293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_1376 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_1376  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
343 aa  676    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.38327  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1358  TPR repeat-containing protein  94.75 
 
 
343 aa  618  1e-176  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1340  TPR repeat-containing protein  94.75 
 
 
343 aa  618  1e-176  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.35 
 
 
810 aa  70.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3719  TPR repeat-containing protein  25.17 
 
 
405 aa  65.1  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  29.5 
 
 
602 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  22.73 
 
 
878 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3815  TPR repeat-containing protein  26.85 
 
 
399 aa  62  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  28.24 
 
 
713 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  35.44 
 
 
577 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  30.86 
 
 
653 aa  59.7  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  30.86 
 
 
653 aa  59.7  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.14 
 
 
401 aa  59.3  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.871786  normal  0.459695 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  28.66 
 
 
560 aa  59.3  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  24.05 
 
 
1827 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0449  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 
405 aa  57.8  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.441282 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.57 
 
 
632 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 
636 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 
543 aa  57.4  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2695  TPR repeat-containing protein  28.24 
 
 
292 aa  56.2  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.640048 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2994  TPR repeat-containing protein  24.49 
 
 
317 aa  56.2  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.13 
 
 
836 aa  56.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  34.81 
 
 
574 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2075  TPR repeat-containing protein  27.1 
 
 
292 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 
3560 aa  55.8  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  22.22 
 
 
706 aa  55.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  26.1 
 
 
739 aa  55.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1062  TPR repeat-containing protein  28.26 
 
 
290 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  27.82 
 
 
732 aa  54.7  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3547  TPR repeat-containing protein  27.83 
 
 
306 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.631542  normal  0.0297483 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  29.22 
 
 
213 aa  54.7  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3395  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36 
 
 
652 aa  55.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105857  normal  0.534979 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1309  TPR repeat-containing protein  22.35 
 
 
515 aa  54.7  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153473  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  30.22 
 
 
465 aa  54.7  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  25.35 
 
 
820 aa  55.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  28.33 
 
 
649 aa  54.7  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3314  tetratricopeptide TPR_2  30.51 
 
 
1240 aa  55.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689174  normal  0.286856 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  25.73 
 
 
795 aa  54.3  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.27 
 
 
1022 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 
505 aa  53.9  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 
4489 aa  53.9  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.23 
 
 
589 aa  53.9  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2754  TPR repeat-containing protein  26.59 
 
 
295 aa  53.5  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  25.74 
 
 
1276 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  25.23 
 
 
1737 aa  53.1  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.07 
 
 
1056 aa  53.1  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.86 
 
 
738 aa  53.1  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  31.98 
 
 
4079 aa  53.1  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 
301 aa  52.8  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3197  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  28.57 
 
 
395 aa  52.8  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187148  normal  0.017581 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.28 
 
 
542 aa  52.8  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1753  TPR repeat-containing protein  27.01 
 
 
366 aa  52.4  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  26.06 
 
 
392 aa  52  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3363  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.53 
 
 
289 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.040769  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  26.13 
 
 
3035 aa  52.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1350  TPR repeat-containing protein  29.8 
 
 
766 aa  52.4  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  27.17 
 
 
808 aa  52  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2697  TPR repeat-containing protein  32.04 
 
 
268 aa  52.4  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000108911  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1392  TPR repeat-containing protein  23.65 
 
 
301 aa  52.4  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  24.18 
 
 
1421 aa  52.4  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.34 
 
 
1056 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2023  TPR domain-containing protein  20.96 
 
 
369 aa  52  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000313787  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  20.42 
 
 
927 aa  51.6  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0196  TPR repeat-containing protein  40.4 
 
 
927 aa  51.2  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.935444 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  30.13 
 
 
732 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1991  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.57 
 
 
367 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310287  normal  0.0147414 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1211  TPR domain/sulfotransferase domain protein  29.1 
 
 
695 aa  51.6  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  27.7 
 
 
366 aa  51.2  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 
767 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.44 
 
 
818 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  32.04 
 
 
639 aa  52  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.44 
 
 
784 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  29.94 
 
 
662 aa  51.2  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  28.28 
 
 
1979 aa  50.8  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  30.41 
 
 
740 aa  50.8  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1209  hypothetical protein  36 
 
 
1079 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.494717  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  23.47 
 
 
681 aa  50.4  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3665  TPR repeat-containing protein  25.53 
 
 
289 aa  50.4  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00516372  normal  0.53352 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2953  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 
270 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.162734 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2838  tetratricopeptide TPR_2  23.08 
 
 
940 aa  50.4  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0626  tetratricopeptide TPR_2  23.08 
 
 
2059 aa  50.8  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00762464 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  24 
 
 
279 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0613  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.17 
 
 
274 aa  50.1  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.326726  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2379  hypothetical protein  25.9 
 
 
283 aa  50.4  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.14303 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 
592 aa  50.1  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  23.87 
 
 
745 aa  50.1  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  32.69 
 
 
292 aa  50.1  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  26.19 
 
 
280 aa  50.1  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2661  Spermine synthase  34.56 
 
 
1078 aa  50.1  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.530948  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  24.66 
 
 
306 aa  50.1  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4689  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
341 aa  50.1  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.597209  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  26.83 
 
 
562 aa  50.1  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  25.48 
 
 
661 aa  49.7  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3831  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.3 
 
 
643 aa  49.7  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  30.88 
 
 
1694 aa  49.7  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2825  Methyltransferase type 12  25.51 
 
 
436 aa  49.3  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0887  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.03 
 
 
504 aa  49.3  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.389457  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2410  TPR repeat-containing protein  28.71 
 
 
648 aa  49.3  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  22 
 
 
707 aa  48.9  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  25.3 
 
 
371 aa  48.9  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>