100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3778 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS03685  signal peptide protein  79.58 
 
 		 475 aa  754    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0875463  normal  0.498425 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5024  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  68.64 
 
 		 470 aa  654    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4855  coagulation factor 5/8 type domain protein  100 
 
 		 472 aa  952    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3778  coagulation factor 5/8 type domain protein  100 
 
 		 472 aa  952    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0933074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4499  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  68.22 
 
 		 470 aa  649    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0569  putative secreted protein  70.34 
 
 		 470 aa  663    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3544  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  67.76 
 
 		 471 aa  631  1e-180  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5087  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  68.03 
 
 		 487 aa  619  1e-176  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.800108 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5195  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  68.25 
 
 		 480 aa  620  1e-176  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3281  coagulation factor 5/8 type-like  68.03 
 
 		 487 aa  619  1e-176  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17510  hypothetical protein  40.82 
 
 		 335 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1520  hypothetical protein  40.19 
 
 		 335 aa  223  6e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2893  Alkaline phosphatase  53.24 
 
 		 452 aa  127  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21156  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1551  hypothetical protein  54.48 
 
 		 571 aa  124  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3687  coagulation factor 5/8 type domain protein  53.68 
 
 		 674 aa  114  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0980417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  50.39 
 
 		 987 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1480  coagulation factor 5/8 type domain protein  46.04 
 
 		 722 aa  107  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  49.64 
 
 		 588 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3492  coagulation factor 5/8 type domain protein  51.61 
 
 		 962 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  52.21 
 
 		 1158 aa  103  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  45.04 
 
 		 392 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  45.04 
 
 		 953 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  50.78 
 
 		 639 aa  101  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2003  hypothetical protein  48.53 
 
 		 850 aa  100  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614926  normal  0.156337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.51 
 
 		 756 aa  99.4  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3723  hypothetical protein  49.64 
 
 		 449 aa  99  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.788097  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3396  hypothetical protein  41.92 
 
 		 433 aa  98.2  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.494224 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  50.77 
 
 		 815 aa  97.1  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6675  coagulation factor 5/8 type domain protein  45.16 
 
 		 929 aa  95.1  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.692846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  43.75 
 
 		 637 aa  94.7  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  45.52 
 
 		 752 aa  94.4  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6648  coagulation factor 5/8 type domain protein  49.26 
 
 		 940 aa  94  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0314852  normal  0.100583 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4311  coagulation factor 5/8 type domain protein  47.33 
 
 		 755 aa  93.6  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0177286  hitchhiker  0.00166201 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2177  glycoside hydrolase family protein  43.08 
 
 		 578 aa  93.2  9e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0141597  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4312  coagulation factor 5/8 type domain protein  47.73 
 
 		 1007 aa  92.8  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382948  hitchhiker  0.000989115 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  43.28 
 
 		 729 aa  92.4  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4887  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  45.83 
 
 		 581 aa  90.5  6e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.825597 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4412  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  47.62 
 
 		 578 aa  90.1  7e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.835766 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2035  peptidase S45 penicillin amidase  43.94 
 
 		 1070 aa  89.7  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.973933 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3724  hypothetical protein  44.7 
 
 		 999 aa  84  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606148  normal  0.741628 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4786  protein of unknown function DUF1111  38.76 
 
 		 879 aa  83.6  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4824  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  38.31 
 
 		 1117 aa  83.6  0.000000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.90345 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4811  coagulation factor 5/8 type domain protein  43.94 
 
 		 971 aa  83.6  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000406891  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  41.09 
 
 		 1441 aa  80.9  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0821  coagulation factor 5/8 type-like protein  41.22 
 
 		 558 aa  81.3  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000172205  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4788  coagulation factor 5/8 type domain protein  42.4 
 
 		 1564 aa  80.5  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.91 
 
 		 1321 aa  80.1  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  43.36 
 
 		 801 aa  78.6  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  37.12 
 
 		 1059 aa  78.6  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0475  Beta-glucosidase-related glycosidases-like  35.45 
 
 		 1581 aa  77.8  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.811095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0478  GTP-binding protein TypA  39.1 
 
 		 1028 aa  77  0.0000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  40.48 
 
 		 819 aa  76.6  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  42.53 
 
 		 915 aa  75.5  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2861  coagulation factor 5/8 type domain protein  38.17 
 
 		 984 aa  75.9  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00229986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1614  glycosy hydrolase family protein  37.07 
 
 		 1471 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3212  peptidase S45 penicillin amidase  39.26 
 
 		 1103 aa  73.9  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0203581  normal  0.139028 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  35.05 
 
 		 1338 aa  73.9  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8724  Protein related to penicillin acylase-like protein  42.65 
 
 		 1059 aa  72  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0379  protein of unknown function DUF291  31.28 
 
 		 732 aa  71.6  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1775  S-layer domain-containing protein  33.82 
 
 		 2117 aa  70.9  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.83614  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  35.88 
 
 		 1332 aa  68.9  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1525  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  39.31 
 
 		 695 aa  66.6  0.0000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.299502  hitchhiker  0.000931017 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3021  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  34.38 
 
 		 722 aa  66.6  0.0000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105291 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  34.11 
 
 		 4013 aa  66.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2796  coagulation factor 5/8 type domain protein  38.1 
 
 		 1139 aa  66.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.151007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3972  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.62 
 
 		 929 aa  64.7  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.443016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1444  extracellular solute-binding protein  35.04 
 
 		 1184 aa  61.6  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.913527  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0553  discoidin domain-containing protein  32.03 
 
 		 1061 aa  60.1  0.00000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326441  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1702  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.08 
 
 		 1038 aa  60.1  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4979  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.14 
 
 		 1060 aa  58.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00350881  normal  0.0761827 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1052  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.96 
 
 		 1362 aa  55.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0825  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.07 
 
 		 478 aa  54.7  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.752393  normal  0.358271 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4947  Alpha-L-fucosidase  34.78 
 
 		 644 aa  54.3  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00851313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0285  endo-beta-N-acetylglucosaminidase  35.16 
 
 		 1135 aa  53.9  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4670  alpha-1,2-mannosidase  34.71 
 
 		 899 aa  53.9  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00187508  normal  0.0229721 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3060  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.31 
 
 		 820 aa  53.5  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.481908 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2555  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.84 
 
 		 736 aa  52.8  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7141  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.58 
 
 		 538 aa  51.2  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174227  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4863  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  37.14 
 
 		 112 aa  48.9  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483102  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3395  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.69 
 
 		 1448 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392146  normal  0.950176 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1957  heme-binding protein  33.04 
 
 		 1439 aa  48.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.585406  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1631  WD40 domain-containing protein  32.26 
 
 		 347 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3709  hypothetical protein  36.36 
 
 		 818 aa  47.4  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.156868 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1751  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  32.48 
 
 		 1088 aa  46.2  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.865218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1774  amidohydrolase  26.56 
 
 		 1014 aa  46.2  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0234293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1898  translocation protein TolB  25.5 
 
 		 450 aa  45.8  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1157  hypothetical protein  43.64 
 
 		 151 aa  45.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4337  coagulation factor 5/8 type domain protein  40 
 
 		 933 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.202539 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3294  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.27 
 
 		 1109 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0373  coagulation factor 5/8 type domain protein  35.16 
 
 		 795 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.634884  normal  0.96557 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003913  TolB protein precursor  29.1 
 
 		 442 aa  45.1  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.26371  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2260  WD40 domain-containing protein  35.96 
 
 		 348 aa  45.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259667 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0175  TolB protein  26.25 
 
 		 437 aa  44.7  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.313268  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0197  endo-beta-N-acetylglucosaminidase D  30.99 
 
 		 927 aa  44.7  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2455  translocation protein TolB  26.79 
 
 		 430 aa  45.1  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328002  normal  0.860267 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019  TolB  26.25 
 
 		 440 aa  44.7  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.636869  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3993  translocation protein TolB  27.74 
 
 		 423 aa  44.7  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0034  hypothetical protein  27.34 
 
 		 768 aa  44.3  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5713  peptidase S41  44.9 
 
 		 1097 aa  43.5  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2939  translocation protein TolB  31.25 
 
 		 451 aa  43.5  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00432408  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>