More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0735 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0735  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 212 aa  430  1e-120  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.177644  normal  0.315987 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0274  transcriptional regulator, TetR family  59.36 
 
 		 193 aa  218  5e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4482  TetR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 197 aa  170  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14402  normal  0.0182705 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7118  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 186 aa  108  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0105564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1467  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 192 aa  102  4e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.861342  normal  0.113855 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5016  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 191 aa  102  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000793722  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2114  transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 		 193 aa  101  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4057  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 191 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4071  putative transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 193 aa  95.5  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294777  normal  0.94431 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0581  putative transcriptional regulator  35.08 
 
 		 189 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0275  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 193 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.280469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06210  putative transcriptional regulator  32.2 
 
 		 189 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0238159 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0206  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 205 aa  92.4  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.611612 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9229  transcriptional regulator TetR family  35.39 
 
 		 209 aa  89  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21864  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3452  transcriptional regulator, TetR family  29.48 
 
 		 205 aa  88.2  9e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0294937  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3287  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 194 aa  88.2  9e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.482502 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4133  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 193 aa  87.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4649  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 186 aa  87.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.490512  normal  0.521268 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2948  transcriptional regulator, TetR family  32.4 
 
 		 193 aa  87.4  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000720602  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5870  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 209 aa  86.3  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3185  transcriptional regulator, TetR family  28.26 
 
 		 192 aa  86.3  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2750  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 194 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209675  normal  0.0475693 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2720  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 194 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.532546  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2764  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 194 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1740  transcriptional regulator, TetR family  31.02 
 
 		 188 aa  82.8  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.976934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6109  TetR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617571  normal  0.147608 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10198  transcriptional regulator  31.18 
 
 		 194 aa  82  0.000000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0973  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.269206  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0275  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 193 aa  79.7  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3009  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 199 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.101347  normal  0.721246 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5683  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 189 aa  77  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5671  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 190 aa  76.6  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6178  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 196 aa  75.9  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2194  transcriptional regulator, TetR family  27.93 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.285199  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2559  transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.927467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6399  TetR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 193 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.147882 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1963  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 190 aa  71.2  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.264679 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5526  TetR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 209 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5890  TetR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 209 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.223104  normal  0.394498 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2958  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 186 aa  69.3  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0440878  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5860  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 194 aa  68.2  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0726  regulatory protein TetR  23.76 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3237  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0582489  normal  0.651915 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0685  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0111634 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5685  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0798  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01911  putative transcription regulator protein  28.49 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0303213 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2933  regulatory protein, TetR  32.62 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.316351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2843  transcriptional regulator, TetR family  33.6 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0216  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 175 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5713  transcriptional regulator, TetR family  32.41 
 
 		 190 aa  62  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5306  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 193 aa  62  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.635344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5395  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 193 aa  62  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.488916  normal  0.171159 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3076  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192901  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2924  regulatory protein TetR  27.07 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6284  regulatory protein, TetR  26.74 
 
 		 195 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02185  transcriptional regulator  23.44 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.69519  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  24.48 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1967  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4347  transcriptional regulator, TetR family  26.74 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2563  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.227827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2392  TetR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0101662  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2838  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2760  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000891417  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3720  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1726  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.379747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2332  transcriptional regulator, TetR family  26.86 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.950158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1745  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1792  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3291  TetR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6222  transcriptional regulator, TetR family  25.88 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.366462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4533  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0169871 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0897  TetR family transcriptional regulator  23.74 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0955  TetR family transcriptional regulator  23.74 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3493  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.74894  n/a   
 
 
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NC_010511  M446_1098  TetR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0976848 
 
 
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NC_013421  Pecwa_1371  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 189 aa  54.7  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.91689  n/a   
 
 
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NC_007643  Rru_A0888  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 203 aa  54.7  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 231 aa  54.3  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008392  Bamb_5953  TetR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0308427  normal  1 
 
 
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NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  25.65 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
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NC_010557  BamMC406_5709  TetR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.92684  normal  0.162375 
 
 
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NC_003909  BCE_3228  TetR family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00722998  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_2970  TetR family transcriptional regulator  23.74 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013421  Pecwa_1188  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 193 aa  53.9  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  24.72 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
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NC_013457  VEA_001160  transcriptional regulator  28.7 
 
 		 181 aa  53.5  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002947  PP_2475  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 197 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000212819  normal  1 
 
 
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NC_008789  Hhal_0394  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 186 aa  53.1  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.509635  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK0856  TetR family transcriptional regulator  23.74 
 
 		 194 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.257581  n/a   
 
 
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NC_008726  Mvan_4729  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 240 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010581  Bind_0962  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011773  BCAH820_3212  transcriptional regulator, TetR family  23.71 
 
 		 188 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 217 aa  52.8  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
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NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 226 aa  52.8  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
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