112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3525 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0196  ATPase  54.06 
 
 		 666 aa  686    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3525  ATP-dependent exoDNAse beta subunit  100 
 
 		 657 aa  1325    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.297188  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0046  hypothetical protein  42.14 
 
 		 661 aa  483  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.489022  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4418  ATP-dependent OLD family endonuclease  39.14 
 
 		 639 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06203  hypothetical protein  36.51 
 
 		 669 aa  405  1e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3680  hypothetical protein  36.08 
 
 		 667 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228767  hitchhiker  0.00106717 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3175  SMC domain protein  38.57 
 
 		 634 aa  381  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0609812  unclonable  0.0000000000000447606 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1604  hypothetical protein  33.58 
 
 		 685 aa  378  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2559  hypothetical protein  35.93 
 
 		 645 aa  372  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4276  Fis family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 645 aa  366  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.237058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3193  plasmid-related protein  32.98 
 
 		 674 aa  367  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0945381 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2954  putative exonuclease  34.22 
 
 		 659 aa  358  9.999999999999999e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3363  hypothetical protein  24.6 
 
 		 607 aa  83.6  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.194578  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0038  hypothetical protein  25.15 
 
 		 594 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19507  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  23.35 
 
 		 623 aa  76.6  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3408  hypothetical protein  28.83 
 
 		 594 aa  71.2  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.043782  normal  0.188523 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1644  hypothetical protein  28.96 
 
 		 596 aa  70.1  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.595797  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5488  putative nucleoside triphosphate hydrolase domain-containing protein  26.3 
 
 		 598 aa  69.7  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3655  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.98 
 
 		 793 aa  67  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523201  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6911  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.55 
 
 		 669 aa  66.6  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0857845  hitchhiker  0.000559752 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4219  ATP-dependent endonuclease, OLD family  27.59 
 
 		 780 aa  64.3  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0753  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.24 
 
 		 594 aa  63.2  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.362493  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6476  ATP-dependent endonuclease, OLD family  26.86 
 
 		 762 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1439  hypothetical protein  25.71 
 
 		 744 aa  62  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0880018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0294  ATP-dependent endonuclease, OLD family  23.73 
 
 		 773 aa  61.2  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0724498 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2561  ATP-dependent endonuclease  31.58 
 
 		 613 aa  60.8  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0763392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60070  hypothetical protein  28.49 
 
 		 807 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000312719  hitchhiker  0.0000000420342 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1800  ATP-dependent endonuclease  25.42 
 
 		 782 aa  56.6  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.163523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3887  hypothetical protein  26.9 
 
 		 546 aa  57  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.333396  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  29.05 
 
 		 650 aa  55.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2720  hypothetical protein  23.55 
 
 		 784 aa  55.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4449  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  25.56 
 
 		 564 aa  56.6  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003289  pathogenesis related protein  22.68 
 
 		 714 aa  55.8  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.31747  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3144  SMC (structural maintenance of chromosomes) family protein  27.16 
 
 		 682 aa  55.5  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872592  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2417  hypothetical protein  23.15 
 
 		 748 aa  55.1  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.295746  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5469  hypothetical protein  23.5 
 
 		 763 aa  53.9  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.913319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1844  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.87 
 
 		 640 aa  53.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2313  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  38.2 
 
 		 496 aa  53.5  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0748402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2848  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.74 
 
 		 674 aa  53.5  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351188  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3013  hypothetical protein  27.88 
 
 		 520 aa  53.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.364148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2727  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.03 
 
 		 607 aa  53.1  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4970  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.73 
 
 		 677 aa  52.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358529 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2791  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.73 
 
 		 677 aa  52.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0639956 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0001  hypothetical protein  24.78 
 
 		 707 aa  51.6  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.426286  unclonable  0.0000000168459 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1960  hypothetical protein  26.71 
 
 		 522 aa  52  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0206  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.56 
 
 		 689 aa  51.6  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3567  OLD family ATP-dependent endonuclease-like protein  23.56 
 
 		 604 aa  51.2  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274046 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1874  hypothetical protein  24.37 
 
 		 703 aa  51.2  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.75491  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0004  ATP binding protein  48 
 
 		 454 aa  50.4  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3272  OLD family-like ATP-dependent endonuclease  33.82 
 
 		 758 aa  49.7  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3543  SMC protein-like  48.57 
 
 		 695 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0201  ATP-dependent endonuclease of the OLD family protein  23.96 
 
 		 558 aa  49.7  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2759  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.83 
 
 		 608 aa  49.7  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1891  SMC domain protein  20.15 
 
 		 628 aa  49.3  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0318  condensin subunit Smc  36 
 
 		 1307 aa  48.5  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0257  ATPase  32.61 
 
 		 403 aa  48.9  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116042  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0349  SMC protein-like  36 
 
 		 1318 aa  48.9  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0467  SMC domain-containing protein  36 
 
 		 1280 aa  48.9  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3277  hypothetical protein  25.81 
 
 		 728 aa  48.9  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0296184  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1111  ATP-dependent OLD family endonuclease  25 
 
 		 603 aa  48.1  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1507  SMC domain protein  30.65 
 
 		 1115 aa  48.5  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.44218  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  39.29 
 
 		 1167 aa  48.1  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  27.42 
 
 		 564 aa  48.1  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  39.29 
 
 		 1167 aa  48.1  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0477  hypothetical protein  26.26 
 
 		 543 aa  47.8  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000481423  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  34.72 
 
 		 1170 aa  47.4  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  39.29 
 
 		 1167 aa  47.8  0.0007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  39.29 
 
 		 1167 aa  47.8  0.0007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  34.72 
 
 		 1170 aa  47.4  0.0008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1846  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.76 
 
 		 589 aa  46.6  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147928 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3955  AAA ATPase  27.78 
 
 		 642 aa  47  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262295  hitchhiker  0.00100841 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0676  hypothetical protein  28.48 
 
 		 712 aa  46.6  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54535 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3185  ATP-dependent endonuclease family protein  31.4 
 
 		 641 aa  47  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4907  hypothetical protein  21.39 
 
 		 769 aa  46.6  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.50635  normal  0.10457 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12936  chromosome partitioning protein smc  38.57 
 
 		 1205 aa  47  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0598484  normal  0.252083 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1087  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.22 
 
 		 616 aa  47  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  36 
 
 		 1185 aa  46.6  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0661  SMC domain protein  30.15 
 
 		 1172 aa  46.6  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23830  condensin subunit Smc  38.57 
 
 		 1213 aa  45.8  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05915  hypothetical protein  31.39 
 
 		 544 aa  46.6  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4162  ATP-dependent endonuclease family protein  31.9 
 
 		 600 aa  45.8  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.138387  normal  0.169092 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0630  hypothetical protein  29.55 
 
 		 513 aa  45.4  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1159  chromosome segregation protein SMC  35.42 
 
 		 1203 aa  45.4  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1889  chromosome segregation protein SMC  36.11 
 
 		 1214 aa  45.8  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274558  normal  0.174948 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1866  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.32 
 
 		 595 aa  45.1  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1165  chromosome segregation protein SMC  34.55 
 
 		 1163 aa  45.4  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126703  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1462  chromosome segregation protein SMC  38.57 
 
 		 1186 aa  45.4  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0128703  normal  0.569809 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2748  condensin subunit Smc  34.55 
 
 		 1162 aa  45.4  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.928329  normal  0.900394 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3087  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.51 
 
 		 605 aa  45.1  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  34.55 
 
 		 1162 aa  45.1  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  25.13 
 
 		 688 aa  44.7  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000190  ATP-dependent endonuclease  29.93 
 
 		 544 aa  44.7  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0284428  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2550  chromosome segregation protein SMC  40 
 
 		 1191 aa  44.7  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.355324  normal  0.42272 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1953  condensin subunit Smc  35.71 
 
 		 1195 aa  44.7  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1999  condensin subunit Smc  35.71 
 
 		 1195 aa  44.7  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2175  chromosome segregation protein SMC  35.71 
 
 		 1194 aa  44.7  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0996  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.07 
 
 		 637 aa  44.7  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1933  condensin subunit Smc  35.71 
 
 		 1195 aa  44.7  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00525455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0681  overcoming lysogenization defect protein  25.82 
 
 		 696 aa  44.7  0.006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2614  hypothetical protein  25.13 
 
 		 555 aa  44.3  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>