More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2880 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2880  phosphoglycolate phosphatase  100 
 
 		 246 aa  491  9.999999999999999e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.587243  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2757  phosphoglycolate phosphatase  84.49 
 
 		 243 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.411374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3122  phosphoglycolate phosphatase  82.93 
 
 		 248 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.571446  normal  0.270174 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3022  phosphoglycolate phosphatase  63.16 
 
 		 241 aa  288  5.0000000000000004e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116956  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3177  phosphoglycolate phosphatase  62.72 
 
 		 246 aa  266  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0507  phosphoglycolate phosphatase  56.56 
 
 		 254 aa  242  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263743  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2570  phosphoglycolate phosphatase  56.56 
 
 		 254 aa  242  5e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0535  phosphoglycolate phosphatase  56.56 
 
 		 254 aa  242  5e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3622  2-phosphoglycolate phosphatase  56.11 
 
 		 254 aa  239  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0464  phosphoglycolate phosphatase  54.78 
 
 		 251 aa  236  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.992467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0440  phosphoglycolate phosphatase  55.22 
 
 		 251 aa  236  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2859  phosphoglycolate phosphatase  55.31 
 
 		 256 aa  233  3e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0462  2-phosphoglycolate phosphatase  53.78 
 
 		 238 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2908  phosphoglycolate phosphatase  54.91 
 
 		 242 aa  232  5e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3495  phosphoglycolate phosphatase  54.63 
 
 		 238 aa  231  6e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0294223  hitchhiker  0.0000911523 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2697  phosphoglycolate phosphatase  55.05 
 
 		 240 aa  228  7e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3555  phosphoglycolate phosphatase  54.31 
 
 		 245 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.221388  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0939  phosphoglycolate phosphatase  54.31 
 
 		 242 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0534  phosphoglycolate phosphatase  54.31 
 
 		 242 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0250125  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1909  phosphoglycolate phosphatase  54.31 
 
 		 242 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3582  phosphoglycolate phosphatase  54.31 
 
 		 245 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0643  phosphoglycolate phosphatase  54.31 
 
 		 242 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3574  phosphoglycolate phosphatase  54.31 
 
 		 242 aa  221  8e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.952116  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0743  phosphoglycolate phosphatase  52.25 
 
 		 225 aa  218  7.999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0440  phosphoglycolate phosphatase  56.07 
 
 		 235 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.433387 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0571  phosphoglycolate phosphatase  52.49 
 
 		 242 aa  209  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0352  phosphoglycolate phosphatase  52.75 
 
 		 241 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0570615  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0363  phosphoglycolate phosphatase  52.29 
 
 		 261 aa  199  3e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3898  phosphoglycolate phosphatase  53.37 
 
 		 221 aa  199  3.9999999999999996e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.67393 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2370  phosphoglycolate phosphatase  48.18 
 
 		 227 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2229  phosphoglycolate phosphatase  46.12 
 
 		 227 aa  192  5e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3482  phosphoglycolate phosphatase  45.07 
 
 		 226 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824519  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4462  phosphoglycolate phosphatase  47.58 
 
 		 250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3611  phosphoglycolate phosphatase  45.34 
 
 		 262 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0581  putative phosphoglycolate phosphatase protein  45.25 
 
 		 233 aa  179  4e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3656  phosphoglycolate phosphatase  48.88 
 
 		 234 aa  178  9e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.755729 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  43.52 
 
 		 226 aa  174  8e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  46.01 
 
 		 229 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2110  phosphoglycolate phosphatase  39.17 
 
 		 225 aa  168  9e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.782136  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  40.95 
 
 		 227 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2111  phosphoglycolate phosphatase  39.81 
 
 		 228 aa  163  2.0000000000000002e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  46.92 
 
 		 223 aa  159  4e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2847  phosphoglycolate phosphatase  42.18 
 
 		 227 aa  155  7e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.212796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3246  phosphoglycolate phosphatase  42.18 
 
 		 227 aa  155  7e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181824  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2583  phosphoglycolate phosphatase  41.04 
 
 		 227 aa  155  8e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2493  phosphoglycolate phosphatase  35.48 
 
 		 225 aa  154  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  44.09 
 
 		 224 aa  150  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2479  phosphoglycolate phosphatase  42.06 
 
 		 228 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0669626  normal  0.547058 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  39.44 
 
 		 272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0567  phosphoglycolate phosphatase  38.39 
 
 		 266 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  38.97 
 
 		 272 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  36.97 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  40.93 
 
 		 226 aa  144  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  38.74 
 
 		 229 aa  144  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0220  phosphoglycolate phosphatase  34.72 
 
 		 231 aa  144  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0265  phosphoglycolate phosphatase  35.85 
 
 		 227 aa  144  2e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  38.5 
 
 		 272 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  38.86 
 
 		 272 aa  142  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  38.39 
 
 		 272 aa  142  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2124  phosphoglycolate phosphatase  39.6 
 
 		 230 aa  142  5e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  37.44 
 
 		 272 aa  142  7e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  34.27 
 
 		 225 aa  142  7e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0057  phosphoglycolate phosphatase  35.43 
 
 		 232 aa  141  9.999999999999999e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.049028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5119  phosphoglycolate phosphatase  36.97 
 
 		 272 aa  140  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  37.33 
 
 		 226 aa  138  7.999999999999999e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2446  phosphoglycolate phosphatase  38.6 
 
 		 225 aa  138  8.999999999999999e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  37.91 
 
 		 272 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1410  phosphoglycolate phosphatase  34.26 
 
 		 225 aa  135  8e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1985  phosphoglycolate phosphatase  36.62 
 
 		 223 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.554471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0268  phosphoglycolate phosphatase  37.44 
 
 		 228 aa  133  3e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0557534  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3699  phosphoglycolate phosphatase  33.18 
 
 		 226 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46650  phosphoglycolate phosphatase  41.78 
 
 		 233 aa  130  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  32.27 
 
 		 235 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0460  phosphoglycolate phosphatase  38.21 
 
 		 229 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0934432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5953  phosphoglycolate phosphatase  39.29 
 
 		 257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0174691 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1187  phosphoglycolate phosphatase  35.91 
 
 		 218 aa  129  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00990405  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  31.82 
 
 		 225 aa  129  6e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  31.82 
 
 		 225 aa  129  6e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3691  phosphoglycolate phosphatase  33.18 
 
 		 227 aa  129  6e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002270  phosphoglycolate phosphatase  32.74 
 
 		 228 aa  128  9.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  32.21 
 
 		 235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0293  phosphoglycolate phosphatase  33.18 
 
 		 227 aa  126  3e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0254  phosphoglycolate phosphatase  32.88 
 
 		 227 aa  126  3e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4194  phosphoglycolate phosphatase  31.36 
 
 		 225 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  31.51 
 
 		 225 aa  125  5e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3887  phosphoglycolate phosphatase  32.88 
 
 		 227 aa  125  6e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.379252 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00083  phosphoglycolate phosphatase  33.64 
 
 		 228 aa  124  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0245  phosphoglycolate phosphatase  31.84 
 
 		 232 aa  124  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0261  phosphoglycolate phosphatase  34.72 
 
 		 226 aa  123  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3752  HAD family hydrolase  41 
 
 		 237 aa  123  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03140  phosphoglycolate phosphatase  40.09 
 
 		 216 aa  121  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.04 
 
 		 222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0176  phosphoglycolate phosphatase  32.09 
 
 		 224 aa  119  3e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.790253  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1058  phosphoglycolate phosphatase  35.51 
 
 		 227 aa  119  4.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.234796  normal  0.363243 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1514  phosphoglycolate phosphatase  37.73 
 
 		 243 aa  118  9e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00414525  decreased coverage  0.0000736152 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1508  phosphoglycolate phosphatase  36.87 
 
 		 228 aa  117  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.313556  normal  0.0200123 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 		 233 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  34.06 
 
 		 252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2201  phosphoglycolate phosphatase  32.39 
 
 		 226 aa  116  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  34.06 
 
 		 252 aa  115  6e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>