147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_4198 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_4198  helicase domain protein  100 
 
 		 470 aa  979    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1893  type III restriction protein res subunit  51.15 
 
 		 472 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3459  type III restriction protein res subunit  51.15 
 
 		 472 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0962  putative type III restriction enzyme  47.65 
 
 		 466 aa  471  1.0000000000000001e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4273  type III restriction protein res subunit  48.73 
 
 		 471 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4412  type III restriction protein res subunit  48.73 
 
 		 471 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3418  type III restriction enzyme, res subunit  49.26 
 
 		 469 aa  464  1e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.280626  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3839  type III restriction enzyme, res subunit  49.47 
 
 		 471 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4016  type III restriction protein res subunit  46.7 
 
 		 469 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2555  hypothetical protein  45.28 
 
 		 465 aa  432  1e-120  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.813616 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0145  type III restriction enzyme, res subunit  45.84 
 
 		 465 aa  431  1e-119  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0080  helicase domain-containing protein  44.59 
 
 		 466 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1925  GGDEF family protein  42.68 
 
 		 477 aa  400  9.999999999999999e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3891  helicase domain-containing protein  50.13 
 
 		 458 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2283  type III restriction enzyme, res subunit  47.78 
 
 		 465 aa  392  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06217  hypothetical protein  39.96 
 
 		 464 aa  373  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0197  helicase domain-containing protein  49.3 
 
 		 429 aa  362  5.0000000000000005e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.13298  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4219  FOG domain-containing protein  40.32 
 
 		 434 aa  310  4e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.701537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1868  hypothetical protein  63.64 
 
 		 139 aa  177  4e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.776543  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3384  hypothetical protein  63.64 
 
 		 139 aa  176  8e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294151 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10520  DNA/RNA helicase, superfamily II  30.21 
 
 		 589 aa  152  1e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.531597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3879  type III restriction protein res subunit  28.77 
 
 		 593 aa  146  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25110  DNA/RNA helicase, superfamily II  29.81 
 
 		 593 aa  145  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.862041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0881  type III restriction protein res subunit  28.69 
 
 		 621 aa  144  2e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5135  type III restriction protein res subunit  30.35 
 
 		 622 aa  144  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0782203 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2320  type III restriction protein res subunit  28.3 
 
 		 593 aa  143  6e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000427068 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1051  type III restriction protein res subunit  30 
 
 		 628 aa  142  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2588  type III restriction enzyme, res subunit  28.01 
 
 		 591 aa  142  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.245843  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1291  type III restriction enzyme, res subunit  30.08 
 
 		 598 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1719  DNA or RNA helicase of superfamily II-like protein  28.05 
 
 		 582 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193156  normal  0.109566 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1318  type III restriction protein res subunit  27.21 
 
 		 601 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0818356  hitchhiker  0.00409906 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4526  DEAD-like helicase  29.31 
 
 		 559 aa  140  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1477  type III restriction protein res subunit  25.12 
 
 		 599 aa  140  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20110  DNA/RNA helicase, superfamily II  27.66 
 
 		 606 aa  139  1e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.24796  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0376  type III restriction protein res subunit  27.81 
 
 		 574 aa  137  6.0000000000000005e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0931  type III restriction protein res subunit  29.65 
 
 		 586 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.355478  normal  0.978518 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2242  type III restriction protein res subunit  28.42 
 
 		 595 aa  132  9e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1839  type III restriction protein res subunit  28.17 
 
 		 563 aa  132  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.036346  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0759  type III restriction enzyme, res subunit  27.67 
 
 		 566 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.523445  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2381  ATPase  28.85 
 
 		 569 aa  131  3e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.191246  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2743  type III restriction protein res subunit  29.14 
 
 		 618 aa  131  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0145  type III restriction enzyme, res subunit  27.67 
 
 		 574 aa  130  7.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08280  DNA/RNA helicase, superfamily II  29.51 
 
 		 606 aa  129  1.0000000000000001e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.265179  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1380  type III restriction enzyme, res subunit  30.11 
 
 		 601 aa  128  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.942893  normal  0.0185831 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12931  hypothetical protein  26.57 
 
 		 626 aa  128  3e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.129963  normal  0.499246 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24400  DNA/RNA helicase, superfamily II  27.93 
 
 		 592 aa  125  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.21286 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0602  type III restriction enzyme, res subunit  25.98 
 
 		 560 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.44982  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0615  type III restriction enzyme, res subunit  25.98 
 
 		 560 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0593  type III restriction enzyme, res subunit  25.98 
 
 		 560 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.147168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1502  type III restriction protein res subunit  28.65 
 
 		 572 aa  121  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1473  type III restriction enzyme, res subunit  26.7 
 
 		 577 aa  117  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4538  type III restriction protein res subunit  26.13 
 
 		 565 aa  114  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1438  type III restriction protein res subunit  26.43 
 
 		 575 aa  113  6e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0796  type III restriction protein res subunit  25.97 
 
 		 598 aa  97.1  6e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.42368  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3774  type III restriction protein res subunit  25.37 
 
 		 583 aa  95.5  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.476443  normal  0.253817 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3772  type III restriction protein res subunit  26.17 
 
 		 594 aa  94.4  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.513418 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1979  hypothetical protein  23.76 
 
 		 435 aa  90.5  6e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0799081 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08571  helicase domain-containing protein  24.53 
 
 		 438 aa  80.9  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0682  hypothetical protein  24.48 
 
 		 456 aa  80.1  0.00000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.835313  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1467  type III restriction enzyme, res subunit  24.02 
 
 		 583 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.387336  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1862  type III restriction enzyme, res subunit  23.13 
 
 		 580 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.547726  normal  0.254233 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2080  helicase  22.4 
 
 		 588 aa  65.1  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.453275  normal  0.977675 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1532  type III restriction enzyme, res subunit  23.53 
 
 		 579 aa  63.9  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.413566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2559  type III restriction protein res subunit  21.93 
 
 		 580 aa  63.9  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2959  type III restriction enzyme, res subunit  24.14 
 
 		 585 aa  62.8  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2089  type III restriction enzyme, res subunit  23.02 
 
 		 616 aa  61.6  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.553683  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1751  type III restriction protein res subunit  24.4 
 
 		 584 aa  60.8  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1747  type III restriction protein res subunit  24.4 
 
 		 584 aa  60.8  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0541375  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1790  type III restriction protein res subunit  24.4 
 
 		 584 aa  60.5  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.766528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3456  type III restriction enzyme, res subunit  23.02 
 
 		 597 aa  59.7  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2363  type III restriction enzyme, res subunit  23.88 
 
 		 590 aa  59.7  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0989425  normal  0.0932294 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2524  type III restriction enzyme, res subunit  23.54 
 
 		 590 aa  59.7  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.251269  normal  0.0163499 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2533  type III restriction protein res subunit  24.4 
 
 		 584 aa  59.7  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.10242  hitchhiker  0.000564265 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2744  helicase  23.61 
 
 		 590 aa  58.2  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2726  type III restriction protein res subunit  22.11 
 
 		 580 aa  58.2  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.219655  hitchhiker  0.000185767 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2435  type III restriction enzyme, res subunit  23.02 
 
 		 590 aa  55.8  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2780  type III restriction enzyme, res subunit  21.07 
 
 		 586 aa  55.8  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0188494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2350  type III restriction enzyme, res subunit  24.07 
 
 		 602 aa  55.5  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1743  DNA repair helicase RAD25  24.41 
 
 		 531 aa  55.5  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2463  putative helicase  20.59 
 
 		 586 aa  55.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.863309 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2417  putative helicase  20.32 
 
 		 586 aa  54.3  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.011156  normal  0.197081 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2574  putative helicase  20.32 
 
 		 586 aa  54.3  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.452066  hitchhiker  0.00320977 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0683  type I restriction-modification system, R subunit  21.84 
 
 		 784 aa  53.9  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0832  EcoEI R domain protein  21.84 
 
 		 784 aa  53.9  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.916446  normal  0.633032 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2280  type III restriction enzyme, res subunit  22.06 
 
 		 558 aa  53.5  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2719  putative helicase  21.95 
 
 		 585 aa  53.5  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00330465  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2794  type III restriction protein res subunit  21.95 
 
 		 585 aa  53.5  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.183482  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1489  putative helicase  21.95 
 
 		 585 aa  53.5  0.000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.931099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2460  putative helicase  20.05 
 
 		 586 aa  53.5  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666895 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0308  type III restriction protein res subunit  23.45 
 
 		 449 aa  53.1  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2372  putative helicase  20.32 
 
 		 586 aa  53.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.010081  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0824  EcoEI R domain-containing protein  21.86 
 
 		 783 aa  52  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1637  type III restriction protein res subunit  22.93 
 
 		 586 aa  51.2  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2440  type III restriction protein res subunit  21.69 
 
 		 591 aa  51.2  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3253  type III restriction protein res subunit  22.25 
 
 		 585 aa  50.8  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.503255  normal  0.463212 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0100  type III restriction protein res subunit  22.51 
 
 		 440 aa  50.8  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000273539  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1455  type III restriction protein res subunit  22.34 
 
 		 444 aa  50.4  0.00007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.437061  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03609  Type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit and related helicase  22.16 
 
 		 1141 aa  49.7  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1412  type III restriction protein res subunit  22.05 
 
 		 556 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00105152  normal  0.0540272 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1242  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  25.23 
 
 		 657 aa  49.3  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000376746  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>