104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4454 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4454  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 177 aa  364  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2884  hypothetical protein  64.2 
 
 		 177 aa  224  4e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.181441  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3118  TPR repeat-containing protein  61.33 
 
 		 181 aa  224  5.0000000000000005e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.202741  normal  0.0573831 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0431  Tetratricopeptide domain protein  61.4 
 
 		 178 aa  217  8.999999999999998e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0399  TPR repeat-containing protein  60.23 
 
 		 178 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.704918  normal  0.472286 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2801  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.43 
 
 		 186 aa  97.8  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.318638  normal  0.053059 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3065  hypothetical protein  34.43 
 
 		 186 aa  97.1  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.0081027  normal  0.712309 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0360  tetratricopeptide TPR_2  40.21 
 
 		 160 aa  77.8  0.00000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1844  hypothetical protein  31.9 
 
 		 177 aa  72.8  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.35393 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3702  TPR repeat-containing protein  41.67 
 
 		 166 aa  68.9  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.604438 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3432  TPR repeat-containing protein  40.62 
 
 		 153 aa  67  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1010  tetratricopeptide TPR_2  27.74 
 
 		 181 aa  63.2  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3236  TPR repeat-containing protein  38.54 
 
 		 178 aa  62.8  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.076369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2074  TPR repeat-containing protein  34.38 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5172  hypothetical protein  32.67 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.163802  normal  0.262777 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2305  TPR repeat-containing protein  36.89 
 
 		 307 aa  57.8  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.192767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3526  tetratricopeptide TPR_2  32.71 
 
 		 281 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.476305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1919  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.28 
 
 		 286 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5686  TPR domain-containing protein  30.56 
 
 		 279 aa  51.6  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.471833  normal  0.415957 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3457  TPR repeat-containing protein  34.86 
 
 		 152 aa  51.6  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.88728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.5 
 
 		 286 aa  51.2  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.767116 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1964  TPR repeat-containing protein  31.5 
 
 		 286 aa  51.2  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.308952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1778  TPR repeat-containing protein  28.83 
 
 		 269 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.822909  normal  0.123613 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2197  TPR repeat-containing protein  30.91 
 
 		 178 aa  49.3  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0670804 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2379  hypothetical protein  31.78 
 
 		 283 aa  48.9  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.14303 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3581  tetratricopeptide TPR_4  25.6 
 
 		 272 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211804  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  36.78 
 
 		 560 aa  48.5  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  30.19 
 
 		 1737 aa  48.5  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1062  TPR repeat-containing protein  32.23 
 
 		 290 aa  47.8  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0295  TPR repeat-containing protein  25.98 
 
 		 290 aa  47.8  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3719  tetratricopeptide TPR_2  27.78 
 
 		 267 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.961452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4206  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.25 
 
 		 264 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.356132  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0385  tetratricopeptide TPR_2  28.7 
 
 		 269 aa  46.6  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  39.68 
 
 		 4079 aa  46.6  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  40.23 
 
 		 955 aa  46.2  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7038  hypothetical protein  28.97 
 
 		 309 aa  45.4  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.573891 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1362  TPR repeat-containing protein  35.37 
 
 		 376 aa  45.4  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  35.9 
 
 		 565 aa  45.1  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  28.66 
 
 		 301 aa  45.1  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  29.13 
 
 		 614 aa  45.1  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  29.13 
 
 		 626 aa  44.7  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  29.13 
 
 		 626 aa  44.7  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3235  tetratricopeptide TPR_2  34.88 
 
 		 734 aa  44.7  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  29.13 
 
 		 614 aa  44.7  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  29.13 
 
 		 614 aa  44.7  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  29.13 
 
 		 614 aa  44.7  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  29.13 
 
 		 614 aa  44.7  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3323  TPR repeat protein  30.3 
 
 		 578 aa  44.7  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.96902  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0912  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.16 
 
 		 452 aa  44.3  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.160059 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  32.48 
 
 		 927 aa  44.3  0.0009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4888  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.16 
 
 		 162 aa  44.3  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.93685  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  28.16 
 
 		 626 aa  43.9  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  23.26 
 
 		 3145 aa  43.9  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  37.31 
 
 		 742 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2286  TPR repeat-containing protein  29.08 
 
 		 291 aa  43.9  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.441531 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  39.73 
 
 		 1276 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 		 1406 aa  43.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0407  TPR repeat-containing protein  30.69 
 
 		 177 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644736  normal  0.04042 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2626  TPR repeat-containing protein  34.12 
 
 		 587 aa  43.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  30.49 
 
 		 615 aa  43.5  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2908  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 203 aa  43.5  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  29.13 
 
 		 3301 aa  42.4  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  28.72 
 
 		 762 aa  42.4  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  27.35 
 
 		 827 aa  42.7  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  37.14 
 
 		 878 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.65 
 
 		 810 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2553  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 547 aa  42  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.852958 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.95 
 
 		 632 aa  42  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2796  TPR repeat-containing protein  32.94 
 
 		 621 aa  42.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.669916 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.35 
 
 		 1022 aa  42.4  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.56 
 
 		 784 aa  42.4  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4380  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29 
 
 		 619 aa  42  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.842579  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3815  TPR repeat-containing protein  36.51 
 
 		 399 aa  42  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1009  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 269 aa  42  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000052453  hitchhiker  0.00393725 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3169  tetratricopeptide TPR_2  31.33 
 
 		 604 aa  42  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.120053  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04546  tetratricopeptide repeat family  31.71 
 
 		 551 aa  42  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0723  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.49 
 
 		 564 aa  42  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.686717  normal  0.618233 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1114  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.09 
 
 		 641 aa  41.6  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.71 
 
 		 818 aa  42  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2423  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.32 
 
 		 415 aa  42  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3744  tetratricopeptide TPR_2  30.65 
 
 		 572 aa  41.6  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  33.77 
 
 		 635 aa  41.6  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  33.77 
 
 		 635 aa  41.6  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  37.18 
 
 		 1069 aa  41.6  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  33.77 
 
 		 611 aa  41.6  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1983  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.87 
 
 		 142 aa  41.6  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  29.77 
 
 		 1138 aa  41.2  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  34.57 
 
 		 436 aa  41.6  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4074  TPR repeat-containing protein  29 
 
 		 622 aa  41.2  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2020  TPR repeat-containing protein  31.18 
 
 		 243 aa  41.2  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  40.62 
 
 		 3560 aa  41.2  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0564  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 202 aa  41.2  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.151741 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1157  TPR repeat-containing protein  29.67 
 
 		 522 aa  41.2  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.934871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3719  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 405 aa  41.2  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2034  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 		 416 aa  40.8  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  32.47 
 
 		 637 aa  40.8  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  30.38 
 
 		 243 aa  40.8  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  39.13 
 
 		 213 aa  40.8  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0485  tetratricopeptide TPR_2  30.68 
 
 		 566 aa  40.8  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0269  TPR repeat-containing protein  36.49 
 
 		 267 aa  40.8  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.583908 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>