More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1340 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008705  Mkms_1358  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 343 aa  670    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1340  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 343 aa  670    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1376  TPR repeat-containing protein  94.75 
 
 		 343 aa  617  1e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.38327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  28.35 
 
 		 878 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.35 
 
 		 810 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  29.45 
 
 		 560 aa  68.6  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3719  TPR repeat-containing protein  26.77 
 
 		 405 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3815  TPR repeat-containing protein  28.16 
 
 		 399 aa  63.9  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  23.12 
 
 		 706 aa  61.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1309  TPR repeat-containing protein  22.91 
 
 		 515 aa  60.8  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 649 aa  60.8  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.98 
 
 		 1056 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  24.74 
 
 		 1827 aa  60.5  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  27.81 
 
 		 3035 aa  60.8  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3547  TPR repeat-containing protein  30.24 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.631542  normal  0.0297483 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  37.65 
 
 		 577 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2075  TPR repeat-containing protein  27.1 
 
 		 292 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  24.05 
 
 		 820 aa  59.7  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  27.65 
 
 		 543 aa  59.7  0.00000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  30.86 
 
 		 653 aa  59.3  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  30.86 
 
 		 653 aa  59.3  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.21 
 
 		 1022 aa  59.3  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.91 
 
 		 836 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1062  TPR repeat-containing protein  28.39 
 
 		 290 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  28.81 
 
 		 4489 aa  58.9  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 732 aa  58.9  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  26.76 
 
 		 1276 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  25.7 
 
 		 1737 aa  58.5  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 602 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 		 3560 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.14 
 
 		 632 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.9 
 
 		 589 aa  57  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.14 
 
 		 401 aa  57.4  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.871786  normal  0.459695 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 		 301 aa  57  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3197  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  28.95 
 
 		 395 aa  56.6  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187148  normal  0.017581 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1350  TPR repeat-containing protein  31.09 
 
 		 766 aa  56.6  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.27 
 
 		 542 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  29.9 
 
 		 505 aa  56.6  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3314  tetratricopeptide TPR_2  31.36 
 
 		 1240 aa  56.6  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689174  normal  0.286856 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  28.97 
 
 		 1979 aa  56.6  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3363  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.83 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.040769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2754  TPR repeat-containing protein  27.15 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  26.6 
 
 		 808 aa  56.2  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  25.27 
 
 		 1421 aa  56.2  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  22.93 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1211  TPR domain/sulfotransferase domain protein  30.16 
 
 		 695 aa  56.2  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.6 
 
 		 988 aa  56.2  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  28.88 
 
 		 795 aa  55.8  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  36.42 
 
 		 574 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  30.22 
 
 		 465 aa  55.5  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  27.06 
 
 		 713 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3576  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.73 
 
 		 261 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2530  TPR repeat-containing protein  24.73 
 
 		 260 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2994  TPR repeat-containing protein  24.49 
 
 		 317 aa  55.5  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3395  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37 
 
 		 652 aa  55.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105857  normal  0.534979 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3665  TPR repeat-containing protein  25.99 
 
 		 289 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00516372  normal  0.53352 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  31.92 
 
 		 4079 aa  55.8  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  28.65 
 
 		 1694 aa  55.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.79 
 
 		 1056 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2695  TPR repeat-containing protein  26.17 
 
 		 292 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.640048 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28 
 
 		 784 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0449  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.65 
 
 		 405 aa  54.7  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.441282 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  26.45 
 
 		 391 aa  55.1  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  28.5 
 
 		 662 aa  55.1  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.9 
 
 		 818 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1753  TPR repeat-containing protein  27.61 
 
 		 366 aa  54.7  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  30.26 
 
 		 636 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  29.03 
 
 		 213 aa  54.3  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1458  TPR repeat-containing protein  33.08 
 
 		 410 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  24.36 
 
 		 539 aa  53.9  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1209  hypothetical protein  32.43 
 
 		 1079 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.494717  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1991  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.57 
 
 		 367 aa  53.5  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310287  normal  0.0147414 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1919  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.98 
 
 		 286 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  29.33 
 
 		 1094 aa  53.5  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1178  TPR repeat-containing protein  26.8 
 
 		 280 aa  53.1  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0887  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.46 
 
 		 504 aa  53.1  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.389457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  27.56 
 
 		 761 aa  53.5  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  26.25 
 
 		 361 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2661  Spermine synthase  35.29 
 
 		 1078 aa  53.1  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.530948  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1392  TPR repeat-containing protein  23.65 
 
 		 301 aa  53.1  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  23.64 
 
 		 927 aa  52.8  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 732 aa  53.1  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.74 
 
 		 707 aa  52.8  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  31.68 
 
 		 592 aa  52.8  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0613  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.87 
 
 		 274 aa  52  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.326726  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  28.26 
 
 		 366 aa  52.4  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2023  TPR domain-containing protein  20.96 
 
 		 369 aa  52.8  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000313787  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  23.04 
 
 		 706 aa  52.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  24.86 
 
 		 681 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.17 
 
 		 373 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  22.8 
 
 		 725 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  27.21 
 
 		 762 aa  52  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 392 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 		 935 aa  51.6  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  30.89 
 
 		 639 aa  51.6  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  33.68 
 
 		 292 aa  51.6  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1964  TPR repeat-containing protein  27.44 
 
 		 286 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.308952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  30.65 
 
 		 740 aa  51.6  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2953  TPR repeat-containing protein  28.45 
 
 		 270 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.162734 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  31.54 
 
 		 767 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>