More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0449 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0449  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 405 aa  809    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.441282 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.04 
 
 		 401 aa  194  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.871786  normal  0.459695 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  32.12 
 
 		 620 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.67 
 
 		 810 aa  76.3  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  31.61 
 
 		 620 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  26.54 
 
 		 397 aa  75.5  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  31.61 
 
 		 626 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  30.41 
 
 		 626 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  30.41 
 
 		 626 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  32.47 
 
 		 639 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  31.44 
 
 		 614 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  31.44 
 
 		 614 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  27.4 
 
 		 543 aa  73.2  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  31.44 
 
 		 614 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  31.44 
 
 		 614 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4611  TPR domain-containing protein  34.86 
 
 		 615 aa  72.8  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.02 
 
 		 878 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  27.64 
 
 		 573 aa  70.1  0.00000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2461  hypothetical protein  25.13 
 
 		 398 aa  70.1  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125521  normal  0.0258605 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  32.12 
 
 		 615 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  30.91 
 
 		 636 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  30.93 
 
 		 637 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  31.44 
 
 		 611 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  24.48 
 
 		 927 aa  68.6  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  30.05 
 
 		 4489 aa  68.9  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  30.93 
 
 		 635 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  30.93 
 
 		 635 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  31.44 
 
 		 612 aa  67  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  28.28 
 
 		 1276 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  26.63 
 
 		 4079 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  26.79 
 
 		 366 aa  65.1  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  27.98 
 
 		 344 aa  64.3  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  31.96 
 
 		 614 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2338  sulfotransferase  29.95 
 
 		 762 aa  61.6  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355943  normal  0.127881 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2716  TPR domain/sulfotransferase domain protein  29.95 
 
 		 762 aa  61.6  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  28.48 
 
 		 653 aa  62  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.77 
 
 		 632 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  30.41 
 
 		 795 aa  62  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  28.48 
 
 		 653 aa  62  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  36.13 
 
 		 713 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  29.61 
 
 		 213 aa  61.6  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0485  tetratricopeptide TPR_2  36.36 
 
 		 566 aa  61.6  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 		 465 aa  60.8  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  24.19 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  28.8 
 
 		 740 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  27.76 
 
 		 542 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0116  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 289 aa  58.9  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.75872 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  26.99 
 
 		 1737 aa  59.3  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  23.32 
 
 		 711 aa  59.7  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  26.44 
 
 		 1694 aa  59.3  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  23.59 
 
 		 1138 aa  58.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  26.9 
 
 		 3560 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  27.43 
 
 		 1069 aa  58.5  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  24.17 
 
 		 3035 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  30.39 
 
 		 718 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0089  TPR repeat-containing protein  26.55 
 
 		 388 aa  58.9  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.159552  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4723  TPR repeat-containing protein  24.88 
 
 		 289 aa  58.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.939176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  26.99 
 
 		 716 aa  57.8  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0287  TPR repeat-containing protein  26.04 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37702  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  25.14 
 
 		 560 aa  57.8  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0723  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.71 
 
 		 564 aa  57.8  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.686717  normal  0.618233 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  24.74 
 
 		 1094 aa  57  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  23.93 
 
 		 409 aa  57  0.0000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.03 
 
 		 565 aa  56.6  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3169  tetratricopeptide TPR_2  31.54 
 
 		 604 aa  56.6  0.0000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.120053  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  25.91 
 
 		 573 aa  56.2  0.0000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0564  TPR repeat-containing protein  26.95 
 
 		 202 aa  55.8  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.151741 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0586  hypothetical protein  25 
 
 		 573 aa  55.8  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3197  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  27.85 
 
 		 395 aa  55.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187148  normal  0.017581 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  29.38 
 
 		 505 aa  55.1  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  28.32 
 
 		 512 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 602 aa  55.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  23.18 
 
 		 1827 aa  55.1  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  25 
 
 		 648 aa  55.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  24.16 
 
 		 589 aa  54.7  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  25.73 
 
 		 436 aa  54.7  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  25 
 
 		 1056 aa  54.7  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  27.27 
 
 		 745 aa  54.7  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3116  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.81 
 
 		 878 aa  54.7  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  28.89 
 
 		 623 aa  54.7  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  26.02 
 
 		 1979 aa  54.3  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  26.15 
 
 		 574 aa  53.9  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1823  TPR repeat-containing protein  33.08 
 
 		 213 aa  54.3  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  20.52 
 
 		 676 aa  53.9  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  20.59 
 
 		 1486 aa  53.9  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1345  TPR repeat-containing protein  26.52 
 
 		 332 aa  53.5  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  29.57 
 
 		 243 aa  53.1  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1358  TPR repeat-containing protein  27.23 
 
 		 343 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.76 
 
 		 1022 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0484  TPR repeat-containing protein  27.55 
 
 		 435 aa  53.1  0.000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1340  TPR repeat-containing protein  27.23 
 
 		 343 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5618  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  34.88 
 
 		 739 aa  53.1  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.645263 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  30.63 
 
 		 417 aa  52.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0424  TPR repeat-containing protein  33.04 
 
 		 642 aa  52.8  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.64 
 
 		 784 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2810  TPR repeat-containing protein  31.67 
 
 		 607 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2859  TPR repeat-containing protein  31.67 
 
 		 607 aa  52.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.504005  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2799  TPR repeat-containing protein  31.67 
 
 		 607 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414914  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2185  tetratricopeptide TPR_2  31.67 
 
 		 607 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  24.34 
 
 		 591 aa  52.4  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000157665  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>