More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2492 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  61.44 
 
 		 925 aa  923    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5562  cellulose-binding family II  60.76 
 
 		 906 aa  880    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  71.29 
 
 		 913 aa  1048    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1219  cellulose-binding family II  74.32 
 
 		 911 aa  1129    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0349548 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2492  endo-1,4-beta-glucanase/xyloglucanase, putative, gly74A  100 
 
 		 978 aa  1939    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0351052  normal  0.027518 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0618  cellulose-binding family II protein  63.46 
 
 		 1298 aa  1010    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0939482  hitchhiker  0.00792989 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1207  cellulosome protein dockerin type I  46.25 
 
 		 873 aa  689    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1398  cellulosome enzyme, dockerin type I  54.74 
 
 		 842 aa  800    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.461235  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6682  cellulose-binding family II  59.77 
 
 		 935 aa  924    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.224663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  56.94 
 
 		 934 aa  857    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1860  glycoside hydrolase family 48  53.75 
 
 		 1904 aa  818    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.738055  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2138  cellulose-binding family II protein  51.44 
 
 		 942 aa  884    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05061  xyloglucanase (Eurofung)  47.11 
 
 		 836 aa  601  1e-170  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.341133  hitchhiker  0.000000000000191913 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  36.72 
 
 		 1288 aa  420  1e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0626  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  36.01 
 
 		 707 aa  397  1e-109  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01542  oligo-xyloglucan specific cellobiohydrolase (Eurofung)  34.05 
 
 		 810 aa  370  1e-101  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4813  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.36 
 
 		 778 aa  254  8.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  63.86 
 
 		 847 aa  237  8e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  49.49 
 
 		 543 aa  174  7.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0934  putative secreted beta-mannosidase  49.1 
 
 		 523 aa  157  9e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0660492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  54.14 
 
 		 543 aa  154  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  45.54 
 
 		 681 aa  152  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  44.83 
 
 		 998 aa  150  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  46.97 
 
 		 429 aa  147  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  44.5 
 
 		 743 aa  143  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  43.35 
 
 		 880 aa  140  8.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  64.65 
 
 		 474 aa  139  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2684  glycoside hydrolase family protein  47.03 
 
 		 658 aa  137  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.954713  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  39.48 
 
 		 727 aa  132  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6407  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  62.38 
 
 		 448 aa  132  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0259803 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  42.21 
 
 		 608 aa  131  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3604  glycoside hydrolase family 48  48.99 
 
 		 973 aa  126  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  47.52 
 
 		 460 aa  126  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  37.95 
 
 		 438 aa  125  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  42.22 
 
 		 1121 aa  123  9.999999999999999e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1153  glycoside hydrolase family 48  44.78 
 
 		 900 aa  120  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.420841  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  38.94 
 
 		 1137 aa  118  3.9999999999999997e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  37.77 
 
 		 655 aa  118  6e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  54.46 
 
 		 456 aa  115  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0925  cellulose-binding family II  58.59 
 
 		 460 aa  115  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.146256  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  55.45 
 
 		 422 aa  113  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3216  glycoside hydrolase family 5  45.28 
 
 		 649 aa  111  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  35.18 
 
 		 637 aa  110  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4289  cellulose-binding family II  36.27 
 
 		 699 aa  107  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315108 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2048  cellulose-binding family II  37.24 
 
 		 679 aa  106  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2912  1, 4-beta cellobiohydrolase  52.08 
 
 		 491 aa  104  9e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.426935 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3037  chitin-binding domain-containing protein  52.53 
 
 		 360 aa  103  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.245182  normal  0.198398 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6973  cellulose-binding family II  38.05 
 
 		 1007 aa  103  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5719  hypothetical protein  57.84 
 
 		 353 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  39.7 
 
 		 938 aa  102  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  49.5 
 
 		 846 aa  102  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  50 
 
 		 854 aa  101  8e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  50 
 
 		 1128 aa  99.4  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0428  chitinase B  31.07 
 
 		 674 aa  98.6  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0371  chitinase B  31.07 
 
 		 674 aa  98.2  7e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  31.07 
 
 		 674 aa  98.2  7e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0385  chitinase B  31.07 
 
 		 674 aa  98.2  7e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0359  chitinase  30.58 
 
 		 674 aa  97.4  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4152  cellulose-binding family II  52.43 
 
 		 449 aa  97.4  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5296  hypothetical protein  34.4 
 
 		 385 aa  97.4  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4286  chitin-binding domain 3 protein  39.86 
 
 		 347 aa  97.1  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3263  chitin-binding domain-containing protein  52.53 
 
 		 358 aa  97.4  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.175629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3495  cellulose-binding family II  52.69 
 
 		 495 aa  96.7  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  29.61 
 
 		 674 aa  96.3  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  45.16 
 
 		 518 aa  97.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  46.46 
 
 		 773 aa  96.7  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  42.16 
 
 		 455 aa  96.3  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  50.53 
 
 		 688 aa  95.9  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  29.61 
 
 		 674 aa  95.5  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1493  cellulose-binding domain-containing protein  48.45 
 
 		 1055 aa  94.4  9e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.498527  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2913  1, 4-beta cellobiohydrolase  45.83 
 
 		 469 aa  94  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489381  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  31.55 
 
 		 674 aa  94  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  48.04 
 
 		 743 aa  94.4  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4174  serine/threonine protein kinase  47.52 
 
 		 493 aa  93.6  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0993859  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  42 
 
 		 609 aa  93.2  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1559  family 62 glycoside hydrolase  47.31 
 
 		 488 aa  92.8  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  30.41 
 
 		 674 aa  92.8  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1040  chitin-binding domain 3 protein  47.96 
 
 		 372 aa  92.8  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0290504 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4194  1, 4-beta cellobiohydrolase  47.57 
 
 		 437 aa  92.4  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2728  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  49.47 
 
 		 499 aa  92  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0684443  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  30.24 
 
 		 674 aa  92  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  44.9 
 
 		 486 aa  92  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0619  cellulose-binding family II protein  50.5 
 
 		 403 aa  91.7  7e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682246 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4682  cellulose-binding family II  48.96 
 
 		 593 aa  91.3  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2509  esterase, PHB depolymerase family  45.28 
 
 		 489 aa  91.3  8e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.821888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  50.5 
 
 		 763 aa  90.9  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  42.86 
 
 		 681 aa  89.7  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4157  cellulose-binding family II  40.3 
 
 		 719 aa  90.1  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.894149  normal  0.131999 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0324  cellulose-binding family II protein  54.65 
 
 		 694 aa  89.7  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  44.12 
 
 		 596 aa  88.6  6e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1074  endoglucanase  50 
 
 		 441 aa  88.2  6e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0857507  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  47.37 
 
 		 393 aa  88.2  6e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2372  cellulose-binding family II protein  44.21 
 
 		 842 aa  88.2  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  47.52 
 
 		 1209 aa  88.2  7e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  47.78 
 
 		 494 aa  87.8  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  51.19 
 
 		 459 aa  87.4  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  51.19 
 
 		 446 aa  87  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  42.16 
 
 		 984 aa  87  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2191  glycoside hydrolase family 6  47.83 
 
 		 605 aa  87  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  48.96 
 
 		 767 aa  86.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>