104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5469 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5469  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 241 aa  476  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200431 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3609  transcriptional regulator, TetR family  47.26 
 
 		 228 aa  152  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2982  TetR family transcriptional regulator  38.01 
 
 		 232 aa  142  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.435152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6613  TetR family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 254 aa  125  9e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0550  TetR family transcriptional regulator  36.12 
 
 		 283 aa  124  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8207  putative transcriptional regulator, TetR family  42.15 
 
 		 240 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3200  TetR family transcriptional regulator  37.05 
 
 		 232 aa  116  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0872  regulatory protein, TetR  36.41 
 
 		 230 aa  115  6e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.209107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0043  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 244 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.343495  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0380  transcriptional regulator, TetR family  39.25 
 
 		 216 aa  112  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.50033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37020  transcriptional regulator, TetR family  35.84 
 
 		 276 aa  112  6e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.016957 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1265  transcriptional regulator, TetR family  33.03 
 
 		 249 aa  112  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0071426 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0060  TetR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 247 aa  112  8.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 235 aa  108  7.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3766  transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 		 237 aa  107  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4636  transcriptional regulator, TetR family  38.83 
 
 		 227 aa  105  9e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100753  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2330  TetR family transcriptional regulator  37.34 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0758  transcriptional regulator, TetR family  34.2 
 
 		 229 aa  103  3e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.685577  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2316  transcriptional regulator, TetR family  35.02 
 
 		 234 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2082  transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 225 aa  100  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2319  putative transcriptional regulator, TetR family  32.84 
 
 		 236 aa  99.4  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0701  TetR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 261 aa  98.6  9e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.684816  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1166  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 278 aa  97.1  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0604682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3004  regulatory protein TetR  35.27 
 
 		 230 aa  97.4  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.587932  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1822  putative transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 224 aa  96.3  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10720  transcriptional regulator  31.28 
 
 		 242 aa  96.3  4e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.676593 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0655  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 254 aa  95.9  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2986  regulatory protein, TetR  32.59 
 
 		 241 aa  94.7  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4146  transcriptional regulator, TetR family  31.02 
 
 		 246 aa  93.2  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6490  transcriptional regulator, TetR family  34.08 
 
 		 243 aa  91.3  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0105405  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2596  transcriptional regulator, TetR family  34.47 
 
 		 221 aa  89.7  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.269859  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5555  putative transcriptional regulator, TetR family  29.09 
 
 		 260 aa  88.6  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0524  transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 230 aa  87  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.576052  hitchhiker  0.0000164085 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3167  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 236 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0319866  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22990  transcriptional regulator  37.22 
 
 		 223 aa  84.7  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0933864  normal  0.028216 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2845  transcriptional regulator, TetR family  31.22 
 
 		 260 aa  83.2  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3626  transcriptional regulator, TetR family  31.19 
 
 		 261 aa  83.2  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5129  transcriptional regulator, TetR family  34.17 
 
 		 255 aa  83.2  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287917  normal  0.539505 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11846  transcriptional regulator  33.15 
 
 		 234 aa  82.4  0.000000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.360584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3810  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 247 aa  82  0.000000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3414  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 226 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0624049  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1142  transcriptional regulator, TetR family  32.54 
 
 		 260 aa  81.6  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1731  hypothetical protein  33 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.45511  normal  0.806677 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2858  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 217 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2902  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 217 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05790  transcriptional regulator  39.17 
 
 		 215 aa  76.3  0.0000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415819 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16600  transcriptional regulator, tetR family  27.96 
 
 		 239 aa  75.5  0.0000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2394  transcriptional regulator, TetR family  30.14 
 
 		 235 aa  75.1  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0168964  decreased coverage  0.00129293 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3452  transcriptional regulator, TetR family  32.16 
 
 		 227 aa  73.9  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000897017  hitchhiker  0.00397123 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5775  hypothetical protein  30.95 
 
 		 227 aa  72.4  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2888  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 217 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11960  transcriptional regulator, tetR family  29.07 
 
 		 251 aa  69.3  0.00000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.184104  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4061  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 195 aa  68.6  0.00000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7073  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 248 aa  67.8  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.672487  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1913  putative transcriptional regulator  31.25 
 
 		 259 aa  64.7  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35360  transcriptional regulator  34.51 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2464  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.943089 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  27.13 
 
 		 222 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0095  TetR family transcriptional regulator  23.87 
 
 		 244 aa  53.1  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0424  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 200 aa  53.5  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6386  regulatory protein, TetR  34.58 
 
 		 510 aa  49.7  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0782  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 295 aa  48.5  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876045  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  26.24 
 
 		 203 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03670  transcriptional regulator  30.08 
 
 		 230 aa  47.8  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00912022  hitchhiker  0.0085588 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0325  TetR family transcriptional regulator  22.81 
 
 		 237 aa  46.6  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4328  transcriptional regulator, TetR family  36.08 
 
 		 477 aa  47  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0701267  normal  0.0216349 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0356  transcriptional regulator, TetR family  39.71 
 
 		 235 aa  46.6  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00145185  hitchhiker  0.0000223354 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4438  transcriptional regulator, TetR family  36.08 
 
 		 477 aa  47  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.829211  normal  0.875845 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2007  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 193 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3756  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 193 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4764  transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 181 aa  45.8  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 		 230 aa  46.2  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  23.83 
 
 		 203 aa  45.4  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 192 aa  44.7  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 219 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2147  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 193 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.576982  hitchhiker  0.00198138 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 201 aa  45.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1375  regulatory protein TetR  26.04 
 
 		 199 aa  45.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.852149 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0440  TetR/AcrR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 203 aa  44.3  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0992  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 197 aa  44.3  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2980  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 203 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7965  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 192 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10695  TetR family transcriptional regulator  24.51 
 
 		 218 aa  43.5  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5699  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 206 aa  43.5  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.393579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  24.17 
 
 		 203 aa  43.5  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21920  transcriptional regulator  46.34 
 
 		 191 aa  43.5  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.048177  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  25.95 
 
 		 196 aa  43.5  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  28.41 
 
 		 191 aa  43.5  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0983  TetR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 212 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1001  TetR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 212 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1011  TetR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 212 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.632644 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1953  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 213 aa  42.7  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.957288  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3824  TetR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 234 aa  42.7  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2194  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 193 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.789913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2974  TetR family transcriptional regulator  21.62 
 
 		 209 aa  42.4  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  31.4 
 
 		 216 aa  42  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1278  TetR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 191 aa  42.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190846  normal  0.885926 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  22.56 
 
 		 203 aa  42  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4573  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 197 aa  42  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>