 193 aa  94  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5685  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 193 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3287  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 194 aa  92  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.482502 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4482  TetR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 197 aa  91.7  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14402  normal  0.0182705 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0685  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 192 aa  90.9  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0111634 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5306  TetR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 193 aa  89  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.635344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5395  TetR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 193 aa  89  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.488916  normal  0.171159 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2559  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 191 aa  85.9  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.927467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3009  TetR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 199 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.101347  normal  0.721246 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 194 aa  85.1  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0726  regulatory protein TetR  35.79 
 
 		 200 aa  83.6  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0973  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 215 aa  79  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.269206  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6284  regulatory protein, TetR  31.47 
 
 		 195 aa  78.2  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01911  putative transcription regulator protein  29.03 
 
 		 191 aa  77.8  0.00000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0303213 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1963  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 190 aa  77.8  0.00000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.264679 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4442  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 192 aa  77.8  0.00000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6178  transcriptional regulator, TetR family  31.02 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5870  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 209 aa  74.3  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 195 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6109  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 209 aa  72  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617571  normal  0.147608 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 201 aa  69.7  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 202 aa  70.1  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5089  transcriptional regulator, TetR family  28.73 
 
 		 198 aa  68.2  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0275  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9229  transcriptional regulator TetR family  25.7 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21864  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0479  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  25.77 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 198 aa  65.5  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2958  transcriptional regulator, TetR family  28.9 
 
 		 186 aa  64.3  0.0000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0440878  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 212 aa  64.3  0.0000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2047  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 188 aa  64.3  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.199455 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0798  transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  23.37 
 
 		 198 aa  64.3  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2392  TetR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0101662  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0216  TetR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 175 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1980  transcriptional regulator, TetR family  25.53 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3836  putative transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 179 aa  62.4  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0888  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  25.68 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4358  regulatory protein, TetR  28.96 
 
 		 220 aa  62  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6222  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.366462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5526  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 209 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5890  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 209 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.223104  normal  0.394498 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6399  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.147882 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  25.67 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  25.42 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1293  TetR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2843  transcriptional regulator, TetR family  36.08 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3295  transcriptional regulator, TetR family  32.6 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.457543 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5020  putative transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294081  normal  0.0543061 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4102  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  25.42 
 
 		 213 aa  57.8  0.00000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5341  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 204 aa  57  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.087744  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2194  transcriptional regulator, TetR family  29.78 
 
 		 203 aa  57  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.285199  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4533  transcriptional regulator, TetR family  26.49 
 
 		 198 aa  57  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0169871 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4778  transcriptional regulator, TetR family  26.74 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545614  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6699  transcriptional regulator, TetR family  31.85 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.678516  normal  0.427356 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2426  TetR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.257801 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0480  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7147  transcriptional regulator, TetR family  24.73 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  25.99 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3052  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.186092 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5796  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0048122 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0114  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 197 aa  54.3  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4264  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 181 aa  54.3  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2862  TetR family transcriptional regulator  22.51 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00162474  hitchhiker  0.00695972 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>