91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0246 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0246  Type II secretory pathway component PulD-like protein  100 
 
 		 312 aa  592  1e-168  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0238  type II and III secretion system protein  39.58 
 
 		 368 aa  159  6e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0609  general secretion pathway protein D  23.67 
 
 		 635 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.73081e-17 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0683  general secretion pathway protein D  23.73 
 
 		 641 aa  65.9  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00528314  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3364  type II and III secretion system protein:NolW-like  23.21 
 
 		 636 aa  64.7  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000168391  normal  0.0105147 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0595  general secretion pathway protein D  23.32 
 
 		 630 aa  60.1  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.788546  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2134  type IV pilus biogenesis protein PilQ  24.12 
 
 		 874 aa  59.7  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000140204  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2370  general secretion pathway protein D  22.14 
 
 		 670 aa  58.9  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003452  putative maturation protein  20 
 
 		 353 aa  57.8  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.171199  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2591  general secretion pathway protein D  20.73 
 
 		 682 aa  58.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3529  general secretion pathway protein D  25.44 
 
 		 740 aa  57.4  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22216  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0329  general secretion pathway protein D, putative  27.38 
 
 		 632 aa  57.4  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.989309  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0097  general secretion pathway protein D  22.11 
 
 		 662 aa  56.6  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.395857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0329  type IV pilus secretin PilQ  21.85 
 
 		 987 aa  55.5  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00519282  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0252  type IV pilus secretin PilQ  25.88 
 
 		 1269 aa  54.7  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.760209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0756  general secretion pathway protein D  21.28 
 
 		 738 aa  54.7  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2211  general secretion pathway protein D  29.27 
 
 		 793 aa  54.3  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.971398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0953  general secretion pathway protein D  24.35 
 
 		 640 aa  53.9  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.198389  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1004  general secretion pathway protein D  24.35 
 
 		 640 aa  54.3  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3269  general secretion pathway protein D  24.35 
 
 		 640 aa  53.9  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000207036  hitchhiker  0.00000000000000178028 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0225  general secretion pathway protein D  23.48 
 
 		 655 aa  53.5  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1281  general secretion pathway protein D  30.83 
 
 		 648 aa  52.8  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7395  general secretion pathway protein D  26.51 
 
 		 717 aa  52.8  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103776  normal  0.699876 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2027  general secretion pathway protein D  22.22 
 
 		 649 aa  52.8  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0542  type II and III secretion system protein  20.94 
 
 		 702 aa  52.4  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1329  type II and III secretion system protein  24.76 
 
 		 747 aa  51.6  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0003  general secretion pathway protein D  24.91 
 
 		 655 aa  52  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0438473 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0054  type III secretion outer membrane pore YscC  21.33 
 
 		 612 aa  50.8  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1954  type II and III secretion system protein  24.72 
 
 		 750 aa  50.4  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0109975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2771  general secretion pathway protein D  26.32 
 
 		 686 aa  49.7  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.662007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1785  type IV pilus secretin PilQ  21.48 
 
 		 636 aa  49.7  0.00007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0622717  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3175  type II and III secretion system protein  24.24 
 
 		 783 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.114854  normal  0.0336738 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12660  type II and III secretion system protein  25.79 
 
 		 385 aa  48.9  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1856  fimbrial assembly protein  22.46 
 
 		 630 aa  48.9  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0231369  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18620  type II and III secretion system protein  22.73 
 
 		 602 aa  48.5  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4825  putative type II secretion system protein  24.69 
 
 		 803 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0565778  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55450  putative type II secretion system protein  24.69 
 
 		 803 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000555876  normal  0.092125 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0917  general secretion pathway protein D  19.38 
 
 		 810 aa  48.1  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.460737  normal  0.382842 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1406  type II and III secretion system protein  21.53 
 
 		 538 aa  47.4  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.7882  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2199  type IV pilus secretin PilQ  22.14 
 
 		 719 aa  47.4  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0667  general secretion pathway protein D  21.28 
 
 		 781 aa  47.4  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.509623 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3587  outer membrane porin HofQ  22.18 
 
 		 412 aa  47  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000785668  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0646  general secretion pathway protein D  23.93 
 
 		 781 aa  47  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0255398  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0322  outer membrane porin HofQ  22.18 
 
 		 386 aa  47  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000700239  normal  0.175294 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0250  type II and III secretion system protein  23.97 
 
 		 703 aa  47  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.980463  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0874  Hrp conserved HRCC transmembrane protein  22.63 
 
 		 568 aa  46.6  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.23962  normal  0.0136899 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1544  type III secretion system protein BsaO  23.08 
 
 		 606 aa  46.6  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.643588  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2087  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  23.08 
 
 		 625 aa  46.6  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2060  type III secretion system protein BsaO  23.08 
 
 		 625 aa  46.6  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.462668  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0740  type III secretion system protein BsaO  23.08 
 
 		 625 aa  46.6  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.513099  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02351  fimbrial assembly protein  23.23 
 
 		 655 aa  46.6  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.733093  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0828  type III secretion system protein BsaO  22.69 
 
 		 619 aa  46.2  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0276407  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4695  outer membrane porin HofQ  22.18 
 
 		 412 aa  46.2  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00163721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2175  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  23.08 
 
 		 617 aa  46.2  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0322  type IV pilus secretin PilQ  22.18 
 
 		 412 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000212409  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03195  hypothetical protein  22.18 
 
 		 412 aa  45.8  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0104711  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03243  predicted fimbrial transporter  22.18 
 
 		 412 aa  45.8  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00734996  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0586  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  23.08 
 
 		 339 aa  45.8  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000694626  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3861  outer membrane porin HofQ  22.18 
 
 		 412 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000844499  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3070  general secretion pathway protein D  23.59 
 
 		 787 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00279328 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3667  outer membrane porin HofQ  22.18 
 
 		 412 aa  45.4  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000045876  normal  0.0733814 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3599  type IV pilus secretin PilQ  20.33 
 
 		 591 aa  45.4  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00505018  hitchhiker  0.0000000614182 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2096  type II and III secretion system family protein  22.18 
 
 		 349 aa  45.8  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0319  type II and III secretion system protein  26.44 
 
 		 818 aa  44.7  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001892  general secretion pathway protein D/type II secretion outermembrane pore forming protein (PulD)  27.22 
 
 		 672 aa  44.3  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3131  type II and III secretion system secretin  19.93 
 
 		 706 aa  44.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00601  general secretion pathway protein D  27.22 
 
 		 658 aa  44.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5697  general secretion pathway protein D  24.14 
 
 		 787 aa  44.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0549216 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3399  general secretion pathway protein D  25.51 
 
 		 807 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1644  type IV pilus secretin PilQ  22.27 
 
 		 891 aa  44.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3768  outer membrane porin HofQ  21.6 
 
 		 412 aa  44.3  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000640301  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0063  general secretion pathway protein D  22.94 
 
 		 775 aa  44.3  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0090  type II and III secretion system protein  22.15 
 
 		 353 aa  43.9  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.131629  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2401  general secretion pathway protein D  21.18 
 
 		 673 aa  44.3  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.539176  hitchhiker  0.000473161 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1698  type II/III secretion system protein  20.3 
 
 		 406 aa  43.5  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2173  general secretion pathway protein D  19.05 
 
 		 745 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0141  general secretion pathway protein D  26.55 
 
 		 725 aa  43.9  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3236  type II and III secretion system protein  23.83 
 
 		 711 aa  43.9  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.284362  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1265  type II and III secretion system protein  25.85 
 
 		 1519 aa  43.9  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00244048  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2529  general secretion pathway protein D  23.41 
 
 		 728 aa  43.9  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.151487  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1343  Type II secretory pathway component PulD-like  21.74 
 
 		 546 aa  43.5  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.255385  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3114  general secretory pathway D transmembrane protein  24.31 
 
 		 805 aa  43.1  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.442209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0909  general secretion pathway protein D  22.27 
 
 		 805 aa  43.1  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.793401 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06090  type II and III secretion system protein  21.4 
 
 		 881 aa  42.7  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3315  general secretion pathway protein D  25.38 
 
 		 696 aa  42.7  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2860  general secretion pathway protein D  21.39 
 
 		 640 aa  42.7  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1994  type II and III secretion system protein  18.82 
 
 		 499 aa  42.7  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1087  general secretion pathway protein D  20.6 
 
 		 584 aa  42.7  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.57571  normal  0.616621 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3052  general secretion pathway protein D  24.27 
 
 		 803 aa  42.7  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1123  general secretion pathway protein D  22.12 
 
 		 751 aa  42.4  0.01  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0556  general secretion pathway protein D  20.77 
 
 		 733 aa  42.4  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.234016  normal  0.128846 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>