133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1429 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1429  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 268 aa  537  9.999999999999999e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1549  hypothetical protein  43.54 
 
 		 285 aa  211  9e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.837882 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4617  hypothetical protein  43.53 
 
 		 287 aa  209  4e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0771  hypothetical protein  48.35 
 
 		 276 aa  209  5e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1704  spermidine synthase-like protein  44.05 
 
 		 287 aa  207  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.406029  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1494  hypothetical protein  41.7 
 
 		 285 aa  206  3e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0134759  hitchhiker  0.000194556 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2329  hypothetical protein  43.8 
 
 		 273 aa  198  7.999999999999999e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3599  hypothetical protein  42.52 
 
 		 289 aa  192  4e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.155801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1355  Spermidine synthase-like protein  42.69 
 
 		 332 aa  187  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2514  putative spermidine synthase  38.8 
 
 		 262 aa  168  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.246608  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1526  hypothetical protein  39.37 
 
 		 296 aa  165  6.9999999999999995e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7684  hypothetical protein  39.92 
 
 		 273 aa  163  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2683  Spermidine synthase-like protein  39.26 
 
 		 281 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2075  Spermidine synthase-like protein  38.93 
 
 		 287 aa  159  5e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000156685  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2245  hypothetical protein  37.34 
 
 		 262 aa  149  4e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000444033 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2968  Spermidine synthase-like protein  41.18 
 
 		 284 aa  148  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0185015  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2508  hypothetical protein  35.62 
 
 		 261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0190771  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2425  hypothetical protein  33.09 
 
 		 307 aa  144  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.503783  normal  0.136801 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0695  Spermidine synthase-like protein  36.49 
 
 		 271 aa  143  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0575  putative spermidine synthase  32.6 
 
 		 316 aa  138  8.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.143021 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4795  hypothetical protein  33.07 
 
 		 261 aa  138  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34113  normal  0.699098 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1581  Methyltransferase type 11  40.69 
 
 		 304 aa  137  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.564591 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22930  spermidine synthase  39.23 
 
 		 304 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0650317 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2255  hypothetical protein  38.42 
 
 		 492 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0362  putative spermidine synthase  33.46 
 
 		 310 aa  131  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4192  hypothetical protein  35.16 
 
 		 516 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.216811  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12080  spermidine synthase  41.32 
 
 		 272 aa  129  7.000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.712162  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1946  spermidine synthase-like protein  33.33 
 
 		 282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821047  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1268  Spermidine synthase-like protein  39.34 
 
 		 320 aa  126  3e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02530  hypothetical protein  38.12 
 
 		 270 aa  124  1e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3103  Spermidine synthase-like protein  37.8 
 
 		 280 aa  122  6e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0352418  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0371  hypothetical protein  33.46 
 
 		 517 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0442  hypothetical protein  32.92 
 
 		 517 aa  118  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22530  hypothetical protein  40.84 
 
 		 286 aa  115  5e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5405  hypothetical protein  36.46 
 
 		 514 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62211  normal  0.453689 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3006  hypothetical protein  33.16 
 
 		 500 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.328168  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3722  hypothetical protein  37.57 
 
 		 514 aa  113  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5605  hypothetical protein  36.46 
 
 		 514 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0664947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5354  hypothetical protein  35.94 
 
 		 514 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2801  hypothetical protein  36.99 
 
 		 514 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06000  hypothetical protein  36.79 
 
 		 266 aa  105  7e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10680  hypothetical protein  35.47 
 
 		 315 aa  103  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00411516  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01820  hypothetical protein  35.02 
 
 		 309 aa  102  6e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1061  hypothetical protein  28.74 
 
 		 301 aa  100  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3030  spermine synthase  30.93 
 
 		 322 aa  77  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  30.36 
 
 		 558 aa  76.3  0.0000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4320  spermine/spermidine synthase family protein  31.18 
 
 		 311 aa  73.9  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0899  Spermine synthase  32.19 
 
 		 248 aa  71.6  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1694  integral membrane protein-like  33.93 
 
 		 678 aa  67.4  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0225851  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3243  hypothetical protein  33.33 
 
 		 974 aa  67.4  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.870194  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0507  spermine synthase  29.93 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0453861  normal  0.458403 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5272  spermidine synthase-like protein  28.8 
 
 		 281 aa  63.2  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44275  predicted protein  28.14 
 
 		 824 aa  61.6  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0248  spermine synthase  24.52 
 
 		 308 aa  61.2  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.190806  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1332  spermine synthase  31.14 
 
 		 490 aa  61.2  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.020389 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2111  spermidine synthase  27.5 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1226  hypothetical protein  30.9 
 
 		 517 aa  60.1  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0114  transferase  26.24 
 
 		 276 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1622  spermine/spermidine synthase family protein  26.24 
 
 		 284 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1537  spermine/spermidine synthase family protein  26.7 
 
 		 269 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11208  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2138  hypothetical protein  29.19 
 
 		 533 aa  58.5  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0641622  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4588  spermidine synthase-like protein  30.66 
 
 		 283 aa  56.2  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.213578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2904  spermidine synthase-like protein  30.64 
 
 		 551 aa  56.2  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0533  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 475 aa  55.8  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0102  spermidine synthase  26.83 
 
 		 261 aa  55.5  0.0000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6553  spermidine synthase-like protein  28.36 
 
 		 278 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6267  spermidine synthase-like protein  28.36 
 
 		 278 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.526143 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1257  transferase  26.32 
 
 		 231 aa  54.7  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0334  putative spermidine synthase  29.95 
 
 		 257 aa  54.3  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.737223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3004  Spermine synthase  25.43 
 
 		 551 aa  54.7  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3177  spermidine synthase-like protein  28.9 
 
 		 548 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1235  spermidine synthase  25.39 
 
 		 267 aa  53.9  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.265162 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1722  spermidine synthase-like protein  24.86 
 
 		 289 aa  52.4  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2988  hypothetical protein  33.87 
 
 		 735 aa  52.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0801122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0180  putative acyl transferase  30.12 
 
 		 275 aa  52  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2736  hypothetical protein  32.35 
 
 		 752 aa  52.4  0.000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1223  hypothetical protein  25.85 
 
 		 310 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0459  integral membrane protein-like protein  31.4 
 
 		 681 aa  50.8  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0912  spermidine synthase-like  28.77 
 
 		 259 aa  50.4  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3323  hypothetical protein  25.37 
 
 		 310 aa  49.7  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.810152  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1819  putative transferase  24.6 
 
 		 235 aa  49.3  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2160  hypothetical protein  24.6 
 
 		 235 aa  49.3  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0842  Spermine synthase  28.57 
 
 		 541 aa  48.9  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0913  spermidine synthase-like  27.78 
 
 		 253 aa  48.1  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4663  putative spermidine synthase  28.3 
 
 		 271 aa  48.5  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.616274 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7524  putative spermidine synthase (methyl transferase)  27.27 
 
 		 307 aa  48.9  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2313  hypothetical protein  28.67 
 
 		 249 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0169  spermidine synthase-like protein  31.94 
 
 		 284 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.387989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27350  hypothetical protein  26.67 
 
 		 249 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0936  Spermine synthase  25.58 
 
 		 516 aa  47.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06540  spermidine synthase  27.27 
 
 		 248 aa  48.1  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1508  integral membrane protein-like  28.97 
 
 		 674 aa  47.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0141137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1274  spermidine synthase-like protein  29.25 
 
 		 278 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6557  spermidine synthase-like protein  29.25 
 
 		 278 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1561  Spermine synthase  29.3 
 
 		 502 aa  47  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.298841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2384  spermidine synthase-like protein  27.88 
 
 		 262 aa  47  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2633  spermidine synthase-like  24.32 
 
 		 255 aa  46.6  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0667731  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5699  putative spermidine synthase protein  26.47 
 
 		 278 aa  46.6  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6163  spermidine synthase-like protein  29.25 
 
 		 239 aa  46.6  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.523417  normal  0.0514114 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1190  Spermidine synthase-like protein  23.72 
 
 		 276 aa  46.6  0.0005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0142358  normal  0.0659665 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>