More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1762 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1762  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 324 aa  639    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  75.68 
 
 		 291 aa  428  1e-119  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  35.56 
 
 		 449 aa  160  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3774  UspA domain-containing protein  38.49 
 
 		 317 aa  147  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143188  normal  0.471237 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0912  UspA domain-containing protein  39.56 
 
 		 317 aa  145  8.000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0363039 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2569  UspA domain protein  35.74 
 
 		 291 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  37.01 
 
 		 306 aa  125  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2546  UspA domain protein  34.84 
 
 		 390 aa  123  4e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 297 aa  119  6e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  33.23 
 
 		 297 aa  119  9e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2567  UspA domain protein  37.79 
 
 		 325 aa  117  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2560  UspA domain protein  34.13 
 
 		 345 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  33.89 
 
 		 290 aa  105  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0612  UspA domain-containing protein  28.66 
 
 		 287 aa  105  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0640  universal stress protein  27.18 
 
 		 287 aa  104  3e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0172387  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_580  universal stress protein family  26.21 
 
 		 287 aa  103  4e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  30.72 
 
 		 320 aa  102  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0641  UspA domain-containing protein  31.46 
 
 		 314 aa  101  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1584  UspA domain protein  28.85 
 
 		 295 aa  99.8  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  31.19 
 
 		 288 aa  99.4  7e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  30.16 
 
 		 415 aa  96.7  5e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  31.41 
 
 		 305 aa  95.9  8e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4818  UspA domain protein  29.82 
 
 		 321 aa  93.6  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0832286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1083  universal stress protein family  36.11 
 
 		 145 aa  92.4  9e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1111  UspA domain-containing protein  36.81 
 
 		 145 aa  92.4  9e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  33.55 
 
 		 304 aa  91.3  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  30.38 
 
 		 307 aa  90.1  5e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_002936  DET0674  universal stress protein  28.1 
 
 		 296 aa  89.4  8e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3794  UspA domain protein  30.79 
 
 		 301 aa  89  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00697323 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  27.3 
 
 		 287 aa  87  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  37.33 
 
 		 151 aa  86.7  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  30.16 
 
 		 297 aa  86.3  6e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  30.74 
 
 		 280 aa  85.9  9e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  30.18 
 
 		 297 aa  85.5  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  28.7 
 
 		 300 aa  85.1  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  32.13 
 
 		 280 aa  84.3  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2887  UspA domain-containing protein  29.1 
 
 		 325 aa  83.2  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.92135 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  35.17 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  35.17 
 
 		 145 aa  82.8  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  29.32 
 
 		 291 aa  82.8  0.000000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  30.27 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  34.48 
 
 		 145 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 		 145 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6657  UspA domain protein  28.71 
 
 		 311 aa  80.5  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  26.75 
 
 		 288 aa  80.1  0.00000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  26.64 
 
 		 282 aa  79.7  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  34.02 
 
 		 283 aa  76.6  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  34.72 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1300  universal stress protein  38.78 
 
 		 108 aa  75.5  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.116083  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  38.36 
 
 		 180 aa  75.5  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  29.57 
 
 		 294 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0866  UspA domain protein  30.53 
 
 		 280 aa  75.9  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111703  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  29.57 
 
 		 294 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 148 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  33.33 
 
 		 151 aa  74.7  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  35.86 
 
 		 149 aa  74.3  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  33.33 
 
 		 281 aa  75.1  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  28.38 
 
 		 301 aa  74.3  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  27.78 
 
 		 286 aa  73.9  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  29.43 
 
 		 294 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  34.53 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  32.41 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  24.08 
 
 		 276 aa  72.4  0.000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0289  UspA domain protein  26.95 
 
 		 289 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3570  UspA domain protein  27.36 
 
 		 271 aa  71.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.610605 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3549  UspA domain protein  25.43 
 
 		 278 aa  71.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.270172 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  27 
 
 		 294 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2155  UspA domain-containing protein  28.1 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  35.97 
 
 		 138 aa  70.9  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  32.35 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  35.67 
 
 		 200 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1740  UspA domain protein  32.37 
 
 		 144 aa  70.5  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.253274 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2595  UspA domain protein  50 
 
 		 146 aa  70.9  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000015359  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  30.34 
 
 		 144 aa  70.9  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0184  hypothetical protein  35.71 
 
 		 166 aa  70.1  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.101223 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  36.23 
 
 		 159 aa  70.1  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1016  UspA domain-containing protein  32.43 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597353  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  26.67 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  28.91 
 
 		 283 aa  70.1  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  26.67 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  30.99 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2648  universal stress protein  27.78 
 
 		 309 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1504  hypothetical protein  35.81 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  29.45 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1454  universal stress protein  45.59 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000316755  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  38.69 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1279  hypothetical protein  42.07 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.471919 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4567  UspA domain protein  35.33 
 
 		 166 aa  69.3  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.233455  normal  0.128301 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4434  UspA domain protein  35.33 
 
 		 166 aa  69.3  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  28.48 
 
 		 157 aa  69.3  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3171  UspA domain-containing protein  26 
 
 		 291 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  35.66 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  32.64 
 
 		 150 aa  68.9  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3798  UspA domain protein  27 
 
 		 281 aa  68.9  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  32.58 
 
 		 208 aa  68.9  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  33.1 
 
 		 144 aa  68.2  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  33.1 
 
 		 156 aa  68.6  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  22.68 
 
 		 274 aa  67.8  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  34.23 
 
 		 148 aa  67.8  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2586  universal stress protein  40.23 
 
 		 141 aa  67.8  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0483395  normal  0.125899 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>