268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1784 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2156  alpha amylase family protein  61.4 
 
 		 673 aa  808    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2303  alpha amylase catalytic region  60.6 
 
 		 761 aa  817    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.283065  normal  0.0722079 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1900  alpha amylase catalytic region  58.15 
 
 		 581 aa  689    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0705121  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2206  alpha amylase catalytic region  63.12 
 
 		 668 aa  779    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.370981  hitchhiker  0.00000519248 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0556  alpha amylase domain-containing protein  58.15 
 
 		 624 aa  756    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.120773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2032  alpha amylase, catalytic region  67.1 
 
 		 653 aa  835    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.324011  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01887  putative glycosidase  60.64 
 
 		 630 aa  755    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2340  alpha amylase, catalytic region  62.84 
 
 		 650 aa  801    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2035  alpha amylase catalytic region  61.17 
 
 		 736 aa  822    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2136  alpha amylase, catalytic region  63.2 
 
 		 704 aa  833    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2212  alpha amylase, catalytic region  64.07 
 
 		 709 aa  822    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.636451 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1784  alpha amylase, catalytic region  100 
 
 		 676 aa  1402    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.519611  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2314  alpha amylase, catalytic region  61.86 
 
 		 709 aa  818    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.169067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2082  alpha amylase catalytic region  59.89 
 
 		 766 aa  821    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.241843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2290  alpha amylase catalytic region  63.36 
 
 		 715 aa  823    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1886  alpha amylase, catalytic region  63.43 
 
 		 667 aa  842    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2593  alpha amylase, catalytic region  57.51 
 
 		 610 aa  755    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.143238  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1659  glycosidase  49.23 
 
 		 626 aa  547  1e-154  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2758  alpha amylase catalytic region  45.51 
 
 		 579 aa  503  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.435679  normal  0.479819 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2884  alpha amylase catalytic region  45.06 
 
 		 565 aa  491  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0897  alpha-amylase family protein  40.6 
 
 		 534 aa  388  1e-106  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1637  alpha amylase catalytic region  32.34 
 
 		 574 aa  229  1e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1813  alpha amylase catalytic region  23.67 
 
 		 459 aa  88.2  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2541  alpha amylase catalytic region  24.18 
 
 		 467 aa  80.5  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0134925 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  24.7 
 
 		 1975 aa  74.3  0.000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  22.65 
 
 		 499 aa  73.2  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0869  alpha amylase catalytic region  26.36 
 
 		 459 aa  71.2  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05105  alpha-amylase, putative  34 
 
 		 478 aa  68.6  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.289074  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23200  alpha amylase  24.89 
 
 		 654 aa  68.2  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000149088  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2652  alpha amylase catalytic region  22.44 
 
 		 682 aa  68.2  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3333  alpha amylase, catalytic region  29.57 
 
 		 434 aa  67.4  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.320284  normal  0.0371883 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1856  Alpha amylase, catalytic region  23.27 
 
 		 586 aa  65.1  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2916  Alpha-amylase  24.5 
 
 		 472 aa  65.1  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1944  alpha amylase catalytic region  22.2 
 
 		 486 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2017  Alpha amylase, catalytic region  24.74 
 
 		 488 aa  62  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00107336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4079  alpha amylase  23.19 
 
 		 513 aa  62.4  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.348017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  24.11 
 
 		 1942 aa  62  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0544  alpha amylase catalytic region  25.87 
 
 		 758 aa  61.6  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3419  hypothetical protein  23.53 
 
 		 481 aa  60.8  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4246  alpha amylase catalytic region  26.13 
 
 		 593 aa  60.8  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3059  alpha amylase, catalytic region  27.96 
 
 		 434 aa  60.8  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50616 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4336  alpha amylase catalytic region  22.33 
 
 		 914 aa  60.8  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01125  alpha-amylase, putative  33.57 
 
 		 434 aa  60.8  0.00000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  25.85 
 
 		 2068 aa  60.5  0.00000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4343  alpha amylase catalytic region  23.84 
 
 		 481 aa  60.8  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0867  alpha amylase catalytic region  23.16 
 
 		 558 aa  60.1  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21691  glycoside hydrolase family protein  47.92 
 
 		 483 aa  60.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0470032 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2425  alpha amylase catalytic region  21.42 
 
 		 509 aa  59.3  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1971  alpha amylase catalytic region  22.01 
 
 		 486 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.0160527 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4280  alpha amylase catalytic region  22.4 
 
 		 541 aa  59.7  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1713  alpha amylase catalytic region  28.17 
 
 		 426 aa  59.3  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0746329  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4258  alpha amylase catalytic region  22.27 
 
 		 541 aa  59.7  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256991  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1431  alpha amylase catalytic region  28.39 
 
 		 663 aa  59.7  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.246388  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2771  alpha amylase, catalytic region  27.5 
 
 		 433 aa  59.7  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.473519  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2810  alpha amylase, catalytic region  24.26 
 
 		 450 aa  59.3  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4392  alpha amylase, catalytic region  23.86 
 
 		 493 aa  59.3  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.47907 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2815  alpha amylase, catalytic region  27.5 
 
 		 433 aa  59.7  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.896664  normal  0.115274 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1712  alpha amylase, catalytic region  23.74 
 
 		 481 aa  59.3  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2798  alpha amylase, catalytic region  27.5 
 
 		 433 aa  58.9  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.242606  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2278  alpha amylase catalytic region  21.59 
 
 		 1307 aa  58.5  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.792883  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2732  alpha amylase, catalytic region  21.11 
 
 		 463 aa  58.2  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.839185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1458  alpha amylase, catalytic region  24.14 
 
 		 644 aa  57.8  0.0000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.628846  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4625  alpha amylase catalytic region  24.14 
 
 		 481 aa  57.4  0.0000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1504  alpha amylase catalytic region  26.74 
 
 		 728 aa  57.4  0.0000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.496352 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3073  alpha amylase catalytic region  23.05 
 
 		 477 aa  57  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0143  alpha amylase catalytic sub domain protein  22.33 
 
 		 692 aa  56.6  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0052779  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4090  alpha amylase catalytic region  23.56 
 
 		 614 aa  57  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.904888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3146  alpha amylase catalytic region  28.57 
 
 		 622 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.476414 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0183  alpha amylase, catalytic region  23.99 
 
 		 600 aa  55.8  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0014  alpha amylase, catalytic region  25.07 
 
 		 595 aa  56.2  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4463  alpha amylase catalytic region  26.07 
 
 		 442 aa  55.5  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.469495 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1890  alpha amylase, catalytic region  23.13 
 
 		 609 aa  54.7  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3708  alpha amylase catalytic region  23.96 
 
 		 549 aa  54.7  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0503251  hitchhiker  0.00685051 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24550  glycosidase  28.83 
 
 		 464 aa  54.7  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.665242 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3365  pullulanase, type I  30.98 
 
 		 712 aa  54.7  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3180  alpha amylase catalytic region  23.39 
 
 		 635 aa  54.7  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000161809  normal  0.231974 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1998  alpha amylase catalytic region  23.47 
 
 		 481 aa  54.3  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.722533  normal  0.515841 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1849  alpha-amylase  22.02 
 
 		 524 aa  53.9  0.000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0647  glycosidase  22.56 
 
 		 427 aa  53.9  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.701769  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1834  alpha amylase domain-containing protein  39.58 
 
 		 480 aa  53.5  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.108338  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0501  alpha amylase domain-containing protein  30.77 
 
 		 476 aa  53.1  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.259034  normal  0.140596 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  22.11 
 
 		 1847 aa  53.5  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1210  alpha amylase, catalytic region  23.4 
 
 		 460 aa  53.1  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0252  alpha amylase catalytic region  24.09 
 
 		 436 aa  53.5  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.795564  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1017  alpha amylase catalytic region  24.23 
 
 		 544 aa  53.1  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.503917 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  22.83 
 
 		 582 aa  52.8  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0833  alpha-glucosidase  24.75 
 
 		 544 aa  52.8  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1837  alpha amylase domain-containing protein  22.98 
 
 		 557 aa  52.8  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4031  alpha amylase catalytic region  27.5 
 
 		 413 aa  52.8  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0102813 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2519  alpha amylase  20.97 
 
 		 582 aa  52.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.252753 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1684  alpha amylase catalytic region  23.11 
 
 		 481 aa  52.8  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3603  alpha amylase catalytic region  28.77 
 
 		 572 aa  53.1  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0789  cymH protein  27.47 
 
 		 610 aa  52.8  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0868  pullulanase, extracellular  28.05 
 
 		 776 aa  52.8  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2152  alpha amylase catalytic region  23.64 
 
 		 493 aa  53.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.866439 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2108  alpha amylase catalytic region  23.64 
 
 		 493 aa  53.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  26.7 
 
 		 586 aa  52.4  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1313  alpha amylase, catalytic domain protein  23.92 
 
 		 459 aa  52  0.00003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02470  Alpha-glucosidase  24.42 
 
 		 576 aa  52.4  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.914818  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2435  alpha amylase catalytic region  23.42 
 
 		 451 aa  52.4  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>