More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6164 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C6164  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  100 
 
 		 616 aa  1237    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4932  phage integrase family protein  55.38 
 
 		 618 aa  632  1e-180  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.356622 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6892  phage integrase family protein  39.87 
 
 		 618 aa  343  5e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4952  integrase family protein  33.82 
 
 		 577 aa  209  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5448  integrase family protein  33.66 
 
 		 577 aa  207  5e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6112  integrase family protein  33.84 
 
 		 630 aa  188  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6086  tyrosine-based site-specific recombinase  31.41 
 
 		 716 aa  177  4e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0503413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6262  integrase family protein  31.79 
 
 		 770 aa  167  5e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.755623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6926  integrase family protein  34.05 
 
 		 580 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5172  integrase family protein  30.21 
 
 		 704 aa  164  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.301594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1507  integrase family protein  30.21 
 
 		 704 aa  164  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.879594  normal  0.107383 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5040  phage integrase  29.95 
 
 		 732 aa  163  9e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.346055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4983  Phage integrase  32.61 
 
 		 588 aa  158  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5516  phage integrase  29.78 
 
 		 734 aa  154  4e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0248661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1227  phage integrase  31.42 
 
 		 507 aa  153  8e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6605  phage integrase family protein  31.6 
 
 		 559 aa  153  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0412955 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2103  phage integrase family protein  41.6 
 
 		 559 aa  148  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7324  integrase family protein  33.41 
 
 		 421 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0511421 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4251  phage integrase family protein  27.82 
 
 		 624 aa  148  4.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6864  phage integrase family protein  38.78 
 
 		 563 aa  146  9e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.728791  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1882  phage integrase family protein  30.22 
 
 		 566 aa  144  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.496854  normal  0.778139 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6948  Phage integrase  31.69 
 
 		 578 aa  144  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00529901  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4514  Tyrosine-based site-specific recombinase  31.61 
 
 		 559 aa  142  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197712  normal  0.108767 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5076  integrase family protein  29.35 
 
 		 733 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.821689  normal  0.0349063 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6456  phage integrase  30.2 
 
 		 563 aa  140  7e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1337  phage integrase family protein  29.95 
 
 		 565 aa  138  3.0000000000000003e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515892  normal  0.256556 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4706  integrase family protein  41 
 
 		 563 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5529  phage integrase  30.3 
 
 		 557 aa  137  7.000000000000001e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.95616 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1438  phage integrase  30.27 
 
 		 578 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6390  phage integrase family protein  30.27 
 
 		 578 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.82741  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01673  putative integrase/recombinase protein  31.05 
 
 		 566 aa  136  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1746  integrase family protein  29.9 
 
 		 442 aa  136  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.526139 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1051  phage integrase family protein  38.27 
 
 		 565 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.930281  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0376  phage integrase family protein  38.27 
 
 		 565 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.128426  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1208  phage integrase family protein  38.27 
 
 		 565 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0038  phage integrase family protein  38.27 
 
 		 565 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6577  integrase family protein  29.74 
 
 		 710 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00328143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2034  integrase family protein  31.27 
 
 		 422 aa  134  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  hitchhiker  0.0000000170998 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5291  phage integrase  35.74 
 
 		 565 aa  133  9e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4691  phage integrase family protein  27.47 
 
 		 609 aa  133  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.298565  normal  0.0454355 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4473  phage integrase family protein  28.88 
 
 		 609 aa  133  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00130209  decreased coverage  4.4515899999999994e-20 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5389  integrase family protein  37.55 
 
 		 575 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.028287  normal  0.0149159 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5567  phage integrase family protein  35.74 
 
 		 565 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1886  phage integrase family protein  30.89 
 
 		 417 aa  124  4e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.455882 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7054  integrase family protein  35.74 
 
 		 578 aa  124  6e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5705  phage integrase family protein  35.83 
 
 		 578 aa  123  9e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.782513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1886  phage integrase  30.47 
 
 		 397 aa  122  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.031072  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6458  integrase family protein  36.29 
 
 		 580 aa  121  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.446342 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1740  integrase family protein  37.39 
 
 		 559 aa  120  9e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.407368 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4162  integrase family protein  31.51 
 
 		 428 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.424445 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2135  integrase family protein  30.12 
 
 		 394 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.182439  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0076  hypothetical protein  28.97 
 
 		 797 aa  118  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.701551  hitchhiker  0.00833618 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1405  Phage integrase  30.5 
 
 		 420 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4613  integrase domain-containing protein  38.16 
 
 		 222 aa  117  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.754834 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3895  phage integrase  31.08 
 
 		 398 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.211604  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5830  integrase family protein  30.86 
 
 		 398 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00308669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4473  phage integrase family protein  31.08 
 
 		 398 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0169641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1825  integrase family protein  36.63 
 
 		 566 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0271537 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1625  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  38.67 
 
 		 411 aa  106  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5821  tyrosine-based site-specific recombinase XerD  27.5 
 
 		 526 aa  106  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4445  integrase family protein  30.43 
 
 		 397 aa  103  6e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0199847  normal  0.157682 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4335  integrase family protein  30.43 
 
 		 397 aa  103  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199412 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5048  integrase family protein  30.43 
 
 		 397 aa  103  6e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.414068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1733  integrase family protein  30.43 
 
 		 397 aa  103  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.461971 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5789  integrase family protein  29.93 
 
 		 399 aa  101  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2777  integrase family protein  27.35 
 
 		 420 aa  100  7e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0260202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4175  phage integrase family protein  28.74 
 
 		 436 aa  99  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5345  putative integrase/recombinase protein  25.65 
 
 		 527 aa  85.1  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5548  phage integrase  27.7 
 
 		 527 aa  79  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174978  normal  0.321363 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5988  tyrosine-based site-specific recombinase BimA  28.38 
 
 		 495 aa  72  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.239926  normal  0.0876373 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5664  integrase family protein  26.47 
 
 		 490 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.375823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0092  putative integrase family protein  25 
 
 		 376 aa  67.8  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.967916  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7315  integrase family protein  26.58 
 
 		 508 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968074  normal  0.0692077 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6193  phage integrase-like SAM-like  26.51 
 
 		 495 aa  65.9  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126905  hitchhiker  0.000249234 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1934  phage integrase family protein  27.53 
 
 		 297 aa  64.7  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5732  integrase family protein  36.36 
 
 		 274 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.176482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  24.93 
 
 		 305 aa  62.4  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  44.83 
 
 		 290 aa  61.2  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  22.87 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1855  phage integrase  23.41 
 
 		 440 aa  59.7  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3331  tyrosine recombinase XerD  27.5 
 
 		 300 aa  59.3  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  24 
 
 		 300 aa  58.5  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3228  tyrosine recombinase XerD  27.14 
 
 		 300 aa  58.5  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.302685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1457  tyrosine recombinase XerD  25.41 
 
 		 292 aa  58.5  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0432704  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  28 
 
 		 298 aa  58.2  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0124  phage integrase family protein  25.17 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.776243  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2007  phage integrase family protein  22.45 
 
 		 435 aa  57.8  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000769024  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1185  tyrosine recombinase XerD  54.9 
 
 		 315 aa  57  0.0000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7607  phage integrase family protein  32.85 
 
 		 248 aa  56.6  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.484677  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1829  hypothetical protein  23.16 
 
 		 408 aa  56.6  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  42.37 
 
 		 282 aa  56.2  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0582  integrase family protein  24.49 
 
 		 330 aa  56.2  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.132855 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19920  tyrosine recombinase XerD  26.98 
 
 		 317 aa  55.5  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1028  tyrosine recombinase XerD subunit  26.42 
 
 		 313 aa  55.1  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00856798  unclonable  0.00000000634873 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0795  tyrosine recombinase XerD  26.43 
 
 		 300 aa  55.5  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0040  phage integrase family protein  25 
 
 		 417 aa  55.1  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2082  phage integrase family protein  21.56 
 
 		 415 aa  55.1  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.267765  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1832  hypothetical protein  22.34 
 
 		 408 aa  55.1  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1201  site-specific tyrosine recombinase XerD  55.32 
 
 		 321 aa  55.1  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731595  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0002  phage integrase family site specific recombinase  23.61 
 
 		 406 aa  55.1  0.000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.952684  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>