More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4707 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011366  Rleg2_5744  extracellular solute-binding protein family 1  91.17 
 
 		 419 aa  795    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.593109 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4707  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 419 aa  858    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7049  extracellular solute-binding protein  48.76 
 
 		 439 aa  413  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0982583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0048  extracellular solute-binding protein  48.48 
 
 		 513 aa  388  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2901  extracellular solute-binding protein family 1  48.64 
 
 		 425 aa  385  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3146  extracellular solute-binding protein family 1  28.97 
 
 		 439 aa  119  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.654082  normal  0.268339 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0304  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  30.09 
 
 		 421 aa  117  5e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2090  extracellular solute-binding protein family 1  26.47 
 
 		 423 aa  117  5e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000307561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2940  extracellular solute-binding protein  28.32 
 
 		 421 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459152  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  29.33 
 
 		 412 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  29.09 
 
 		 412 aa  113  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0305  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 428 aa  113  8.000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.937006  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  28.79 
 
 		 423 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  28.68 
 
 		 414 aa  111  3e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  29.08 
 
 		 421 aa  109  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20870  extracellular solute-binding protein family 1  26.82 
 
 		 430 aa  107  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  28.25 
 
 		 411 aa  104  3e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  28.25 
 
 		 411 aa  104  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  28.44 
 
 		 412 aa  103  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3329  extracellular solute-binding protein  31.44 
 
 		 423 aa  103  7e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0487  extracellular solute-binding protein family 1  27.65 
 
 		 433 aa  100  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2286  extracellular solute-binding protein family 1  28.07 
 
 		 484 aa  100  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.322369 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0889  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  24.93 
 
 		 424 aa  99  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4125  extracellular solute-binding protein  25.12 
 
 		 408 aa  97.4  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4395  extracellular solute-binding protein  27.7 
 
 		 420 aa  96.3  9e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.87283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2237  extracellular solute-binding protein family 1  27.76 
 
 		 466 aa  95.9  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0309  extracellular solute-binding protein  27.7 
 
 		 438 aa  95.9  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.242924  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19900  extracellular solute-binding protein family 1  25.71 
 
 		 415 aa  95.1  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0459  extracellular solute-binding protein  27.71 
 
 		 436 aa  95.1  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.420805  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0025  extracellular solute-binding protein  26.32 
 
 		 422 aa  94.7  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669897  normal  0.473652 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4979  extracellular solute-binding protein  26.92 
 
 		 439 aa  94.4  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.336131  normal  0.060129 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4682  extracellular solute-binding protein  25.89 
 
 		 412 aa  94  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0252692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7822  putative ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.43 
 
 		 486 aa  94.4  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0974  extracellular solute-binding protein family 1  27.61 
 
 		 435 aa  93.6  6e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.606433  normal  0.163223 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0258  extracellular solute-binding protein  25.72 
 
 		 419 aa  93.2  9e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  25.28 
 
 		 413 aa  92.8  9e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4442  extracellular solute-binding protein  27.53 
 
 		 425 aa  92.8  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00539632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0762  extracellular solute-binding protein  24.33 
 
 		 424 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000277245  normal  0.855778 
 
 
 
NC_007511  Bcep18194_B0939  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.63 
 
 		 496 aa  92  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4158  extracellular solute-binding protein  24.71 
 
 		 446 aa  92  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.214678  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0671  extracellular solute-binding protein  27 
 
 		 436 aa  91.3  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.687145  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2526  extracellular solute-binding protein  25.38 
 
 		 421 aa  90.9  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5738  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  29.63 
 
 		 452 aa  90.5  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.599702  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2753  extracellular solute-binding protein family 1  28.57 
 
 		 410 aa  90.5  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.501272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3399  extracellular solute-binding protein  25.51 
 
 		 440 aa  89  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0250918  normal  0.750741 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2456  extracellular solute-binding protein  27.09 
 
 		 451 aa  88.6  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.674954  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4989  extracellular solute-binding protein family 1  31.38 
 
 		 436 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.192631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1262  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 		 424 aa  88.2  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00529057  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  25.81 
 
 		 411 aa  88.2  3e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  27.38 
 
 		 437 aa  87  6e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0235  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  27.13 
 
 		 439 aa  86.7  7e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61248  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3592  extracellular solute-binding protein  25.13 
 
 		 439 aa  86.7  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4775  extracellular solute-binding protein  25.13 
 
 		 439 aa  86.7  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2426  extracellular solute-binding protein family 1  27.99 
 
 		 441 aa  86.3  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.741734 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1420  extracellular solute-binding protein  30.85 
 
 		 478 aa  86.3  8e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.30312  normal  0.358597 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0228  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  27.13 
 
 		 439 aa  86.7  8e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5508  extracellular solute-binding protein  25.13 
 
 		 412 aa  86.3  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0397  extracellular solute-binding protein family 1  26.01 
 
 		 522 aa  86.3  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5858  extracellular solute-binding protein  31.25 
 
 		 435 aa  86.3  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.437643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  24.11 
 
 		 428 aa  85.9  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3567  ABC transporter substrate binding protein (sorbitol)  27.07 
 
 		 439 aa  83.6  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2172  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  26.05 
 
 		 422 aa  83.2  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00849198  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2082  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  26.43 
 
 		 422 aa  83.2  0.000000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.890991  normal  0.0137332 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0699  extracellular solute-binding protein  26.5 
 
 		 443 aa  82.4  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0547  ABC-type sugar / sn-glycerol 3-phosphate transport protein  25.96 
 
 		 447 aa  82.4  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2280  extracellular solute-binding protein  26.43 
 
 		 422 aa  82.4  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1743  extracellular solute-binding protein family 1  27.53 
 
 		 447 aa  82.8  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1533  extracellular solute-binding protein  30.77 
 
 		 478 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.219593 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4116  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 		 447 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000719407  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2796  extracellular solute-binding protein family 1  26.81 
 
 		 468 aa  80.9  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3777  extracellular solute-binding protein  25.63 
 
 		 436 aa  80.1  0.00000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.253936  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5309  extracellular solute-binding protein family 1  27.08 
 
 		 447 aa  79.7  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.574903  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4845  extracellular solute-binding protein  25.42 
 
 		 434 aa  79.7  0.00000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.834917  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1015  extracellular solute-binding protein family 1  25.3 
 
 		 418 aa  79  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.706197  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0646  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  30.49 
 
 		 326 aa  79.3  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0353327  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3006  extracellular solute-binding protein  26.35 
 
 		 467 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  29.08 
 
 		 464 aa  78.2  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2459  extracellular solute-binding protein family 1  26.07 
 
 		 419 aa  77.8  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal  0.585846 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4812  extracellular solute-binding protein  26.09 
 
 		 438 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3164  extracellular solute-binding protein  29.29 
 
 		 467 aa  77  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.625995  hitchhiker  0.00215615 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3021  extracellular solute-binding protein  29.29 
 
 		 487 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2358  extracellular solute-binding protein  25.14 
 
 		 441 aa  76.6  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0258  extracellular solute-binding protein family 1  26.55 
 
 		 477 aa  76.6  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2925  putative maltose/mannitol ABC transporter binding protein subunit  26.21 
 
 		 436 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.732093  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  22.77 
 
 		 431 aa  75.5  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1357  extracellular solute-binding protein family 1  26.01 
 
 		 467 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000953949 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  24.94 
 
 		 419 aa  76.3  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0364  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  26.18 
 
 		 438 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2297  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 416 aa  74.7  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34420  putative binding protein component of ABC maltose/mannitol transporter  26.28 
 
 		 436 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000870468  normal  0.425479 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4090  twin-arginine translocation pathway signal  27.18 
 
 		 440 aa  74.3  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.25614 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  25.09 
 
 		 439 aa  74.3  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0091  ABC sorbitol/mannitol transporter, periplasmic binding protein  26.22 
 
 		 436 aa  73.9  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.126585  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1213  extracellular solute-binding protein  23.26 
 
 		 497 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5939  extracellular solute-binding protein family 1  30.57 
 
 		 610 aa  73.9  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1727  extracellular solute-binding protein  26.22 
 
 		 436 aa  73.9  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1711  extracellular solute-binding protein family 1  25.77 
 
 		 450 aa  73.6  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.827618 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3144  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  27.41 
 
 		 460 aa  73.6  0.000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 455 aa  73.6  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2051  extracellular solute-binding protein family 1  25.44 
 
 		 536 aa  73.2  0.000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>