106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1434 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1434  TonB family protein  100 
 
 		 290 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214443  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1243  TonB-like protein  66.23 
 
 		 292 aa  325  7e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.122386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4002  TonB-like  63.64 
 
 		 292 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2420  TonB family protein  52.68 
 
 		 285 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0938  TonB-like  54.27 
 
 		 286 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2359  TonB-like  48.8 
 
 		 278 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0749  TonB-like  34.3 
 
 		 269 aa  110  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0705  TonB protein  33.58 
 
 		 267 aa  109  5e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2038  TonB like protein  33.58 
 
 		 267 aa  109  5e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.970768  normal  0.85242 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0373  TonB family protein  45.97 
 
 		 250 aa  100  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1657  TonB-like protein  32.54 
 
 		 279 aa  98.6  9e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0134  TonB domain-containing protein  41.82 
 
 		 267 aa  91.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3890  TonB domain-containing protein  41.82 
 
 		 267 aa  91.7  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.544733 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4082  TonB family protein  41.82 
 
 		 267 aa  91.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2053  TonB like protein  49.46 
 
 		 256 aa  91.3  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4168  TonB family protein  28.72 
 
 		 268 aa  90.5  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4542  TonB-like  45.74 
 
 		 265 aa  89  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3641  TonB-like  41.49 
 
 		 251 aa  88.6  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4240  TonB family protein  45.56 
 
 		 268 aa  86.3  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4374  TonB family protein  45.56 
 
 		 268 aa  85.9  8e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3308  TonB family protein  28.57 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0116  TonB family C-terminal domain protein  29.33 
 
 		 258 aa  82.4  0.000000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1982  TonB-like  44.94 
 
 		 266 aa  82.4  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0233  TonB family protein  41.3 
 
 		 269 aa  81.6  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0067  tonB protein  45.26 
 
 		 248 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0203  TonB, C-terminal  45.26 
 
 		 248 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4192  TonB family protein  38.64 
 
 		 273 aa  81.3  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5557  TonB-like  38.69 
 
 		 248 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5982  tonB protein  34.84 
 
 		 317 aa  78.6  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2276  TonB family protein  26.97 
 
 		 336 aa  77  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000987559  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  28.86 
 
 		 292 aa  75.1  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3167  protein TolA  30.29 
 
 		 331 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2391  TonB family protein  40.82 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.533007 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1047  putative TonB-dependent colicin receptor protein  23.57 
 
 		 279 aa  71.6  0.00000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.710809  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4086  TonB family protein  32.46 
 
 		 295 aa  70.9  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0148952  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5356  TonB family protein  37.61 
 
 		 243 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.772268  normal  0.884832 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3695  TonB family protein  32.43 
 
 		 282 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2092  TonB-like protein  26.55 
 
 		 264 aa  69.3  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.014367 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3468  TonB family protein  36.44 
 
 		 266 aa  68.6  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0174  TonB-dependent colicin receptor protein, putative  30 
 
 		 248 aa  67.8  0.0000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.301208  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3331  TonB-like  25.72 
 
 		 264 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.198934  normal  0.616701 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2230  energy transducer  33.91 
 
 		 315 aa  68.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52012  normal  0.174311 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0824  TonB family protein  38.04 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0481121 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2216  TonB-like protein  34.58 
 
 		 235 aa  66.6  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1027  TonB, C-terminal  32.98 
 
 		 235 aa  66.2  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2067  TonB family protein  35.21 
 
 		 324 aa  66.2  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10610  TonB protein  37.86 
 
 		 280 aa  65.5  0.0000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.94051  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1307  putative energy transducer TonB  25.95 
 
 		 263 aa  65.1  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217867  normal  0.59147 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3965  TonB family protein  28.06 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4275  TonB family protein  29.75 
 
 		 277 aa  63.9  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0101728 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2101  TonB family protein  35.96 
 
 		 171 aa  63.5  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.483665  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2906  TonB-like  38.2 
 
 		 235 aa  62.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155829  normal  0.22869 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1517  TonB-like  28.04 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1845  TonB family protein  40 
 
 		 268 aa  61.6  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0183  TonB family protein  35.64 
 
 		 251 aa  61.2  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.144886  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0441  TonB family protein  34.41 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0624564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2306  TonB-like protein  32.26 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0143972 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5125  TonB family protein  39.78 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2335  TonB family protein  31.31 
 
 		 308 aa  58.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2981  TonB-dependent receptor, putative  32.38 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0613  TonB family protein  38.04 
 
 		 495 aa  57.4  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00466387 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1564  TonB family protein  30 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2512  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  32.58 
 
 		 411 aa  55.5  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.929963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3545  putative energy transducer TonB  28.21 
 
 		 269 aa  55.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3748  TonB family protein  36.26 
 
 		 88 aa  55.5  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0443  TonB family protein  33.59 
 
 		 284 aa  55.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1269  TonB protein  27.68 
 
 		 263 aa  53.9  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.111983  normal  0.123169 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2307  TonB like protein  27.68 
 
 		 263 aa  53.9  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.242598  normal  0.294418 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3402  hypothetical protein  26.67 
 
 		 431 aa  52.8  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.904792 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2144  TonB family protein  33.88 
 
 		 296 aa  52  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0689  TonB protein  27.36 
 
 		 250 aa  50.8  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0675786  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1133  TonB family protein  30.96 
 
 		 270 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2909  TonB family protein  32.95 
 
 		 292 aa  50.8  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3091  TonB family protein  34.34 
 
 		 294 aa  50.1  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.370908 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1242  protein TonB  24.81 
 
 		 283 aa  49.3  0.00007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.510655  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7000  hypothetical protein  30 
 
 		 154 aa  48.9  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.695854 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2389  TonB-dependent receptor, putative  28.71 
 
 		 245 aa  48.5  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3266  TonB family protein  28.29 
 
 		 451 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0913504 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1624  TonB-like  29.47 
 
 		 285 aa  47.8  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0946322  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1544  TonB-like  22.94 
 
 		 248 aa  47.8  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0849  TonB, putative  29.89 
 
 		 249 aa  47.8  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00146132  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2937  TonB family protein  36.49 
 
 		 411 aa  47.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.74836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0559  TonB family protein  23.36 
 
 		 220 aa  48.1  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.334223 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0754  TonB family protein  23.43 
 
 		 317 aa  47.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.278027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0737  TonB family protein  29.33 
 
 		 251 aa  47.4  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1015  TonB protein  26.39 
 
 		 291 aa  45.8  0.0007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0891  TonB family protein  26.39 
 
 		 291 aa  45.8  0.0007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.170067  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2159  TonB family protein  27.47 
 
 		 277 aa  46.2  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5527  TonB-like protein  35.53 
 
 		 243 aa  45.8  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1944  TonB family protein  26.98 
 
 		 242 aa  45.8  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2301  TonB family protein  26.98 
 
 		 242 aa  45.8  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2127  TonB-like  32.18 
 
 		 330 aa  45.4  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0144571  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1256  TonB family protein  31.15 
 
 		 325 aa  45.4  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.739127  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1668  TonB-dependent receptor  31.71 
 
 		 308 aa  44.3  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  24.31 
 
 		 3409 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0922  putative TonB protein  29.81 
 
 		 294 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.702209  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  32.89 
 
 		 270 aa  43.9  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2668  TonB family protein  40 
 
 		 252 aa  43.9  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1850  putative tonB protein  23.76 
 
 		 217 aa  43.5  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.473086  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  38.6 
 
 		 245 aa  43.1  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.866851 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>